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肠道菌群在白天和夜晚都经历着节律性的变化，但是斯坦福大学贾斯汀与埃里卡·索南堡实验室的研究表明，这种波动变化也会在更大的时间尺度上发生——与季节变化同步。哈德萨族是生活在东非坦桑尼亚大裂谷中部的一个原住民部落，属于一个狩猎采集部落的后裔
。截至2015年，世界上仍有1 200至1 300名哈德萨人。人们相信，直到20世纪为止，哈德萨人一直在目前的领地上生活了数千年，他们传统的狩猎采集生活方式几乎没有发生过变化。然而，受到殖民、旅游业、不断侵占领地的养牛农户的外界压力，如今，只有大约300名哈德萨人完全依靠狩猎采集的方式生存，根据季节的变化，他们将蜂蜜、块茎、猴面包树果实或其他水果和野味带回家。
与所有过着传统的狩猎采集生活方式且不受工业化影响的人群一样，哈德萨人成功避免了罹患西方国家常见的慢性疾病，如肥胖和糖尿病。然而需要始终牢记的是，除了饮食之外，其他生活方式，如更多的体力活动以及不接触人工化学物质等因素，也可能有助于战胜疾病或者降低发病率。
东非大裂谷有着两种截然不同的季节，旱季从5月到10月，雨季从11月到第二年4月，这决定了哈德萨人的饮食。尽管他们全年都食用富含膳食纤维的块茎和各种植物，但是雨季期间会食用更多浆果和蜂蜜，而旱季狩猎更容易成功，使得在旱季瘦肉摄入量更高。
为了研究季节性变化对哈德萨人肠道菌群的影响，松嫩堡的研究小组检查了在一年中收集的350份哈德萨人粪便样本。正如2017年《科学》杂志所报道的那样，他们发现在旱季，肠道中拟杆菌门的增加与这个时期野味消耗量较高有关。在哈德萨人吃更多素食的雨季，这类微生物减少了大约70%，这种状态与工业社会中人群的肠道菌群非常相似
。然而，与包括美国在内的工业化社会中出现菌群永久性变化形成鲜明对比的是，哈德萨人的肠道菌群在旱季再次恢复到完整的多样性。在工业化社会中永久减少或灭绝的肠道菌群，随着哈德萨人的饮食改变后，又会恢复到可检测的水平。
肠道微生物的相对丰度在季节性上的变化伴随着对碳水化合物利用能力的相应变化，即微生物对碳水化合物的利用能力，是由消化复杂碳水化合物所必需的消化酶的分泌量来体现的，这些酶是将动物、植物和黏液蛋白（肠壁黏液层的关键成分）中的复杂碳水化合物消化为可吸收的代谢产物。在雨季，哈德萨人的这类消化酶的水平较低，而在旱季，这类酶的丰富性和多样性增加了。这项研究的首席研究员塞缪尔·斯米茨认为，微生物群处理不同种类碳水化合物能力的变化反映了季节性饮食的变化，哈德萨人健康肠道菌群的组成和功能也随着季节和摄入食物的不同而变化。这项研究清楚地表明，健康的肠道菌群会随着人们的饮食习惯而发生改变。