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在“三医联动”大背景下，医药行业市场竞争不断加剧，营销成本与生产成本不断攀升，医药企业的利润空间受到挤压。想在这个大环境下生存，各医药企业成本控制能力就需要不断提高。成本控制作为一个成本支出在预算范围内的动态过程，其本身会受到很多因素的影响，这就需要在动态中不断地调整与优化。经过对行业的研判，不同领域药品成本波动的影响因素是不同的。
化学原料药的价格上涨因素有很多种，主要包括：一是主要原材料价格上涨和供应紧张导致成本上升；二是受国家安全环保、节能减排政策的影响，医药中间体和原料药产能受限，供给收缩导致价格上涨；三是竞争格局和厂家销售策略的不断变化。
中药材价格波动受多方面因素的影响。一是中草药成本的增加，导致以中草药为原料的中成药生产企业加工成本增加，对中成药企业的发展造成不利影响；二是中药材的质量参差不齐，一些原料生产企业为了节约成本、提高效益，会在中药材原料中掺入劣质药材，不仅威胁着消费者身体健康，也使其对中药产品丧失信心；三是中药材价格不稳定，当出现上涨情况时，企业就会恐慌性采购，间接推动了药材价格波动，使药材的生产成本逐渐提升。
数字化转型是企业生存发展的必经之路，无论是从国家对药品监管力度方面还是从市场需求角度方面来看，都在不断升级，这对药品生产质量提出了更高的要求，所以实现生产自动化和数字化是企业非常重要的发展方向。对于一些品种多、批量小、达不到规模化生产的药品生产企业来说，自动化和数字化的成本过高，企业很难承担。
实现自动化和数字化首先应该打好基础，可以尝试从大品种产品开始，逐步规范工艺标准，小范围实现自动化，通过信息化手段，获取生产环节中的各种参数，建立相应的模型，实现生产环节数据可追溯、可分析和可利用，逐步提升质量、降低成本，稳步推进整个生产体系自动化和信息化的实现。
药品上市许可人制度是指药品上市许可与生产许可分离的制度模式，药品知识产权所有者可以将产品委托给医药生产企业进行生产，并对药品的安全性、有效性和质量等方面负责。药品上市许可人制度的优势是可以使产业链分工更明晰，有利于药品研发机构和科研人员积极研发新药，有利于产业结构调整和资源优化配置，促进专业分工，提高产业集中度，避免重复投资和建设。
虽然创新药研发具有周期长、投入大、风险大、收益大等特点，但依然能得到一些创新药企业的追捧。由于一次性评价和集采，高利润时代一去不复返，但具有原料药基础和成本优势的企业仍有机会。中成药虽然研发立项难、周期长、临床评价难，但国家依然鼓励创新和应用，新适应症的二次开发将成为药企相对便捷、经济的创新方向。
影响药品生产的因素有很多，如原材料成本上升、气候环境不稳定、国家政策调整、市场竞争格局变化、信息化发展等，都在无形制约着医药生产企业的发展。很多方面的成本上升是不可逆的，因此在营销策略上，如产品推广、药品定价等方面就需要适时作出调整，保证企业的利润。