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企业在享受研发费用加计扣除优惠政策时需注意一些常见的问题。首先，企业在申报享受研发费用加计扣除政策的时候应关注政策适用问题，注意避免以下错误处理情形：未准确界定负面清单企业、研发活动、研发费用、研发人员等概念，未准确归集有关研发费用；未对享受加计扣除的研发费用按研发项目设置辅助账、未分别归集可加计扣除的研发费用等。其次，应注意研发费用管理与财务核算问题，注意避免以下错误处理情形：未按会计制度要求对研发支出进行会计处理；未按照企业会计准则有关规定区分研究阶段与开发阶段，并将研发支出合理予以费用化或资本化；对研发费用和生产经营费用没有分别核算、准确划分；未正确适用加计扣除比例等。最后，应注意留存备查资料的问题，注意避免以下错误处理情形：未按要求做好留存备查资料或者留存备查资料与实际经营实质不符等。本章通过梳理企业享受研发费用加计扣除政策享受过程中的常见问题，帮助企业进一步厘清和掌握现行政策规定。
【案例6－1】 A公司从事销售、研发等业务，假设2023年度商品批发销售收入15000万元，2023年度产品研发收入5000万元，兼营出租房屋取得租金收入5000万元，投资收益300万元，收到市政府拨付的200万元财政补贴（符合不征税收入条件）。全年用于研发的费用支出500万元。
2023年度A公司批发销售收入占比＝15000÷（15000＋5000＋5000＋300＋200－300－200）×100％＝60％＞50％
A公司2023年度主营业务为“批发和零售业”，属于负面清单企业，不能享受研发费用加计扣除优惠政策。
分析 ：并不是所有行业企业发生研发活动都适用研发费用加计扣除政策，应重点关注负面清单中的6个行业。《财政部 国家税务总局 科技部关于完善研究开发费用税前加计扣除政策的通知》（财税〔2015〕119号）规定，不适用加计扣除的行业有烟草制造业、住宿和餐饮业、批发和零售业、房地产业、租赁和商务服务业、娱乐业（以下简称六大行业）。上述行业以《国民经济行业分类与代码（GB／T 4754—2017）》为准，并随之更新。对于同时从事多种行业的纳税人，判断是否属于不适用税前加计扣除政策行业的企业，是指以六个行业业务为主营业务，其研发费用发生当年的主营业务收入占企业按《企业所得税法》第六条规定计算的收入总额减除不征税收入和投资收益的余额50％（不含）以上的企业。