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第一节
蛋白质的分子组成

一、蛋白质的元素组成

结果表明,所有蛋白质分子都含有碳、氢、氧、氮及少量硫元素,有些蛋白质还含有其他一些微量元素如磷、铁、铜、锰、锌、碘等。各种蛋白质的含氮量十分接近,平均为16%。由于体内含氮物质以蛋白质为主,通过测定含氮量即可大致推算样本中蛋白质的含量。

100g样本中蛋白质含量(g%)=每克样本含氮克数(g)/样本×6.25×100

二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸

(一)氨基酸的结构

存在于自然界中的氨基酸(amino acid,AA)有300余种,但构成天然蛋白质的氨基酸只有20种,有相应的遗传密码的氨基酸被称为编码氨基酸(coding amino acid)或标准氨基酸(standard amino acid)。氨基酸与羧基相连的α-碳原子上连有氨基,称为α-氨基酸(脯氨酸为α-亚氨基酸)。除甘氨酸外,其余氨基酸的α-碳原子都是手性碳原子,有D、L两种构型,存在于天然蛋白质中的氨基酸均为L-α-氨基酸。

为了准确描述氨基酸的结构,需要对碳原子进行编号。依照惯例,有两套编号规则可供选用:一是将碳原子按照与羧基碳原子的距离依次编号为α、β、γ、δ等;二是用阿拉伯数字编号,羧基是主要功能基团,其碳原子为1号,其他碳原子依次为2号、3号、4号等。含杂环结构的氨基酸一般用阿拉伯数字编号,用希腊字母容易产生歧义。

(二)氨基酸的分类

氨基酸分类有助于认识氨基酸的结构、性质和作用。根据研究目的不同,可以采用不同的分类方式。如根据R基团的结构可以分为脂肪族、芳香族、杂环氨基酸;根据R基团的酸碱性可以分为酸性、碱性、中性氨基酸;根据人体内能否合成可以分为必需、非必需氨基酸;根据分解产物的进一步转化可以分为生糖、生酮、生糖兼生酮氨基酸;根据是否用于合成蛋白质(或有无遗传密码)可以分为标准(或编码)、非标准(或非编码)氨基酸。

标准氨基酸的分类是综合考虑氨基酸R基团的结构和性质,特别是其极性或在生理pH(接近中性)下的水溶性,可分为非极性疏水氨基酸、极性中性氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸四大类(表2-1)。

表2-1 标准氨基酸的名称、结构及分类

续表

三、氨基酸的理化性质

(一)两性电离与等电点

所有氨基酸都含有酸性的α-羧基和碱性的α-氨基,属于两性电解质(ampholyte)。同一氨基酸分子在不同pH值的溶液中解离方式不同,可带正、负两种性质的电荷。当处于某一pH溶液的氨基酸解离后所带的正负电荷相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点(isoelectric point,pI)。不同的氨基酸由于R侧链结构及解离程度不同,具有不同的等电点。当溶液的pH值小于等电点时,氨基酸带正电荷;当溶液的pH值大于等电点时,氨基酸带负电荷。因此溶液的pH值可以改变氨基酸的带电性质及电荷数量(图2-1)。

图2-1 氨基酸的两性电离与等电点

(二)茚三酮反应

氨基酸与茚三酮水合物发生反应生成蓝紫色化合物。该化合物最大吸收波长为570nm,在一定范围内其吸光度与氨基酸浓度呈线性关系,可用于氨基酸定性和定量分析(图2-2)。

图2-2 茚三酮反应

(三)紫外吸收

芳香族氨基酸因含苯环,具有共轭双键,可吸收一定波长的紫外线,其中酪氨酸和色氨酸的紫外吸收峰为280nm,苯丙氨酸的紫外吸收峰为260nm(图2-3),吸光度(A 280 )与氨基酸的浓度在一定范围内成正比关系。

图2-3 芳香族氨基酸的紫外吸收峰 KPQeHNu+A/2H+JVjQB93D5khoZV9qukLUfW+TtR74l3Ior27M0QUuIw42XFfqYBE

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