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既有好的中性菌，也有坏的中性菌
肠道细菌可以分为三种，分别是有益菌、有害菌和中性菌。
能给我们身体带来好作用的肠道细菌叫有益菌，起坏作用的叫有害菌。这两种细菌的分类很好理解。
但是，就在近些年，这种简单的非好即坏的分类方式受到了挑战。
随着科学技术的进步， 科学家已经可以对肠道细菌进行DNA（脱氧核糖核酸）分析，结果不断发现有些肠道细菌并不适用于传统的好坏分类 。
举例来说，有些属于有害菌的肠道细菌，也可以生产一种短链脂肪酸——丁酸。
另外，对于中性菌的定义，以前认为当有益菌或有害菌的任一方取得优势时，中性菌会加入有优势的一方推波助澜。也就是说，当有益菌占优势时，中性菌会发挥好作用；而当有害菌占优势时，中性菌就会发挥坏作用。
可能大多数朋友对中性菌的理解也是这样的，认为它们就像墙头草一样。
但最新的研究成果表明， 中性菌并不是墙头草，它们到底是帮助有益菌还是帮助有害菌，从一开始就决定了，并不会见风使舵 。
医学家已经基本查明，哪些中性菌对人体有好的作用。
而且，并没有发现这些有益的中性菌会在某些时候或某些情况下做坏事。
为什么会出现这种情况？原因可能在于以前用“菌属”来对有益菌和有害菌进行分类，过于简单了。
举个例子，有一个菌属叫作梭菌属，其中的产气荚膜梭菌、肉毒梭菌，能给人体带来极大的危害。
所以，只要是梭菌属的细菌就一并被归类为有害菌。可是，梭菌属的细菌共有20种以上。
科学家发现，有某种梭菌可以抑制人体的过度免疫反应，起到保护人体的作用。也就是说，并不是梭菌属的所有细菌都会干坏事。
随着科学家继续对肠道细菌进行DNA分析，通过对它们的基因进行分类，日后一定会发现不属于现有分类的细菌品种。
只有有益菌不会因为条件的改变而对人体干坏事，它们是100%的好细菌。但是，对于传统定义的有害菌和中性菌，恐怕以后会出现新的分类或定义方式。
以前被称为有害菌的某些细菌，以后也可能被归类到有益菌的队伍中。也许中性菌这个称呼会消失，原本属于中性菌的细菌会被逐一甄别，然后依据其特性被归入有益菌或有害菌的行列 （为了便于读者理解，本书依然采取传统的细菌分类方法）。
由此可见，科学家对人体肠道细菌的研究也在日新月异地发展。