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在修炼的时候，丘处机还曾在禁睡眠方面下过苦功。全真教一直以来就提倡要禁睡眠，当初王重阳督促马钰修道，曾多次移开他的床，不让他睡觉。后来的全真七子在这方面都有非凡的造诣，有的甚至能几十年不睡。王恽称：“全真家禁睡眠，向上诸人，有肋不沾席者十数年。”向上诸人就是指全真七子。
佛家在这方面同样也这样提倡，但是佛家只认为，人应该少睡，到了夜里也要精进用功，并不是完全不睡。《佛遗教经》上讲：“当念无常之火，烧诸世间，早求自度，勿睡眠也……睡蛇既出，乃可安眠，不出而眠，是无惭人也。”当初佛陀的弟子阿那律精进修道，多日不睡的时候，佛陀还曾劝他去睡。
全真教在这方面则更为严格，所以，丘处机花了很大的工夫修习禁睡眠。多年以后谈起自己的这段经历时，他曾对他的弟子们说：“初炼睡，才昏，出入行动，来来去去。初时，出入三四十遭，后习至七八遭，性子长明，不曾昏睡。俺曾计较一日十二时中，初八个时辰不教昏，后至九个十个时辰，须当不过，不敢放令自在，教昏些小，恁般过日月，自后七八日，全不合眼。”
此外，丘处机还有一首词记录了当时的情形：“秋夜沉沉，漏长睡酷多思想。须依仗，道情和畅，不纵魔军王。打叠神情，物物离心上。虚空帐，慧灯明放，坐待金鸡唱。”事实上，丘处机还曾用搬石头的方法炼过睡眠。
全真教非常痛恨睡眠，这是因为，睡多了之后，情欲便会滋生，所以，修行必须要“先减睡眠”，这样，就能“清明在躬，昏浊之气自将不生”。但是，所谓禁睡眠也并不是完全不睡，这指的是将睡眠减少到最低的程度，并且在睡眠的时候，必须不令自己昏睡，而是在睡眠之中，依旧清醒，没有杂念。
说到底，炼睡还是炼心，丘处机说：“虽炼睡，亦炼心。若不炼心，不济事。”炼睡即是去除内心的私欲邪念，时时清醒，逐渐到睡眠时亦能清醒，正如马钰所说：“守悉妙在乎全精，尤当防于睡眠。方欲寝时，令正念现前，万虑悉泯，敛身侧卧，鼻息绵绵，魂不内荡，神不外游，如是则悉精自定矣。”