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理论假设，“从广义来讲是人们借助已有的知识和事实，通过推理和论证而得出的科研预期结果。
”对某一事物或某一现象的推测性的解释就叫做假设。本课题主要目的是健身气功健身理论的构建与健身效果的研究，前者是一种理论体系的初步构建，后者是对健身效果的实验研究，前者是后者的理论基础。因此本研究的理论假设主要集中在理论体系构建部分，即，健身气功的健身理论构建，构建一个什么样的体系。换言之，对理论假设的思考亦是对理论根源的探索。
本研究主要从以下两个方面考虑：
一方面是结构、功能的考虑。理论体系构建的实质是理论的系统化。系统论认为，结构、要素和功能是系统的三要素，有序性、层次性和稳定性是系统结构的三个特性。因此，在构建健身气功的健身理论体系的过程中，首先考虑理论体系的结构和要素，这个结构分为哪几个层次，由哪些要素组成，每个层次、每个要素包括哪些具体内容；其次要考虑理论体系各层次、各要素的功能，即各层次、各要素在理论体系中的作用；最后要考虑整个理论体系的功能，即理论体系的目的与作用。
另一方面是内容的考虑。仅从本研究题目来看，显然的要考虑健身气功和健身理论这两个内容。健身是为了健康，健身气功能够促进健康，其练习目的也是健康。健身气功是中华悠久文化的组成部分，是以自身形体活动、呼吸吐纳、心理调节相结合为主要运动形式的民族传统体育项目。作为一种体育运动项目，健身气功必然的具有科学的体育锻炼促进健康的共同品质；同时，中华悠久文化组成部分的健身气功必然蕴涵和体现了中华民族对健康的不懈思考、不懈追求的积淀。再者，健康是全人类的永恒追求，古今中外的人们在各种各样的健身实践活动中形成多种多样的健身理论。无论何种健身实践活动，其主体都是人，其目的都是健康。
基于以上的思考，本研究认为应该以健身气功和健康主要内容、以对健康的认知为主线，来构建健身气功的健身理论体系。本研究的理论假设据此展开：
健身气功诞生在并成长在中华传统文化的沃土中，健身气功的练习能够体悟传统文化。从传统文化的组成部分来讲，健身气功体现了传统文化的基本精神，蕴涵了传统文化对人、社会和自然的基本观念；从体育项目的角度来看，健身气功的方法、手段，及其动作内涵渗透着传统文化的精神与理念，对方法、手段的理解与实践就是对传统文化的感悟。
人作为现实的人存在的根据存在于人的现实关系之中。人的现实关系是人与世界全面的关系，既包括人与社会的关系，也包括人与自然的关系。中医“天、地、人”三才整体健康观与代表西方医学健康观点的“生理、心理、良好社会适应的完美状态”的现代科学健康观在健身气功的追求健康的实践中得到统一。
因此，本研究把健身气功的健身理论分为三个层次：具体运动技术层面，即具体的健身气功动作技术、练习要领；阐释健身气功健身机理的相关学科理论层面，主要指中西医学对健康的认识；生命观、人生观和世界观层面，即通过健身气功的练习体悟传统文化，树立有益于健康的科学的人生观和世界观。
机体“内稳态平衡”是中西医都承认的生理学概念，健身的实质就是对这种生命活动过程对立统一性的动态生理平衡的维持，这种动态平衡的维持和调节是人体健康的内因，所有的健身方法是外因。外因是变化的条件，内因是变化的根据，外因通过内因起作用。因此，无论健身气功和其他的体育健身方法在锻炼手段、方法、阐释理论上有如何的不同，但是两者在以健康为目的的健身实践中得到了统一。基于这种思考，本研究认为健身气功的健身理论体系的具体内容是在三层面的框架内，围绕“什么是健康状态、怎样才能达到健康、如何通过健身气功的练习达到健康”的主题，紧密结合体育运动健身理论基础，从中医和西医两个方面来进行构建和探邃。