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1999年6月，审计署审计长李金华向第九届人大常委会作《关于1998年中央预算执行和其他财政审计情况》的报告，该报告被称为“多年来最好的一份审计报告”。人们用“审计风暴”来形容报告所带来的冲击波。此次审计对促进政府和部门的预算管理，维护国家正常的财经秩序，发挥了积极作用。
1999年6月2日，国务院发布《期货交易管理暂行条例》。
1999年6月11日，中共中央举办1999年第一次法制讲座，题目是《依法保障和促进农村的改革、发展与稳定》。
1999年6月13日，中共中央、国务院发布《关于深化教育改革全面推进素质教育的决定》。
1999年6月25日，国家经贸委、外经贸部发布《外商投资商业企业试点办法》。
1999年6月27日，全国证券期货监管工作会议宣布，中国证监会派出机构从1999年7月1日起正式挂牌，这标志着我国已经形成集中统一的证券监管体制。
1999年6月30日，江苏省长江流域重点污染源达标排放“聚焦长江”行动结束，提前实现了国务院确定的“全国工业污染源要在2000年年底前实现达标排放”的目标。
《经济与信息》（1999年第6期）刊发吴敬琏的《激活供给方：采用“向供给方面倾斜”的政策治理通货紧缩》。文章认为，应当把更多的注意力放到实施“向供给方面倾斜”的政策上，采取一切手段调动企业和企业家的积极性，使富有活力、蓬勃成长的企业成为经济健康发展的“发动机”，形成供给方面扩张与需求方面增加的良性循环。
《改革》（1999年第3期）刊发李佐军的《开拓农村市场必须调整改革与发展的思路》。文章提出，没有农民命运的改善、农村和农业的全面现代化，就没有中国的未来。我们的现代化应是全面、公正的现代化，不仅城市要现代化，而且农村要现代化，“社会转型”将成为中国21世纪的主要任务。改革思路的调整主要包括从“突破口”改革到整体协调改革，从国有经济的战略性改组到城乡或整个国民经济的重组，从“抓大放小”到“抓大扶小”，从个别市场和城乡分割市场到所有市场和城乡统一市场，从小城镇建设到新兴新体制城镇构造，从开发区建设到新体制城区构造，从城市偏向改革到城乡公正改革。发展思路的调整主要包括从经济增长到经济发展，从农业产量增长到农村现代化，从城市独立工业化到城乡一体工业化，从大城市化到农村人口城市化。
1999年上半年，我国国民经济增长7.6%，增长速度高于1998年同期，这与1998年国家采取的增发国债1000亿元用于基础建设等积极的财政政策密切相关。
1998年，为了应对亚洲金融危机，中央决定实施积极的财政政策，加大基础设施建设的投资。同时，增加中低收入者的收入，改善人民生活；通过出口退税增加出口等措施，政策很快收到成效，从1999年下半年起，我国外贸出口大幅度回升，国家外汇储备增加。经济增长率开始回升，由1999年的7.6%上升至2000年的8.4%。
根据国家统计局公布的数据，1999年6月，商品零售价格指数为96.6；工业生产者出厂价格指数为96.4。1999年，固定资产投资完成额累计值为6686.57亿元；原煤产量当期值为8348.7万吨，1999年累计值为47153.6万吨。
【1999年“审计风暴”】 根据《中华人民共和国宪法》规定，我国实行审计监督制度。1983年9月，中华人民共和国审计署正式成立，是国务院组成部门之一，在国务院领导下，主管全国的审计工作。当时，我国社会还处于计划经济向市场经济转型的时期，审计署的工作重点是“打假账”。1995年1月，《中华人民共和国审计法》开始实施，审计工作迈向法制化的轨道，审计署开始审计中央财政预算的执行情况。从1996年开始，审计署向全国人大常委会做审计工作报告。1999年6月，审计署审计长李金华向第九届人大常委会作《关于1998年中央预算执行和其他财政审计情况》的报告时指出，国务院43个部门挤占挪用财政资金31.24亿元，平均每个部门7200多万元。这份“触目惊心”的报告作完后，掌声四起，被称为“多年来最好的一份审计报告”。人们用“审计风暴”来形容报告所带来的冲击波。此次审计署在全面审计的基础上，重点审计了财政投入较大和关系国计民生的项目，揭露和反映了财政预算分配和资金管理使用中的各种问题，有的问题相当严重。这对促进政府和部门的预算管理、维护国家正常的财政秩序发挥了积极作用。自1999年“审计风暴”之后，审计署开始了每年一次的“审计风暴”。从2003年开始，每年度审计署提供的审计报告都按照审计法被要求全面公开。从两页纸的新闻稿到公告制度被固定下来。
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