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近年来，我国将逐步对内部审计管理体制进行改革，即将内部审计的领导工作由过去上级审计机关代为管理改为单位自身管理，将内部审计真正从国家审计中脱离出来，走内部审计协会管理的模式。这将有利于内部审计在单位领导下开展工作，能使内部审计的职能更加明确和规范。但是，一些单位领导和内审人员的认识却发生了偏差。特别是中小企业、民营企业的领导由于受传统观念的束缚，在文化水平、经营思想和理念等方面的素质还相对较低，导致他们对内部审计的重要性和必要性认识不充分，有些单位领导认为这一改革扩大了他们的权利，可以为了单位、小集体或个人的利益而更自由地支配审计工作。一些内审人员认为这次改革是政府对内部审计撒手不管，是内部审计工作的“弱化”。这些错误认识如果不消除，势必会削弱对内部审计的重视。
我国内部审计的实践证明，内部审计的独立性及其效果如何，在很大程度上也取决于企业领导。企业领导越对内部审计重视，其内部审计的独立性就越强，内部审计人员的积极性就高，内部审计工作效果就好。在一个高度重视内部审计的企业，其内部审计机构的设置层次较高，审计机构的经费来源充足，内部审计人员的素质较高，内部审计的作用发挥较充分；相反，一个不重视内部审计的企业，其内部审计机构的设置层次较低，审计机构的经费来源不充足，内部审计人员的素质较低，内部审计的独立性较差，甚至于没有独立性。可见，审计环境对内部审计独立性影响较大。