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巨大的帆船完成了。用植物叶子制作的船帆也安装好了，一艘雄伟的船矗立在海面上。猴子们用亲手做的绳子将船拴在陆地上，为航海做准备。它们还参考百科全书上面的记述，制作了果干和鱼干等不容易腐烂的食物，并运送到了船内。
造船花费了大量的时间，不过在此期间，猴子们从百科全书上学习到了各种各样的知识。詹姆斯·博斯坦恩不经意间发现猴子们开始使用铁器了，它们成功地炼制出了铁。它们将河道引到山脊一侧，从下游的堆积物中获取砂铁，再利用土砂和砂铁的密度差异将之分离，通过加热砂铁得到铁块。它们似乎也掌握了燃烧反应，从前对火的恐惧几乎消失了。即使他不在，它们也能够使用火。
百科全书的复刻本在一个风和日丽的好天气里完成了。海浪比以往冲得更高，发出低吼。在詹姆斯·博斯坦恩居住的小屋里，负责抄写百科全书的猴子完成了最后一页。复刻本完成的消息传遍了小屋周围，欢呼声响起，猴群骚动起来。这座岛上产的纸厚实、表面粗糙，因此复刻本的厚度是百科全书的几十倍。猴子们开始分装，用绳子将复刻本分装成册。就在这时，一股焦味顺着风飘荡在空气中。
“发生了什么事？”
詹姆斯·博斯坦恩走出小屋一看，只见森林里着火了，透过树丛的间隙可以看到火焰发出的橙色火光，有什么东西被烧成了灰。猴群中出现了混乱。火灾，火的使用不当？詹姆斯·博斯坦恩的耳畔有什么东西高速驶过。他身后不远处有一只猴子胸口嘭地被什么东西刺中了，它的衣服和毛发被血染红，倒下后一动不动了。
森林中传来了嘶吼声，同时冲出一群猴子，它们用枪和弓箭做好了武装。手持枪的猴子刺中了身边的猴子，后者随即吐血倒地。
詹姆斯·博斯坦恩被眼前突如其来的暴行惊呆了。这座岛上莫非住着一群敌对势力？它们攻过来了吗？不，它们是因为违反规则而被流放到不毛之地的猴子——詹姆斯·博斯坦恩终于明白了，他对它们的表情感到震惊——那充满憎恶的表情令它们比起猴子更像人类。
它们不知怎的拿到了詹姆斯·博斯坦恩撕下并藏起来的书页，阅读了关于武器的记述后，制作了弓箭和枪——抑或是它们自己发明的——企图伤害曾经赶走自己的猴群。
飞来的箭射穿了这群猴子，又接连射穿了赶来营救的猴子们。这里太危险了，詹姆斯·博斯坦恩大喊道：“快跑！留在岛上会被杀掉！上船！”
詹姆斯·博斯坦恩在沙滩上奔跑，跳入大海，逆流而泳。他一边营救抱着幼崽的猴妈妈，一边靠近停泊在海边的帆船。他沿着船体上的梯子向上攀登，终于抵达了甲板。
森林的火在风的作用下越来越大，那一定是武装者点燃的！树木燃烧，黑烟腾空，高台上的小屋也在燃烧，百科全书、复刻本一定也被火舌包围了。
从攻击中逃出来的猴子们追随着詹姆斯·博斯坦恩从海中游来，途中有中箭身亡的猴子，也有因不会游泳而沉入海里的猴子。詹姆斯·博斯坦恩在甲板上等待游来的猴子们，然后解开绳索，扬起船帆。
武装者们似乎没有来追船，它们从海边放了箭。箭没能击中船体，而是落在了海里。它们目送着帆船出航，岛很快就从视野里消失了。
航行十分顺利。因为船上只储存了一人份的食物，所以詹姆斯·博斯坦恩多次少量地分给了猴子们。不久后，猴子们取下一张帆，制作成渔网用来捕鱼。詹姆斯·博斯坦恩和猴子们一起对着生鱼大快朵颐。猴子们施展强大的体能，在桅杆之间跳跃，很快就学会了通过转动船帆和“之”字航行，让船逆风行驶。
航行中遇到了各种各样的光景：鲸鱼在清澈安静的夕阳下歌唱；飞鱼高高地冲上天空，又消失在云间；雾里出现的岛屿原来是一只巨型海龟的壳……詹姆斯·博斯坦恩和猴子们聚集在甲板上，分享着这些惊喜。
然而，航程很快迎来了终点。那是一个可怕的暴风雨之夜，前一刻船被海浪高高举起，后一刻就滑落到深渊中。甲板上的詹姆斯·博斯坦恩为了不被甩出去而抓住桅杆，可桅杆却不可思议地从根部折断了。他和桅杆一起被甩入了大海。他想求救，可是喧嚣的风雨令他的声音无法传到甲板上猴子们的耳朵里。船留下他越走越远。快要到达天际的海浪冲破云层向下扑来，詹姆斯·博斯坦恩做好死的准备，闭上了眼睛。
当詹姆斯·博斯坦恩睁开眼睛时，他正躺在医院的病床上。房间里有人在踱步——不是猴子，是人。虽然是在语言不通的异国的医院里，但护士和医生都是人。外面是人们生活的街区。通过风中混杂的海潮气味可知，这是一个海边小城。这里没有一只猴子，全是人。
一个会说英语的人被带来询问他事情的经过，那时他得知了自己被救的过程。据说他趴在一根折断的桅杆上被冲到了海面上，一位船员发现了他，并把他救回了船上。
他讲述自己漂流到一座无人岛，和猴子们进行了交流，可是没有人相信他。直到后来他自己都开始怀疑那不是真实的经历。
北斗星号的船长和同伴们依然下落不明，大概没有生还的可能了。回到故乡的詹姆斯·博斯坦恩从事了其他工作。他结婚生子，过着忙碌的生活。空闲时，他偶然想到，如果那不是梦，那么载着猴子们的帆船或许正在某片海域航行。没有人知道，在那片夕阳和星空下，猴子们的船如今正在何处……