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第一轮专家调查发现：“兰州会议”之后，高等理科教育对社会发展的作用可以归纳为四个方面的作用，分别是：①高等理科本科教育在高等教育人才培养体系中的基础作用更加突出；②促进了工科、人文学科、社会科学等其他学科的发展；③促进了科学研究成果转化为生产力的进程、培养了国家急需的应用型人才；④提升了我国公民的整体科学素质。第二轮专家调查显示：70%~80%的专家赞同以上四个方面的作用；不同专业学科、不同行政职务的专家态度存在显著差异，其他群体间的差异不显著。
就“高等理科的地位和作用”问题，在第一轮调查中，专家意见的分歧主要表现在“理论地位作用”和“实际地位作用”的差别上。第二轮专家调查发现：无论是理论上（79%的专家认同）还是实际上（52%的专家认同），高等理科教育的作用和地位都变得更加重要。但是，从上述比例也可以看出：高等理科对社会发展的理论地位和作用与实际地位和作用还是存在较大的差异。
同时，专家们也指出了高等理科教育面临的一个严峻的核心问题：高等理科教育过于强调对社会经济发展的适应性，原始创新不足。第二轮调查显示：83%的专家同意该观点。群体间的差异主要来自专业的不同。
第一轮专家调查显示：高等理科资源配置的问题目前主要集中在“不同高校之间的经费投入不均衡”“经费分配到教学环节的比例过低”“国家对高等理科的经费投入增长缓慢，总量仍然不足”“经费使用和管理制度存在诸多弊端，导致使用效益低下”“实验教学设施和条件严重不足”“应该加强对不发达地区的理科建设投入”等六个方面。在第二轮调查中，对“不同高校之间的经费投入不均衡”“经费分配到教学环节比例过低”认同的比例约为90%;80%的专家同意“国家对理科经费投入增长缓慢，总量不足”“经费使用和管理制度存在诸多弊端，导致使用效益低下”;65%的专家认为“应加强对不发达地区的理科建设投入”“实验教学设施条件严重不足”。
调查显示，师资队伍建设主要存在三个方面的问题：教师队伍存在结构性问题，教师教学激励机制不足，教师培训和发展不足。其中，教师队伍缺口的突出问题是：“具有实践教学经验的师资不足”“新办院校中师资不足”“助教、实验教学等教辅人员比例过低”“具备行业经验的教师缺乏”。在第二轮调查中，专家对以上问题的认同比例均达81%以上。60%的专家对“基础理科课程师资匮乏”持非常同意或同意观点。
83%的专家认为：“教师重科研轻教学。”质性研究的数据分析发现：教师激励面临的最主要的挑战就是“科研指挥棒”的作用，国家和学校各个层面对教学的激励严重不足。国家级的精品课程、精品教材等教学成果奖等方面的立项，无论覆盖面、投入力度、频率，还是激励效果，都远远低于科研立项。教学系列职称评审在学校层面的开展力度和激励效果也不容乐观。
教师发展也是师资队伍建设面临的主要问题。81%的专家认为，理科教师的入职培训和继续教育不足。数据显示，师德师风问题并不是突出问题，仅有37%的专家认为“不良师德师风问题突出”。
在院校和专业规模问题上，专家们意见存在的主要分歧在于：所属专业全国理科本科人才规模合理性和所在高校本专业本科人才规模合理性。在“所属专业的全国人才培养规模是否合理”的问题上，42%的专家认为规模合理，41%的专家认为规模过大，仅8%的专家认为规模过小。但是，在“所在高校的理科本科培养规模是否合理”的问题上，大部分专家（65%）认为规模合理，15%的专家认为规模过大，18%的专家认为规模过小。