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系统科学与系统哲学，是在自然科学与复杂性科学发展的基础上，形成的科学体系与知识文明创新体系。同时又是在系统论、信息论、控制论科学思想与工程技术、科技知识、创新引擎与创新体系发展的基础上，对于科学与知识、科技与文化做出跨学科系统总结与哲学思考的科学思想。这也是和航天航空技术、生命科学技术、信息科学技术、新材料科学技术、认知科学技术知识文明的创新发展密切相关。
一般认为，系统科学的起源是《自然辩证法》的自然观、科学观与科学方法论的理论构成与发展，同时也是钱学森等组织管理技术与系统工程思想理论的发展与学术创新。系统科学曾给予区域科学发展以新的科学理论研究基础，形成区域规划理论的区域科学系统理论与方法。在此基础上，形成了复杂性系统研究的复杂性系统理论与方法，来解决科技、经济、环境、社会复杂性的社会协调问题，后来又应用到资源配置优化与复杂性经济学的理论研究中，形成资源比较优势研究的复杂性经济学理论与思想。
由于文化科学与经济学、管理学的密切关系，文化哲学与产业哲学的密切关系，使得文化科学与系统科学的关系愈来愈密切，同时文化科学与系统科学的融合，也使文化科学在解决、处理复杂性定量问题研究中，有了科学测度的基础而与鉴识科学、规划科学的应用学科产生了更多的内在联系与创新效益。