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明治二十六年（一八九三年）五月，清作开始了他在会阳医院的学习生活。从三城潟出来时，希佳为他做了一件棉布横格对襟和服和一条用整块布料裁成的腰带，好友秋山义次送给他一条棉布和服裤裙。
这时，在会阳医院住着以长古沼票策为首的五名学生，他们有的做渡部院长的代理，有的帮忙干一些杂务。实际上，这家医院规模也不算大，有他们五个人已经足够了，不过渡部还是把清作加了进去。而且半年以后，又有一个名叫吉田喜一郎的年轻人插了进来，他是若松附近的喜多方町人。
要说起来，渡部医生虽然爱时髦，爱摆阔，但同时他也极富进取心，爱才惜才，愿意让有才能的人进来学习，不仅有长者风范，而且不拘小节，自由豁达。但这些也是后来让野口付出代价的女性纠纷的根源。
这位名叫吉田的年轻人跟清作这种贫农家的孩子不同，他出身于中农家庭，来请求拜师当学徒是由父亲陪着一道来的。家中除给他准备衣物、零花钱外，还要以每年四麻袋大米的口粮作为条件。
渡部院长一下子就看出清作和吉田是这些学生中尤为出类拔萃的人才，所以他很快就决定让他们俩同住二楼的一个房间，让他们在学习上互相竞争。对清作来说，这是与竞争对手千载难逢的学习机会。
两人相互促进，经常学习到凌晨两三点。这时清作的一句口头禅是“人家拿破仑每天只睡三个小时”，把自己比作拿破仑也确实很像清作的个性。
虽说两人都很优秀，但与天赋较为突出的吉田相比，清作属于勤奋型。他具有一定才气自不必说，其最大的特点是有韧性。这种韧性既有一部分来自从母亲那里继承的天生的忍耐力，又有一部分来自被叫作“手槌”的屈辱。
在若松，清作跟同为医师的和崎义路和住在新横町的和田迁吉学英语，只用一年时间就掌握了《卡莱尔传》和《克莱武传》。同时，他还跟住在若松的文学士佐竹元二学德语，后来又跟三之町天主教会的三个人学了法语。当他发现渡部医院的仓库里沉睡着大量的汉语书时，他又把这些书通读了一遍。
这种如饥似渴的学习劲头，简直就像饥饿难忍的野兽在荒野里发现了食物一样。他不顾一切地汲取着知识的营养。不可否认，这段时期的刻苦学习为他后来在事业上的飞速发展奠定了基础。
但所有这些学习活动都只能在医院工作的休息时间里进行。在医院里，尽管他们两人特别优秀，但因为辈分最低，所以要干的杂事也就最多。
吉田人缘好，与学长长古沼以及根本等还适当交往，而清作则在做完自己分担的工作之后就赶紧回房间去了。学长长古沼深受上一代学长渡部思斋的宠爱，英语水平也相当高，可清作从他那里把该学的东西学会之后，就再也不去找他了。虽然他这种自私自利的做法会引起同伴们的反感，可他对此一点儿都不在乎。他不太在意别人讨厌他，至今为止这二十年里，他已经习惯了别人因为他有残疾而鄙视他的感觉。时至今日，他已经完全没有必要调整自己去迎合别人的想法了。除了有时为了利用别人而去讨好别人之外，他根本不想接近任何人。
就在这一时期，会津地区偶然流行了一阵子回归热。渡部院长从德国购进了一架能放大一千二百倍的显微镜，共花了一百二十元，按当时的价格来看，相当昂贵。渡部院长用这台显微镜检查从回归热患者身上采取的血液，将回归热病原体分离出来给大家看。
“大家听着，你们要好好看看这个东西。”
学生们都争先恐后地观看。可是这时候，清作根本不顾其他人还在等着，他一个人就整整用了别人两倍以上的时间看个没完。长古沼实在忍不住了，怒骂道：“哎，野口，你本来就是个残废，还不赶快让开！”
从此，清作与长古沼的关系就更加紧张了。
明治二十七年（一八九四年），随着中日甲午战争的爆发，已经当选为国会众议院议员的渡部鼎作为三等军医应征入伍。
渡部为了精简医院人员，临走前只留下了清作、长古沼等人，其他学生都被打发回家了。借此机会，吉田转入若松名医斋藤幸源的门下。等到一切准备就绪，马上就要出发时，渡部召集所有留下来的学生以及工作人员，宣布他走后，医院的所有业务以及包括会计在内的所有工作全都由清作负责。
这时，清作虽已经由学生上升了一级，当了药局主管，但毕竟是刚满十九岁的小辈人。这一安排让具有学长资格的长古沼等人深感不快。可因为这是院长的决定，他们又不能反对，所以当渡部从会津出发时，医院内部就已经埋下了不满与内讧的种子。
会阳医院本来就存在着本家与医院两大势力的争斗，一遇到问题，双方就闹得不可开交。本家指的是以渡部院长的正房妻子为中心的一派，而医院指的是以院长的爱妾为中心的一派。现在再加上长古沼等老牌学生们的加入，局面变得越来越复杂。做学问另当别论，对处理人际关系的微妙之处不甚了了的清作只是单纯地认为拥护正房夫人才合乎逻辑，因而在立场上自然站到了本家一方。但是，这种做法很快就招致医院一方以及长古沼他们的反抗，由于意见无法统一，所以形成了误解与中伤满天飞的混乱局面。
面对这些矛盾，刚开始的时候，清作还比较积极地进行调停，但由于偏见以及女人们的嫉妒心理都搅和在一起，事态变得越发复杂了。对此深感厌倦的清作为了逃避这些琐事的纠缠，干脆跑到教会或佐竹家去学外语，但只能躲避一时，一回到医院，他马上又被拖入明争暗斗的旋涡当中。
清作实在无法忍受，于是他给恩师小林荣写信，陈述自己想辞去留守负责人职位的想法，但小林荣对此表示强烈反对。他反对的理由是，虽说工作有困难，但应该想到渡部先生提拔重用的恩情，要尽自己的最大努力去完成工作。
在他的鼓励下，清作再次振作起来。不管争斗如何激烈，自己还是要尽最大努力把工作做下去。虽说这是一些很无聊的凡间俗事，但是通过这一年的锻炼，一心做学问的清作也了解到了人际关系的复杂性，对他来说，这是一段很宝贵的人生经历。