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欧盟共同外交与安全政策的共同行动亦称联合行动。联合行动是指欧盟及其成员国依照共同立场或共同战略而采取的具体行动，由欧盟理事会按照特定多数原则进行决议。联合行动由欧洲理事会发号施令，理事会负责具体制定行动的日期、目标、手段、范围以及行动的期限和执行的条件。欧盟共同外交与安全政策产生后，随着欧盟自主防务建设的发展，欧盟开始在安全与防务方面在世界上采取更多的联合行动。
欧盟在其周边地区和成员国内部采取了很多次联合行动，这些行动扩大了欧盟在世界舞台上的影响力，在这些行动中，欧盟的外交政策越来越趋于整体性。
1995年12月，旨在结束波黑战争的代顿和平协议签署后，联合国安理会联合国安理会决定在波黑部署由北约领导的多国稳定部队。2004年12月，欧盟接替了北约在波黑执行维和任务的“木槿花”行动。欧盟这次活动包括了7000名士兵，分别赖在欧盟22个成员国和11个非成员国。“木槿花”行动致力于建设一个稳定的、可持续发展的、和平的、各民族和睦相处的波黑，并使波黑与其邻国一道最终加入欧盟大家庭。欧盟驻波黑维和部队的任务是：确保波黑实现安全与稳定，监督《代顿协议》的执行；支持国际社会驻波黑高级代表兼欧盟驻波黑特别代表瓦伦丁·因兹科的工作；实施当地政权委托的扫雷、管理武器储存点、低空控制等方面的大量行动。
“木槿花”行动意味着欧盟跨出了独立防务的重要一步，它是欧盟迄今所承担的规模最大的维和行动。
欧盟驻波黑警察特派团2003年1月15日成立，欧盟警察特派团由来自欧盟成员国以及加拿大、冰岛、挪威、瑞士、土耳其和乌克兰的421人组成，总部设在波黑首都萨拉热窝，主要职责是培训和监督波黑警察部队欧盟警察特派团的主要任务有支持地方警察力量打击有组织犯罪；协助并监督当地警察部队的工作；支持当地警察部队的改革进程等。
欧盟驻波黑警察特派团这次维和行动的主要目的是维护波黑重建时社会的稳定，同时帮助波黑推进法制化进程。这次联合行动是欧盟第一次在欧盟成员国以外的国家执行民事危机处理任务，在欧盟外交史上具有重要意义。
欧盟驻科索沃法治特派团是欧盟计划向科索沃部署警察、海关官员和司法专家组成的代表团，是欧盟安全与防务政策框架下规模最大的文职特派团。欧盟于2008年2月16日开始了首个为期四个月的部署进程。欧盟驻科索沃法治特派团总部设在科索沃首府普里什蒂纳，特派团由大约2000人组成，来自欧盟成员国以及克罗地亚、挪威、瑞士、土耳其、加拿大和美国。特派团第一年的预算大约为1.65亿欧元。
这次维和的重点在法律秩序问题上，还包括民主标准，明确要求在“科索沃建立国际安全存在”，同时帮助科索沃当局逐渐接管权力。
2005年，乌克兰——摩尔多瓦边界走私、人口贩卖、非法移民、过关欺诈等活动猖獗。2005年6月，摩尔多瓦和乌克兰两国总统共同致信欧盟，希望欧盟支持包括海关建设在内的两国边境地区管理能力的建设。同年11月30日起欧盟协助巡防乌克兰和摩尔多瓦两国边界地区，以打击走私、人口贩卖等跨境犯罪活动。欧盟为协助团提供800万欧元的财政支持。协助团由匈牙利军队的班菲准将指挥，协助团由16个欧盟成员国共派出69名警官和海关人员组成，乌克兰和摩尔多瓦方面则派出50名人员予以协助。协助团的总部设在敖德萨，在其他5个地点设立分部。目前，协助团有200多名工作人员，包括来自20个欧盟成员国的129名专家以及独联体国家代表、摩尔多瓦和乌克兰当地的工作人员。
2008年8月在格鲁吉亚爆发了南奥塞梯战争，交战一方为格鲁吉亚政府，另一方为单方面宣布独立的南奥塞梯，及其支持者阿布哈兹和俄罗斯。2008年8月8日，格鲁吉亚军队进入南奥塞梯控制区，并炮击南奥塞梯首府茨欣瓦利。俄军随后开进南奥塞梯，增援驻扎在那里的俄维和部队。战争爆发后，欧盟宣布将派观察团，就战争停火问题进行斡旋，并提供一百万欧元支援受冲突影响的两国人民。2008年9月15日，在位于比利时首都布鲁塞尔的欧盟总部举行的欧盟外长会议批准了在2008年10月1日前向格鲁吉亚境内派遣200名欧盟观察员的计划。欧盟派驻格鲁吉亚观察团由来自欧盟26个成员国的340名职员组成，其中观察员246名。
观察团的任务包括：稳定、监督和分析当地局势，特别是撤军等六点协议的贯彻执行；推动冲突地区正常化；以各种方式消除当地的紧张气氛等。欧盟驻格鲁吉亚观察团行动是欧盟共同外交与安全政策历史上速度最快的一次联合行动，从计划批准到人员到位用了不到一个月的时间。这反映出欧盟采取联合行动来应对危机的能力大大提高。
针对阿富汗的重建工作，欧盟组织了由350名国际工作人员和200名当地工作人员，其中包括245名来自19个欧盟成员国以及克罗地亚、加拿大、挪威和新西兰的警官及司法专家所组成的欧盟阿富汗警察重建行动特派团。特派团的主要任务是帮助阿富汗强化阿富汗安全部门的运作能力、专业水平和问责制，努力培训和指导阿富汗国家安全部队等。
巴勒斯坦的政治进程一直以来受到欧盟的关注，为监督巴勒斯坦大选，欧盟在2004年12月派出了人数超过260名的大选观察团，这其中包括40名长期观察员和130名短期观察员，30名欧洲议会的议员。此次观察团旨在保障巴勒斯坦大选符合公正的国际标准。
欧盟驻巴勒斯坦领土警察团是欧盟于2006年1月1日向巴勒斯坦派驻的警察团。目的是帮助巴勒斯坦建立稳定高效的警察机构，并在刑事司法领域帮助巴勒斯坦培训人员。警察团总部设在约旦河西岸的拉姆安拉，由来自欧盟的15个成员国以及挪威、加拿大的41名工作人员组成。警察团任期于2010年12月31日结束。
拉法口岸位于加沙南部与埃及交界处，是巴勒斯坦唯一不经过以色列而直接通往外部世界的口岸。自2000年9月巴勒斯坦武装起义爆发以来，以色列完全控制了拉法口岸。2005年9月12日，以色列完成加沙撤离计划，同时撤出拉法口岸。因担心巴勒斯坦人通过拉法从埃及向加沙走私武器，以色列与巴方一直在重开拉法口岸问题上存在分歧。经过调解，双方达成协议，在欧盟的监督下开放拉法口岸，方便巴勒斯坦人往返于加沙和埃及。按照协议，欧盟将派遣70人的观察团，作为第三方负责口岸的监督工作，并帮助巴以双方建立互信。
2007年在欧非峰会上，欧盟与撒哈拉以南的31个非洲国家签署了战略合作《欧盟——非洲战略合作伙伴关系》文件，成为战略合作伙伴，欧盟将向这31个国家援助80亿欧元致力于和平与安全、良治与人权、贸易与地区融合、千年发展目标、能源、气候变化、科学与信息社会、移民与就业等8个领域与非洲建立伙伴关系。欧盟与非洲国家关系进一步推进。在这个背景下，欧盟支持几内亚比绍安全改革特派团主要任务是帮助几内亚比绍进行安全领域内的改革，任期为2008年6月至2009年11月30日。
应刚果（金）政府的要求，欧盟本月将向刚果（金）派遣顾问和援助团，以帮助这个饱受战乱之苦的中非国家改革安全部门，“欧盟—刚果（金）安全团”将由8名欧盟顾问组成，分别服务于刚果（金）军队经过整编的总参谋部，国家裁军、复员和安置委员会，国防部。他们受法国将军皮埃尔·约阿纳领导，预算160万欧元。欧盟专家的工作重点是在刚果（金）国防政策中“推进人权、人道主义、民主、廉政、透明和法制”。这是欧盟首次向非洲派遣此类顾问团，它将在欧盟安全与防务政策的框架下予以实施。
乍得东部和中非共和国东北部毗邻苏丹达尔富尔地区。为稳定达尔富尔及其周边地区局势，联合国安理会于2007年9月25日通过第1778号决议，决定在乍得东部和中非共和国东北部部署一支由警察和文职人员等组成的联合国特派团，同时授权欧盟向该地区派遣一支部队，以保护滞留在那里的数十万名难民。欧盟外长会议2008年1月28日在布鲁塞尔批准了欧盟向乍得东部和中非共和国东北部派遣维和部队的计划。2008年3月17日，欧盟驻乍得和中非共和国维和部队正式开始执行任务，行动计划为期12个月。维和部队由来自欧盟14个成员国的3500余名军人组成，其中法国军人占到了55％，这支维和部队是欧盟在非洲部署的规模最大的一支部队。
2008年以来，索马里附近海域海盗活动日益猖獗，引起了国际社会的广泛关注，仅2008年这一年里国际社会向索马里海盗支付的赎金就高达12亿美元，也间接造成了海运保险费和变更航线费用的增加。索马里海盗不仅威胁到当地的安全稳定同时也危害世界的安全稳定，国际社会不堪其扰。在联合国呼吁下，2008年11月10日，欧盟成员国外交部部长在布鲁塞尔举行的月度例会上，批准欧盟向索马里海域派遣军舰和飞机，以保护世界粮食计划署运粮船安全，并在该海域打击海盗活动。该行动的代号为“阿塔兰塔”。欧盟8个国家（包括英国、法国、德国、西班牙、荷兰、比利时、希腊和瑞典）向索马里地区大约100万平方公里的海域共同派遣6艘军舰、3架海上预警机和4架直升机，组成打击海盗特遣舰队。一方面保证世界粮食计划署运粮船及其他商船的安全，另一方面在该海域预防和打击海盗及其他武装抢劫活动。这项军事行动将持续1年，总指挥部设在英国诺斯伍德。
欧盟还进行很多其他的联合行动，在应对危机时，欧盟可以及时启动应急反应机制，出台相关援助计划，部署援助方案，联合行动的能力大大提升。与霸权主义干涉有着明显不同，欧盟很多联合行动都是在联合国的号召下，根据联合国安理会通过的决议来展开行动。同时欧盟在进行联合行动是不是一味采取军事手段，而是民事措施和军事手段共同进行，遵守国际法规，因此在国际社会产生了深刻的影响，树立了良好的欧洲形象，广泛传播了欧洲的核心价值观，为促进国际社会的和平稳定提供了积极力量。