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通过对该墓不同规格、纹饰的长方形墓砖的使用，主室、侧室墓壁厚度的差异以及设祭场所前后变化与部分遗物的分析，笔者认为，该墓的初始形制并不包括侧室，而是一座近方形的大型砖室墓。侧室是在主室墓主入葬一段时间后，为葬入第三者加砌的。主墓室因左右跨度大，参照南京地区六朝早期墓例，推测是穹窿顶。侧室是为葬入单棺加砌的，空间狭窄，应为券顶。
正因为侧室是为葬入第三者加砌的，因此，除因盗扰混入的少量南朝特征明显的器物外，该墓出土的随葬器物，尤其是形制特征演变敏感的青瓷器具，基本上可以分出两组。甲组是仍具江南地区西晋以来典型装饰风格的器物，以器物肩部装饰上下弦纹或联珠纹，间饰网格纹，带状纹饰之间贴塑铺首者最具时代特征。这类风格器具的使用，可一直延续至东晋前期。乙组是进入东晋以后逐渐普及开来的器物，器形整体比例增高，下腹部略有内收，盘口口径增大，肩颈部装饰消失，部分器物出现褐斑点彩等。东晋立国103年，基于政治、社会的发展进程及物质文化形态的演变，可以东晋简文帝在位时期（371-372）为界，将东晋分为前后两期。那么，该墓可断为东晋前期墓葬。物质文化形态的演变往往更加敏感，基于迄今所见东晋陶瓷器的演变轨迹，甲组偏前期早段，乙组偏前期晚段，反映了主室墓主与侧室墓主入葬的时间差。尤其是甬道两道门槽之间设祭场所残留的器物群，既有甲组器物，又有乙组器物，可见在葬入侧室的第三者后的最后设祭，既利用了前期入葬的旧器物，也增加了后期入葬时的新器物。
经半个世纪以上的考古发掘和研究，六朝都城建康地区周围的墓葬等级问题已基本清晰，无须在此赘言。南京大学北园东晋墓，关于其墓主，虽然有东晋元、明、成、哀四帝之一，元、明、成三帝之一，元帝（建平陵）、成帝（兴平陵）等不同意见，但墓葬作为东晋前期的帝陵，自发掘以来就是学界的共识，其中最重要的依据就是甬道内设置两道墓门。
基于目前较多的墓例，南京大学北园东晋墓、幕府山南京汽轮电机厂东晋墓
、富贵山东晋墓
，甬道内均设置两道木门。南朝尤其是齐、梁时期的帝陵，也无一例外甬道中设置两道门，只是木门换成了石门。东晋时期甬道内设置一道木门的墓葬，墓主有宗室成员，也有世家大族，南朝时甬道内设置一道石门的，墓主通常都是宗室成员。
关于东晋诸帝的葬地，唐人许嵩在《建康实录》卷八《穆皇帝》的最后作了总结：“案，晋十一帝，有十陵，元、明、成、哀四陵在鸡笼山之阳，阴葬不起坟。康、简文、（孝）武、安、恭五陵在钟山之阳，亦不起坟。惟孝宗一陵，在幕府山，起坟也。”
许嵩是意识到了穆帝永平陵与其他诸陵在葬地、葬制上的不同，特意在此加上案语的。
鸡笼山诸陵，是元帝建平陵、明帝武平陵、成帝兴平陵和哀帝安平陵。元、明、成三帝是嫡长子继位，成帝长子哀帝在经历了康帝、穆帝两代后继位，成为“中兴正统”，葬入鸡笼山陵区。
《建康实录》叙晋元帝建平陵称“在今县北九里鸡笼山阳”，明帝武平陵“在县城北九里鸡笼山阳，与元帝同”，成帝兴平陵“在县北七里鸡笼山阳，与元帝同处”，哀帝安平陵“在县北九里鸡笼山之阳，元帝同处”
。这里所说的“县”，是指唐上元县。明帝武平陵、成帝兴平陵、哀帝安平陵既然均“与元帝同处”，那么，叙述成帝兴平陵时所说的“七里”应该是“九里”之误。李吉甫《元和郡县图志》卷二十五《江南道一》叙述元、明、成、哀四帝陵均在上元县“北六里鸡笼山南”
，可见四陵同在一处，举目可望。
仔细梳理两晋时期后妃祔葬祔庙的文献资料后发现，两晋后妃祔葬祔庙虽然存在各种情况，差异较大，但基本能看出其制度性规定，即追赠的皇后大多祔葬入庙，而追赠的嫔妃则不具有与皇帝祔葬、入庙配食的资格。
然而，成帝时的宫中贵人、生下哀帝和废帝海西公两位王子的周氏的情况非常特殊。作为“中兴正统”的哀帝继位后，诏有司议论周氏的位号。权臣桓温议宜称“夫人”，尚书仆射江虨议宜为“太夫人”，这两个位号均比周氏原有的“贵人”高得多，但哀帝仍然对此不满，最终排除诸大臣的议论，诏崇周氏为“皇太妃”，仪服与太后同。“皇太妃”之号，东晋时期已废除不用，而哀帝特意使这一古代称号复活，用于自己的生母，在礼仪服御上一同皇太后，不得不说这是个特例。哀帝继位后的次年三月，周氏薨，哀帝亲往琅邪王第奔丧，并力争将周氏的服丧期由三个月延长为一年。
东晋皇后以外的嫔妃“葬”事，仅见于《建康实录》的记载，而且仅见一例，就是关于周氏的。《建康实录》卷八哀皇帝兴宁元年三月条称：“皇太妃薨于琅琊第。”同卷七月条：“丁酉，葬皇太妃。妃姓周氏，汝南人，选入成帝宫，有宠，生帝及海西公，拜为贵人。帝即位，诏崇为皇太妃，仪服同于太后，而葬不祔陵庙。”
《建康实录》“而葬不祔陵庙”一句非常值得推敲。遍检六朝史籍，他处从未出现过“祔陵庙”或“不祔陵庙”的用词，并且，在“诏崇为皇太妃，仪服同于太后”之后紧跟着“而葬不祔陵庙”的“而”字在文法上也难以解释。因此，此处不妨作大胆推测，“而葬不祔陵庙”是“葬陵而不祔庙”之倒误。而且从周太妃薨亡到入葬，前后相差四个月，也许这正好是从朝廷上的礼仪争论到加筑侧室、匆忙入葬的时间。以上推论虽难免改字释义之嫌，但这能够很好地解释南大北园东晋墓的各种考古学现象。
根据历史文献记载，基于出土遗物的时代特征，笔者认为南大北园东晋墓作为晋成帝兴平陵的可能性最大。如若推测可信，入葬的三人分别是晋成帝、杜皇后、周太妃。主室的砌筑时间在公元342年左右，侧室的加筑时间为公元363年。