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环境、生态、农业和生物等领域论文通常的主体结构是“哑铃型”，主要包括引言(Introduction)、材料与方法(Materials and Methods)、结果(Results)、讨论(Discussion)四大部分，另外一头一尾分别加摘要(Abstract)和结论(Conclusion)。生物学的一些期刊要求将材料与方法放在论文的最后。
为什么说论文的主体结构是“哑铃型”呢？因为文章的引言和讨论是至关重要的。引言要把这项工作的来由和拟解决问题说清楚。讨论则是消化了主要研究结果之后的系统回顾，说明为什么得出这样的结论，与以往的发现有何异同，为什么不同，所获得的结果又意味着什么，等等。所以，引言和讨论部分所涵盖的内容比作者自己的研究内容要更宽泛一些。此外，引言和讨论部分的篇幅还比较大，有时可能会分别大于材料与方法和结果这两部分。因此，我们可以形象地说论文的结构是“哑铃型”。有些“水桶型”论文是一大堆数据的堆积，缺乏系统梳理和提炼。但很多高影响因子的期刊有严格的字数限制，加上需要显示的研究结果很多，使得引言和讨论都相对较短，论文呈现也是“水桶型”，如 PNAS 、 Nature 子刊中部分文章。本书在后面还将详细展开来谈这些问题。
依据期刊的不同，论文的结构也会有些变化/变异，其中结果和讨论的混合较为常见。这两部分是否混合在写作上的套路还是很不一样的，需要作者审慎对待。对于一些综合性刊物，如 Nature 、 Science ，文章的结构是独特的，往往是把论文的故事一口气讲完整，有一泻千里之势。