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1913年7月，凶犯应夔丞由上海一批流氓劫狱救出后，躲入青岛租界，袁世凯镇压了国民党“二次革命”后，应夔丞从青岛发电给袁世凯，要求给他“平反冤狱”，未获回音。
1914年1月间，应夔丞大摇大摆来到北京通过赵秉钧要求袁世凯履行“毁宋酬勋”的诺言。袁断然拒绝接见，矢口否认与应有关系，感到留着他是个败露阴谋的祸根，欲派侦探加以暗害。
应发觉后，满腹怨气，急忙于1月19日离开北京，乘快车去天津。车过杨村，在车上被追随来的京畿执法处侦察王兹圃用刺刀结束了性命。
应夔丞的可悲结局，使得此时在天津改任直隶总督的赵秉钧，深切感到袁的手段太毒辣，太使人寒心。赵立即下令各地严缉杀应的凶手。并且打了电话给袁世凯，问：“谁刺杀了应氏？”袁世凯答说：“总统杀了他！”赵微露不平，说：“如此，以后还有谁肯替总统做事！”尽管赵随袁入京以来，一起为袁效尽了犬马之劳，协助袁干了不少不光彩的事，袁对赵敢为应夔丞被杀事指责自己，仍不能原谅。袁大为震怒，但不动声色。1914年2月19日，袁又让赵兼任直隶民政长。2月27日，赵在天津督署吃饭中毒，七孔流血而死，显系被袁遣人投毒，杀人灭口。但堂堂大总统毒死自己属吏，不免受社会舆论的抨击。故在赵死后，袁先派朱家宝及袁之次子袁克文前往吊唁，后又派陆军上将廕昌和秘书长梁士诒为政府代表致祭，送去一副祭幛，上题“怆怀良佐”四个大字；发给治丧费1万元；并亲题“弼时盛烈追皋益，匡夏殊勋懋管萧”的挽联，以掩人耳目。
袁世凯深恐他的这些手段瞒不过赵秉钧的心腹王治馨。王先后任内务部次长、京师警察总监、顺天府尹。遂以王在任内有贪赃受贿行为，于6月27日下令逮捕，10月21日批令“立予枪决”。此后又将王的属吏潘毓桂等逮捕判刑，从而清洗了赵秉钧在京师警察界的潜在势力。
以后袁世凯积极准备实行帝制，自己想做皇帝，儿子为储君，建立一个万世袁姓的大家业。袁不惜卖国求荣，在1915年5月9日承认日本提出的“二十一条”不平等条约。又在总统府中和一些帮凶狗腿，施展鬼蜮伎俩，逐步制造民意，强奸民意。1915年12月12日，公开承认接受当皇帝，13日在居仁堂接受百官的朝贺。31日申令明年民国5年1月1日改为洪宪元年元旦，准备不久登上皇帝宝座。
1915年10月间，正当袁贼导演丑剧热闹的时候，孙中山就命令陈其美、居正、于右任、李烈钧等，分赴各地区活动，准备起兵讨伐袁贼。12月19日，蔡锷回到云南，后组织护国军三个军，由蔡锷、李烈钧、唐继尧分别任总司令，蔡锷率军入川，与袁军激战于叙州（今宜宾）、泸州、綦江等地。反袁号召深得人心，贵州、广西、广东、浙江、陕西、四川、湖南各省相继宣告独立，通电促袁退位。北洋系统的军阀官僚也对袁离异，帝国主义各国则“警告”袁，要袁暂缓称帝。袁在内外压力之下，被迫于1916年3月22日宣布取消帝制，接着废止洪宪年号，企图仍回到总统地位。5月22日，19个省的公民主张迫袁退位，要求交付法庭，审判其罪。袁世凯心惊胆战，昼夜焦虑，5月27日生病，6月6日一命呜呼，这年袁世凯58岁。
袁贼死后，由黎元洪继任总统，恢复了民国元年《临时约法》。孙中山、黄兴等革命党人先后回国。
暗杀宋教仁案件中的五个凶犯，已死了四个，还有洪述祖一人，一直躲在青岛租界，未能归案受审。
1916年青岛发生战争，这时洪述祖易名为王兰亭，悄悄遁居上海租界。1917 年4月，洪在浙江省租界会审公堂涉讼，被宋教仁的儿子宋振侣发现，当即报告政府。4月30日，租界捕房将洪逮捕，经政府交涉引渡，将洪犯移交北京地方检察厅侦审。1919年3月27日，北京政府大理院判处杀人犯洪述祖绞刑，4月初在北京监中执行。
至此，宋案中的五个凶犯，无一善终。