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与智库团队建设和融资研究问题相关的是如何确定本组织的研究议程问题。在规划研究议程方面，有两个主要问题：第一，智库研究议程应关注某一个或几个相关政策领域还是应关注广泛的研究领域；第二，对于智库研究模式，是采取研究议程由研究人员提出经研究主管进行判断的模式，还是采取由研究主管制定研究议程再向员工分配研究任务的模式。
智库重点研究某一政策领域的优势在于，其能够更快速地在该领域建立专业声誉，成为该领域合同研究的主要承接者。例如，美国预算与政策中心算一个小型智库组织，却逐渐成为美国营养和福利政策制定的主要参与者。该中心的主要研究都围绕着营养与福利政策展开，同时其在美国各州建立了强有力的营养倡导者网络，通过网络来落实当前的政策举措、传递相关信息。但是研究议程单一化也有风险，如果社会对于某一特定政策领域的兴趣降低、资金减少，那么将直接影响专注于该领域的智库的生存。
另一个研究议程规划需要考虑的问题是：遵循由研究人员提出经研究主管进行判断的研究议程，还是遵循由研究主管制定研究议程再向员工分配研究任务的研究议程。目前，多数智库混合使用上述两种模式，但是不同的智库类型可能对于研究模式的偏好不同。例如，对于没有其他资金来源、主要依赖政府资金支持的智库，其选择“自上而下”的研究模式是精准且高效的。