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吉尔吉斯斯坦的自然资源较丰富。就其总量而言，虽不及邻国哈萨克斯坦和乌兹别克斯坦，但仍具有一定的优势。该国国土资源分布为：农业用地占比55.3％，森林占比 5.1％，其他占比 39.6％。资源生态特点：自然资源和生态环境适宜于发展农牧业，耕地资源丰富，天然牧场面积大，呈现出以农牧业为主导的产业结构。畜牧业作为农业的重要组成部分，在吉尔吉斯斯坦的许多地区，畜牧生产是农村经济的支柱。另外，人们在吉尔吉斯斯坦境内共发现各类矿产地 2 000 多处，该国拥有化学元素周期表中的所有元素。目前得到工业开发的仅是部分矿产资源，许多资源的储量和分布情况有待进一步勘探研究，以确定开发前景。据有关统计，现有探明储量的优势矿产有金、钨、锡、汞、锑、铁等。国民经济支柱产业是“四金”：黄金、“白金”（棉花）、“黑金”（石油）、“蓝金”（天然气）。
吉尔吉斯斯坦地处内陆，在海拔 2 000～ 5 000 米的山区分布着草甸草原和高山、亚高山草原。山坡和谷地上生长着野生植物。北部和西部的河谷和盆地气候干旱，土壤多为钙质灰土，相当肥沃。全国适宜于农牧业的土地达 10.8平方千米。其中，牧场和天然割草场面积超 93 400 平方千米，占农牧业用地的 86％以上；耕地面积达 1.37 平方千米，仅占农牧业用地的 12.7％。大部分耕地分布于海拔 1 200～ 1 600 米的地区，几乎都需要人工灌溉，受气候条件影响较大。
吉尔吉斯斯坦具有发展生态农业的所有基础条件，大部分可耕地具有有机等级，85％的牧场、高山和山麓符合生态生产的要求。
吉尔吉斯斯坦境内河流湖泊众多，水力资源极其丰富，尤其是大量清洁水和蓄水水体资源——这是大自然对该国最重要的馈赠。吉尔吉斯斯坦拥有既能满足国内市场又能对邻国出口电能的强大能力，水能蕴藏量在独联体国家内居前三位，拥有相当可观的水能资源储备和工业潜力。其潜在水能发电能力为1 420.5 亿千瓦时，仅次于俄罗斯和塔吉克斯坦，但是目前仅开发利用了 10％左右。吉尔吉斯斯坦仅在纳隆河上的 34 个水电站中，就可以建设 8 个梯级电站。未来的梯级电站的总装机容量为 6 450 兆瓦时，多年以后的年平均发电量将超过 250 亿千瓦时。
吉尔吉斯斯坦国内主要有纳伦河、恰特卡尔河、萨雷查斯河、楚河、塔拉斯河、卡拉达里亚河、克孜勒苏河等。其中的纳伦河是亚洲著名大河锡尔河的最大支流，发源于阿克什拉克山冰川，全长 800 多千米，在吉尔吉斯斯坦境内长 535 千米。纳伦河集水区面积达 5.37 万平方千米，占全国领土面积的 27％，平均流量上游为 90 立方米／秒，下游为 429 立方米／秒。纳伦河从发源地到河口的水位落差高达 3 000 米，具有巨大发电潜能，仅纳伦河水力发电提供的电力就占吉尔吉斯斯坦全国发电量的 95％。纳伦河除了能发电还能蓄水灌溉，如托尔托古水电站的水库蓄水量就多达 200 亿立方米，可灌溉 0.4 万平方千米的土地。
吉尔吉斯斯坦的主要湖泊有伊塞克湖、松格里湖、萨雷切列克湖等（见表 1－1），多分布在海拔 2 000 米以上的地区。湖泊资源的首要价值，就是欣赏价值。湖泊的面积与形状，水面大小差异，都给人不同的感受。大水面给人以浩瀚无际之美，岸线曲折给人以幽静深远之感，水色纯净，因矿物质展现不同颜色之美。该国大多数湖泊位于崇山峻岭，是天然的高山冰川湖，湖水清澈，终年不冻，风景优美，具有极高的欣赏价值。湖泊的另一个重要价值，是为生物的重要活动创造条件。该国湖泊由于湿润的环境，适合于许多生物的生长，包括大量的湿生、水生植物，丰富的鱼类和水生微生物，形成了独特的湖泊生物圈。另外，湖泊影响内陆水循环，陆地水库对当地气候条件、湿度增加和温度波动减少有重大影响。湖泊同时广泛用于渔业、供水、矿物开采、港口废水处理、娱乐、旅游和体育。须注意的是，吉尔吉斯斯坦必须综合、合理地使用水和其他湖泊资源，考虑保护天然资源（水、土地、鱼类等）的要求。保护湖泊自然资源（特别是没有排水的湖泊）与这些湖泊的河流流域的合理利用和保护水资源密不可分。
表 1－1 吉尔吉斯斯坦主要湖泊一览
表1－1（续）
数据来源：据吉尔吉斯斯坦新观察搜集整理。
“详实网”2023 年 1 月报道，哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、乌兹别克斯坦能源部门负责人就共建“卡姆巴尔阿塔 1 号水电站”（KambarataHPP－1）达成一致意见，三国能源部长签署项目实施路线图，已开始执行吉、哈、乌三国领导人 2022 年中亚国家元首峰会上通过的决定。
卡姆巴尔阿塔 1 号水电站将成为吉尔吉斯斯坦最大的发电站，也是该国独立以来建设的最大基础设施项目，能为中亚国家提供足够的电力，并稳定该地区的供水。新水电站将位于纳伦河上游，在托克托古尔水电站上游，因此梯级水电站将节约用水量。河水流经卡姆巴尔阿塔 1 号水电站后，保留在该水电站水库中。冬季蓄水，夏季放水灌溉三国农田，并用于发电，各方都能从中获利，因此该项目将以由吉、哈、乌三方共同投资建设。据吉尔吉斯斯坦能源部长塔莱贝克·伊布拉耶夫称，该水电站的建设准备工作已开始。塔莱贝克说：“KambarataHPP－1 的建设对三个邻国（特别是吉尔吉斯斯坦）是有利的。我国应成为不进口电力的国家，相反，应出口电力。如果我们与邻国共同建设这个水电站，将消除我国严重电荒。目前，正在为建设水电站、必要的道路、桥梁、输电线、施工场地进行准备。”建成后，该水电站发电量为 1 860 兆瓦，年发电量为 55 亿千瓦时。同时，托克托古尔水电站装机容量为 1 200 兆瓦，年发电量约为 40 亿千瓦时。卡姆巴尔阿塔 1 号水电站大坝高度为 275 米（托克托古尔水电站大坝高 215 米）。该项目工程量很大，成本很高，但该水电站对吉尔吉斯斯坦发展意义重大。根据三方协议，各方将在项目中拥有大致相等的份额，吉方保留 34％，哈方、乌方各获得 33％。
吉尔吉斯斯坦的石油和天然气主要分布在费尔干纳谷地，其中有 7 个石油开采区、4 个石油和天然气开采区、2 个天然气开采区、1 个石油和天然气及凝析油开采区。石油、天然气储量尚未完全探明，油页岩储量大约为 6 500 万吨。吉尔吉斯斯坦的石油资源很少，但石油开采历史非常悠久，从 1898 年就开始钻井，1903 年第一口油井开始生产。截至 2015 年年底，吉尔吉斯斯坦的石油储量为 0.05 亿吨，吉尔吉斯斯坦每年约 95％的原油需求量须依靠进口。吉尔吉斯斯坦在地质调查勘探中，通过对山间盆地进行勘探分析，发现盆地中不仅有小型油田，还有大型的天然气田。据统计，吉尔吉斯斯坦已探明的石油储量为 1.013 亿吨，天然气为 72.6 亿立方米。勘探结果表明，吉尔吉斯斯坦的石油和天然气前景还是比较乐观的。
吉尔吉斯斯坦的煤炭资源比较丰富，产于中生代坳陷边缘的侏罗纪地层中，主要分布在西部，东北部次之。其中，西部占 65％，纳伦州占 33％，伊塞克湖州占 2％。吉尔吉斯斯坦煤炭以褐煤为主，烟煤次之，还有少量无烟煤，均赋存于侏罗纪地层，其中约有一半储量可在露天开采。褐煤分布较广，主要分布在西部的南费尔干纳盆地、阿赖盆地、中部的卡瓦克盆地（或称卡夫克盆地、卡拉克切盆地）及东北部的南伊塞克—库尔盆地，共有大型煤矿 7 座，中、小型煤矿 10 座，其中以南费尔干纳盆地中的苏利乌克塔煤矿规模最大，次之的是尚未开发的苏布拉煤矿，见表 1－2。卡瓦克盆地的科克莫伊纳克、明古什、卡拉杰切煤矿有少量开采，东北部的南伊塞克—库尔盆地只有个别煤矿在开采，阿赖盆地等其他盆地中的煤层尚未开发。烟煤分布在北费尔干纳盆地、乌兹根盆地、阿克塞盆地及南伊塞克—库尔盆地，共有 7 座大型煤矿，10座中型煤矿。其中以北弗尔干纳盆地的梅利萨煤矿最大。塔什库姆尔煤矿煤质较好，但煤炭中含有较多放射性物质，燃烧后会对环境造成较大危害。
表 1－2 南费尔干纳盆地和北费尔干纳盆地的主要煤矿情况
数据来源：正点国际网站。
吉尔吉斯斯坦已探明的煤矿共有 70 处，主要分布在南费尔干纳盆地、北费尔干纳盆地、卡瓦克盆地、阿赖盆地、乌兹根盆地、阿拉布卡—恰德尔库里盆地、南伊塞克—库尔盆地、东楚河盆地和阿克塞盆地 9 个盆地中，如表 1－3所示。
表 1－3 吉尔吉斯斯坦主要含煤盆地及其主要煤田或煤矿
数据来源：正点国际网站。
在吉尔吉斯斯坦的国家矿业资源名录上，登记着约 400 处矿藏，有的已经得到勘探，有的还处于勘探阶段。黄金、稀有金属和稀土以及非矿山资源的储量具有特殊意义，其开发将增加国内生产总值和国家预算的税收收入。吉尔吉斯斯坦矿产资源的远景储量和金属矿物的预测储量，见表 1－4。
表 1－4 矿产资源的远景储量和金属矿物的预测储量
表1－4（续）
数据来源：根据吉尔吉斯斯坦驻华大使馆发布数据搜集整理。
吉尔吉斯斯坦的金矿资源以原生岩金为主，砂金矿资源有限且规模小。岩金矿几乎遍布全国，主要集中在北天山构造带及南天山构造带西南部。金矿床多属热液型单一金矿床，另有少量矽卡岩型、斑岩型和层控型等伴共生矿床，如铜—金矿床、钨—金矿床、锑—金矿床、钴—金矿床、铋—金矿床等。
吉尔吉斯斯坦的主要黄金矿区有以下 8 个：①马克马尔矿区（在贾拉拉巴德州托古兹—托罗乌斯区）；②热尔—乌伊矿区（在塔拉斯市东南 65 千米处）；③库姆托尔矿区（在伊塞克湖州热季—奥古兹区），在海拔 3 900 ～ 4 150米处，库姆托尔矿区已跻身于世界十大金矿之列；④索尔通—萨雷矿区（在纳伦州纳伦区）；⑤河左岸塔尔迪布拉克矿区（在楚河州克明区，于 1963 年开发）；⑥库兰—扎伊矿区（在楚河州克明区），海拔 2 000～ 2 200 米；⑦捷列克矿区（在贾拉拉巴德州恰特卡尔区）；⑧库鲁—捷格列克矿区（位于贾拉拉巴德州恰特卡尔区）。
吉尔吉斯斯坦自然资源、生态和技术监督部下属地质矿产与资源署于2022 年 12 月 14 日在其官网公布了吉尔吉斯斯坦政府《2023—2035 年地质和采矿业发展规划（草案）》，数据显示，吉尔吉斯斯坦黄金矿储量约为 856吨，砂金矿有 99 个，储量合计 7.364 吨；岩金矿有 59 个，储量合计 848.636吨。2022 年吉尔吉斯斯坦境内有效的探矿许可证数量为 258 个，与 2021 年相比少了 12.5％。
吉尔吉斯斯坦有 14 家矿企在以下 9 个原生岩金矿进行开采：库姆托尔（Кумтор）、马克马尔（Макмал）、索尔顿—萨里（Солтон－Сары）、杰鲁伊（Джеруй）、特雷坎（Тереккан）、伊斯坦贝迪（Иштамберды）、贾姆吉尔（Джамгыр）、卡拉卡兹克（Караказык）、塔尔迪—布拉克左岸（Талды－Булак Левобережный）。
砂金矿主要位置如下。贾拉拉巴德州：苏鲁—特格雷克（Сулу－Тегерек）、卡拉秋贝—布祖克（Каратюбе Бузук）、贝玛克（Баймак）、伊斯塔姆贝迪（Иштамберды）、昌纳赫（Чанач）。纳伦州：库姆贝尔苏（Кумбельсу）、京迪（Кынды）。楚河州：托克伊鲁（Токойлуу）、卡拉布拉克（Карабулак）。
据 2021 年年底统计，当年吉尔吉斯斯坦矿企黄金开采量为 25.116 吨，其中 66.9％来自库姆托尔金矿。库姆托尔是吉尔吉斯斯坦最大金矿，产值占该国国内生产总值的 8％左右。
吉尔吉斯斯坦的金矿原先只由本国和俄罗斯矿企经营，20 世纪 90 年代加拿大库姆托尔金矿公司进入该国。近年来，由于吉尔吉斯斯坦立法保护外国投资、投资环境相对宽松、现行政策鼓励外国投资者参与其矿产资源勘探开发，在“走出去”战略的指引下，外国的许多矿业公司对该领域的投资热情日益高涨。吉尔吉斯斯坦的金矿开采企业主要有：加拿大的库姆托尔金矿公司（开发库姆托尔金矿）、中国的富金矿业公司（开发伊什塔姆别尔德金矿）；哈萨克斯坦的哈萨克米斯吉尔吉斯斯坦金矿公司（开发博济姆恰克金、铜矿）；中国紫金矿业公司。
其中库姆托尔金矿公司（Kumtor Gold Company）简介如下：1994—2004年由加拿大卡梅克集团（Cameco Corp.）依照产品分成协议开发，金矿公司免交各类税费，但开采出来的黄金 2 ／3 归吉尔吉斯斯坦政府，1 ／3 归卡梅克公司。2004 年后转由卡梅克集团和吉尔吉斯斯坦政府共同组建的合资企业森泰拉黄金公司（Centerra Gold Inc.，在加拿大注册）开发，依照股权比例分配利润。
2009 年 4 月 24 日，吉尔吉斯斯坦政府同森泰拉公司签订为期 15 年（2010—2025 年）的库姆托尔金矿开发合作协议，约定吉尔吉斯斯坦政府掌握企业的股权由 15.7％提高到 33％（新股权结构：加拿大卡梅克集团 37.8％、吉尔吉斯斯坦政府 33％、私人股东 29.2％），在董事会的席位增加到 2 人，并规定企业不得发行新股稀释股权。预计库姆托尔金矿企业每年向吉尔吉斯斯坦政府缴纳的各类税费总额约占该企业总收入的 21％以上（其中，环境污染费每年为 31 万美元、土地使用费约为 500 万美元）。
但是，加拿大森特拉黄金公司与吉尔吉斯斯坦政府间对库姆托尔金矿开发存在分歧，公司自 2012 年起就没有在勘探工作方面投入资金。该矿可采年限只有 8～ 10 年。
吉尔吉斯斯坦只有一个银矿区——库穆什塔克矿区比较有名。它位于塔拉斯山北坡。这里的银矿古代就已开始开采。矿石中含银量为 302 克／吨。估计银的储量为 6 240 吨。除了白银，人们还能从矿石中提取金、砷、铅、锑、锌、铜和硫磺等。
铁矿主要分布在塔拉斯州、纳伦州、巴特肯州、贾拉拉巴德州和楚河州。在这些地区的几十个铁矿区中，其中规模较大的矿区有以下五个：①巴拉奇奇坎矿区（在塔拉斯山脉脚下，塔拉斯市以东 30 千米处）估计铁储量为 5.353 7万吨，可进行露天开采。②热季姆矿区（在纳伦市以东 60 千米处）1956 年被发现。这里铁矿石储量为 55 亿吨，矿石中含铁量为 15.4％～ 46.3％，铁的储量大约为 17.4 亿吨。③纳迪尔矿区（在巴特肯州卡姆扎伊区）1931 年被发现。铁矿石储量为 24.23 亿吨，矿石中含铁量为 42％，铁储量为 10.19 亿吨。④加瓦矿区（在贾拉拉巴德州阿拉—布金区）估计铁矿石储量为 25.76 亿吨，矿石中的含铁量为 38.8％，铁储量为 10 亿吨。⑤下克明矿区（在楚河州克明区）铁矿石中的含铁量为 20％～ 51.8％，估计铁储量为 240 万吨。
锰矿主要分布于贾拉拉巴德州和伊塞克湖州 20 多个规模不大的矿区。其中四个矿区最有价值：①卡拉—阿尔马锰矿区在贾拉拉巴德市西北 50 千米处的苏扎区。该矿区由两个矿体组成，其中一个矿体长 300 米，锰矿石储量为48.57 万吨，含锰量为 6.0％，锰的储量为 2.91 万吨。②阿尔恰雷锰矿区在热季姆山脉北坡阿尔恰雷河右岸伊塞克湖州通区。锰矿石储量为 210 万吨，矿石中平均含锰量为 10％。③卡拉—日尔加锰矿区在贾拉拉巴德州阿克瑟伊区。锰矿石储量大约为 172.8 万吨，平均含锰量为 14.4％，锰的储量为 24.88 万吨。④托索尔锰矿区（在伊塞克湖州通区）共勘查出 10 个矿体，其中 3 个规模较大。锰矿石估计储量为 133.34 万吨，平均含锰量为 2.58％，锰的储量为 3.14万吨。矿石中除了锰还含有少量的钨。
吉尔吉斯斯坦主要铝矿区有两个：①桑迪克矿区在纳伦州朱姆加尔区。该矿区的霞石正长岩中含铝量为 1.47 亿吨。②扎尔达列克矿区在巴特肯州阿赖山脉北坡扎尔达列克河上游。在该矿区的霞石正长岩、二长岩和正长岩等矿石中含铝量为 22％，铝储量为 2.02 亿吨。
铜矿主要分布在北天山中部和东部。主要铜矿区有以下五个：①库鲁—捷格列克矿区在贾拉拉巴德州恰特卡尔区。②博兹—埃切克矿区位于恰特卡尔山脉的西南坡加瓦河右岸，铜的储量为 20.34 万吨。③塔尔迪布拉克矿区在塔拉斯州。这里铜的储量为 50 ～ 70 吨。④北方矿区在焦—阿舒山口西侧。矿石中含铜量为 0.27％，铜的储量大约为 186.33 万吨。⑤库姆别利矿区在纳伦州纳伦区。这里矿石成分复杂，除了铜还含有钨、金、铋、钼、铅、钴、镍、锌、铁、银等。1941—1955 年该矿区曾进行过开发，但铜矿的真实储量无法确定。此外，人们在吉尔吉斯阿拉套山、中天山等地也发现了规模不大的铜矿产区。
锡矿主要分布于吉尔吉斯阿拉套山西部。主要锡矿区有以下四个：①“劳动”矿区在伊塞克湖州阿克苏伊区。矿石中平均含锡量为 0.64％，估计锡储量为 14.913 5 万吨。②乌奇—科什孔矿区在伊塞克湖州热季奥古兹区。矿石中平均含锡 0.54％，估计锡储量为 6.065 6 万吨。③萨雷—布拉克矿区在伊塞克湖州热季奥古兹区。矿石中平均含锡量为 0.62％，含锑量为 3.04％，含锌量为 2.75％，含铜量为 0.65％，含银量为 93 克／吨。估计锡储量为 1.000 4万吨。④阿特—扎伊洛矿区在伊塞克湖州—阿克苏伊区，锡储量为 1 338 吨。矿石中除了锡还有萤石、银和铋等。
吉尔吉斯斯坦已发现几个小型钼矿区，但目前都没经营开发。其中只有一个稀土多金属矿区——克图赛 2 号矿区的钼矿比较引人注目。这个综合型矿区位于楚河州克明区克明镇以西 43 千米处。矿石中平均含钼量为 0.012％，估计钼储量为 2 360 吨。
吉尔吉斯斯坦境内已发现 20 多个大小锑矿区。同时，还有将近 100 个综合矿区（锑、汞、金等多金属矿区）蕴藏着锑矿。主要锑矿区有以下七个：①卡达姆扎伊矿区在巴特肯州巴特肯区。该矿区矿石中平均含锑 3.38％。锑的储量为 10.481 1 万吨。1934 年，该矿区就建立了卡达姆扎伊锑矿冶炼厂并开始工作。1958 年，在布鲁塞尔国际博览会上，该厂生产出的锑荣获大金质奖章。就金属纯度而言，这种锑已达到国际标准，畅销世界上许多国家。②捷列克矿区在贾拉拉巴德州恰特卡尔区。这里的矿石含锑量为 1.69％～ 7.66％（含金量为 3.7～ 6.4 克／吨，含银量为 2.1 ～ 9.6 克／吨）。该矿区锑的估计储量为3.080 2 万吨（金的储量为 7.6 吨）。③阿克塔什北部矿区（在卡达姆扎伊矿区东北 6 千米处）。这里矿石中锑的平均含量为 0.54％，锑储量为 35 719 吨。④卡桑赛矿区（在贾拉拉巴德州恰特卡尔区卡桑赛河左岸）。这里矿石中锑的含量为 3.6％，锑的估计储量为 3.908 7 万吨。⑤阿布希尔赛矿区（在奥什州诺奥卡特区阿布希尔赛河上游）。矿石中锑的含量为 4.17％，锑的估计储量为1.411 4 万吨。⑥萨巴扎尔迪矿区（在奥什州卡拉库利任区）。这里矿石中平均含锑量为 4.55％（含金 6.5 克／吨，含银 41.6 克／吨），锑的储量大约为3.809 0 万吨（金的储量为 8 吨）。此矿区颇有发展前途。⑦恰阿拉特矿区（在贾拉拉巴德州恰特卡尔区）。这里矿石中平均含锑 1.7％（含金 3 克／吨）。该矿区锑储量大约为 9.319 0 万吨（金储量 7.7 吨）。该矿区也很有发展前途。
主要锑矿开发公司为卡达姆扎锑联体。该企业位于吉南部巴特肯州，于1936 年投产，是独联体地区的大型企业。除开采卡达姆扎矿和捷列克赛矿以外，该企业的原料主要来自俄罗斯远东地区、哈萨克斯坦和塔吉克斯坦，产品主要销往俄罗斯，少部分销往欧洲。该企业 1990 年的产量高达 1.760 8 万吨，于中国和玻利维亚之后居世界第三位。苏联解体后，企业实际产量下降，至今未能恢复到苏联解体前水平。2012 年年初，集团工作人员仅剩下约 500 人（原有约 5 000 人），生产基本停止。
吉尔吉斯斯坦的汞矿开采始于公元 8—9 世纪，现代汞矿的开采则始于1940 年。人们已发现几百个汞矿区，但其中只有 7～ 9 个汞矿区具有实际价值。绝大多数汞矿区分布在南费尔干纳汞—锑矿产带。主要汞矿区包括以下七个：①琼科伊矿区（在奥什州诺奥卡特区，1950 年开工投产）。该矿区的矿石中平均含汞量为 0.274％，汞的估计储量为 2.441 9 万吨。②艾达尔肯矿区（在巴特肯州卡达姆扎伊区，于 1926 年开工投产）。该矿区矿石中汞的平均含量为0.165％，汞的估计储量为 2.093 6 万吨。③恰乌瓦伊矿区（在巴特肯州卡达姆扎伊区恰乌瓦伊河谷地，1914 年开工投产）。这里矿石中汞的平均含量为0.279％，估计汞储量为 875 吨。该矿区还有储量可观的锑。④库尔达马矿区（在奥什州阿赖区）。这里矿石中汞的平均含量为 0.09％，估计汞储量为 531吨。⑤扎尔达布卡矿区（在奥什州卡拉库利任区，于 1970 年开工投产）。这里矿石中汞的平均含量为 0.58％，汞的储量为 1 213 吨。⑥瑟马普矿区（在巴特肯州巴特肯区阿尔滕—别希克山，于 1927 年被发现）。该矿区 1942—1952 年和 1954—1972 年曾两度被开采，现在剩下的汞储量大约 545 吨。⑦比尔克苏伊矿区（在巴特肯州莱列克区比尔克苏河源头处，于 1933 年开工投产）。该矿区在中世纪初和 1942—1951 年曾进行过开采，现在剩下的汞储量约有 167 吨。此外，具有实际价值的汞矿区还有阿雷什（在巴特肯州卡达姆扎伊区）和阿拉万（在奥什州诺奥卡特区）等矿区。
主要汞矿开发公司为海达尔坎汞联合体。该企业建于 1940 年，是中亚地区唯一一家生产汞的企业，苏联解体前的 1990 年产汞 1 000 吨，苏联解体后产量大幅下降，1995 年只有 186 吨。1995 年曾借助世界银行资金进行了技术升级改造，但由于当时能源价格上涨，生产成本并未下降很多，1996 年因世界市场上汞价格下跌而破产重组，2002 年后改组为国有股份公司，吉尔吉斯斯坦政府握有其 95％股份。
该企业还加工汞和萤石，汞产品主要外销到美国、荷兰、俄罗斯、哈萨克斯坦、中国和印度，萤石主要销往独联体国家，如哈萨克斯坦、塔吉克斯坦、乌兹别克斯坦和俄罗斯。
在吉尔吉斯斯坦，砷是金、锡、钨、锑和汞等多金属矿石中的混入物。与此同时，吉尔吉斯斯坦也发现了一个砷矿区（乌奇—埃姆切克矿区）和三个砷矿产地。乌奇—埃姆切克矿区位于塔拉斯州巴卡伊—阿塔区（于 1926 年开工投产）。在这里的矿石中，砷的平均含量为 8.28％，砷的估计储量为 8.22万吨。
吉尔吉斯斯坦的主要铀矿区有以下三个：①科克—莫伊诺克矿区（在伊塞克湖州吉尔吉斯阿拉套山东麓）。这里矿石中铀的平均含量为 0.01％～0.18％。按铀的平均含量为 0.06％来计算，铀的可采储量为 1 473 吨。②卡普奇加伊矿区（在伊塞克湖州昆格山脉西坡）。这里矿石中铀的平均含量为0.054％。③铀—钍矿区（在巴特肯州巴特肯区）。根据相关化学分析资料，矿脉中铀的平均含量为 0.25％。
位于楚河州的克明区的卡列赛矿区有铍矿。这里的矿石中，铍的平均含量为 0.127％，铍的储量为 1.170 1 万吨。此外，塔拉斯州还有几个规模不大的铍矿区。
在吉尔吉斯斯坦，有价值的铋矿区包括以下两个：①米罗诺夫矿区（在楚河州克明区）。这里矿石中铋的平均含量为 0.254％，铋的可采储量为 1 162吨。②乌奇—科什孔矿区（在伊塞克湖州热季奥古兹区）。这里的矿石平均含铋量为 0.01％（含锡量为 0.54％），铋的估计储量为 949 吨。
稀土金属是指镧、铈、镨、钕等 17 种金属。吉尔吉斯斯坦的稀土金属主要分布在楚河州克明区克图赛 2 号矿区、阿克—秋兹矿场、塔拉斯州塔拉斯区以及卡斯捷克山脉等地区。
吉尔吉斯斯坦拥有丰富的非金属矿产。这些非金属矿产根据其形成过程、工艺性能和应用领域被划分为建筑材料、采矿业原料、化学原料和宝石原料等类别。其中，在建筑砌面石料方面，人们就发现了诸如石膏、花岗岩、白云岩、大理石、石灰石、石灰贝壳灰岩和角页岩等矿产。科学工作者曾在其中11 个矿区进行地质勘探工作，发现上述建筑砌面石料的可采总储量达 8 560 万立方米。其中石膏更是遍布全国各地。大部分石膏矿集中于奥什州和贾拉拉巴德州，总储量为 2 848.3 万吨。瓷石是重要的采矿业原料之一，其主要产区贾拉拉巴德州乌奇库尔特矿区的瓷石可采储量为 967.9 万吨。
吉尔吉斯斯坦有 500 多种脊椎动物，其中，有 50 多种鱼、25 种以上爬行动物、335 种鸟类、4 种两栖动物和 86 种哺乳动物，无脊椎动物的种类尚未调查清楚。根据统计资料，在吉尔吉斯斯坦大约有 4 000 种昆虫以及蜱螨等节肢动物。金雕、苍鹰和游隼是吉尔吉斯斯坦人特别喜爱用以捕猎的猛兽。常见的野生动物有狼、獾、鼷、山羊、野兔、野猪、砂土鼠、黄鼠、狷鼠和跳鼠等。雪豹、红狐、巨蜥、水獭、虎、鼬、猞猁、棕熊和马鹿等属于珍贵的稀有动物。植物资源丰富多样，在吉尔吉斯斯坦境内有 115 科、855 属、3 786 种植物。这些植物的名字已载入《吉尔吉斯共和国植物志》——11 卷本的植物鉴定册中。这些植物有大灌木 260 种、小灌木 115 种、林木 143 种。吉尔吉斯斯坦的森林面积占全国总面积的 5.3％。云杉、冷杉、柏树、槭树、柳树、白杨树和白桦树等树木较为常见。其中，云杉林面积为 1 040 平方千米。面积较大的还有冷杉林、槭树林、柏树林和核桃林。果树有苹果树、梨树、李树、醋栗树和樱桃树等。吉尔吉斯斯坦还生长有各种饲用植物、药用植物、挥发油料植物以及含杀虫毒质、含橡胶和含生物碱的植物。此外，植物中草类占有绝对大的比重。全国草类有 3 175 种，其中，多年生草有 2 270 种，一至二年生草有860 种。