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董卓废立汉帝之后，又一再提升自己的官职，先后担任了太尉和相国。“封郿侯，赞拜不名，剑履上殿。”
与两汉的权臣霍光、梁冀的地位相等。汉献帝不过是个傀儡，朝政完全听从董卓摆布。如他自己所称：“天下之事，岂不在我？我欲为之，谁敢不从！”
董卓还控制了洛阳武库储备的大量兵器装备和朝廷府藏的巨额财富，权威不可一世。其本传曰：“卓既率精兵来，适值帝室大乱，得专废立，据有武库甲兵，国家珍宝，威震天下。”
但是董卓性情粗鲁，不学无术，缺乏文化素养，还不具备赵高、王莽、曹操等巨奸大猾的心机和诡诈。朝内大臣们虽然畏惧他的武力与权势，但是认为董卓没有学识和智谋，私下里对他相当轻视。如荀攸与郑太、何颙等人议论道：“董卓无道，甚于桀纣，天下皆怨之，虽资强兵，实一匹夫耳。”
就是说他只是倚仗兵权而得势，其实素质低劣，不过是个胸无点墨的粗汉。由于上述原因，董卓比较容易受人欺骗，他在朝内相当信任的两位官员，即侍中周毖、城门校尉伍琼，就成功地蒙蔽了董卓，在官吏任免方面做了许多手脚，为后来关东诸侯起兵反对董卓作了突出的贡献。计有以下内容：
其一，说服董卓停止缉拿袁绍等流亡豪杰。袁绍、袁术兄弟出身名门，又在消灭宦官集团的斗争中立下大功，在国内很有声望。袁绍出于对董卓的不满与愤恨，逃离京师而奔往冀州。“卓购求袁绍急”
，周毖和伍琼等人前来为袁绍讲情，并请求给他一个地方官职，以进行安抚。“侍中周毖、城门校尉伍琼、议郎何颙等，皆名士也，（董）卓信之，而阴为（袁）绍，乃说卓曰：‘夫废立大事，非常人所及。绍不达大体，恐惧故出奔，非有他志也。今购之急，势必为变。袁氏树恩四世，门生故吏遍于天下，若收豪杰以聚徒众，英雄因之而起，则山东非公之有也。不如赦之，拜一郡守，则绍喜于免罪，必无患矣。’”
董卓居然被他们的花言巧语所欺骗，“乃拜（袁）绍勃海太守，封邟乡侯。”
不再通缉捉拿他。勃海是个大郡，据《后汉书·郡国志二》记载，其人口有一百一十万，比京师洛阳所在的河南郡（人口一百零一万八百二十七）还要多。这样袁绍就有了安身立命之地，此后他起兵反卓，能够征用勃海郡的众多兵员和粮饷。董卓还拜袁术为后将军、曹操为骁骑校尉，但是这两个人都不愿与董卓共事，相继逃出了洛阳，后来都成为讨伐董卓的干将。
其二，提拔各地名士到朝内任职。“初，尚书武威周毖，城门校尉汝南伍琼，说董卓矫桓、灵之政，擢用天下名士以收众望，卓从之。”
董卓还把这项工作交给了周毖等人去完成，“命毖、琼与尚书郑泰、长史何颙等沙汰秽恶，显拔幽滞。”
结果，通过周毖、伍琼的引荐，“以处士荀爽为司空。其染党锢者陈纪、韩融之徒，皆为列卿。幽滞之士，多所显拔。”
于是朝内的公卿百官多由名士担任，而董卓的亲信党羽却未能够得到任用，仍然只是在军队里任职。“卓所亲爱，并不处显职，但将校而已。”
其三，外放仇视董卓的朝内官员到州郡赴任。中平六年（189）十一月，“卓信任尚书周毖、城门校尉伍琼等，用其所举韩馥、刘岱、孔伷、张咨、张邈等出宰州郡。”
其中韩馥任冀州牧，刘岱任兖州刺史，孔伷任豫州刺史，张咨任南阳太守，张邈任陈留太守，他们到任后纷纷举起讨伐董卓的义旗，董卓这才明白上了周毖、伍琼等人的大当，将他们逮捕处死。“而馥等至官，皆合兵将以讨卓。卓闻之，以为毖、琼等通情卖己，皆斩之。”
但是关东诸侯讨伐董卓的战火已然遍地燃烧，朝廷再也无力扑灭了。