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第一，制造业同构测度方法与指标选择。通过对比分析现有产业同构的测度方法和指标的科学性与合理性，选择设计出更为适合的制造业同构测度的方法与指标。第二，低端同构的概念界定。基于价值链学说，结合产业同构的相关研究，对低端同构的概念进行界定，明确其特点与本质。第三，制造业低端同构的测度方法研究。从低端性和同构性出发，选择合理的指标，构建制造业低端同构水平的测度模型。第四，考虑类型差异的长三角制造业低端同构水平测算。按生产活动领域、组织规模、所有制性质等标准对制造业进行分类，并逐一测算分类后各类产业的低端同构水平并进行比较分析。第五，考虑区域细分的长三角制造业低端同构现象解析。从地域上将长三角分为省级地区、市级地区、县级地区和乡镇地区，分别测算或分析制造业的低端同构水平并进行比较分析。通过产业细分与区域细分条件下的比较分析，形成对长三角制造业同构状况更为深入的认识。第六，长三角制造业低端同构的竞争绩效分析。分别对低端同构与经济效益、经济增长趋同的关系进行分析，以考察低端同构对竞争绩效的影响。在合理确定主要因素的基础上，分析各因素对制造业低端同构的影响。
第一，协同集聚的内涵剖析。基于对产业协同集聚文献的梳理，结合现有研究中关于产业集聚的典型定义，对产业协同集聚这一概念进行剖析，明确其概念、特点与本质。第二，长三角各地区内部制造业协同集聚的测度方法选择。从分割集聚这一引致产业低端同构的现象入手，从成本视角构建分析协同集聚程度的指标体系，利用相关性分析方法，构建判断地区内部制造业协同集聚水平方法。第三，长三角各地区内部制造业协同集聚水平测度。在计算各指标数据的基础上，通过相关性分析，从横向和纵向两个角度，对长三角各地制造业的协同集聚状况进行测度和比较分析。第四，长三角地区间制造业协同集聚状况评价。借鉴已有测度产业协同集聚的方法，构建测度地区间制造业协同集聚的指数，并对长三角地区间制造业的协同集聚水平进行测度和比较分析。
第一，产业有序升级的评价指标体系构建。借鉴Humphrey and Schmitz（2000）的升级层次理论，选择从工艺升级、产品升级、功能升级和跨产业升级等角度研究构建测度产业有序升级的指标体系。第二，长三角制造业升级水平测度。基于构建的指标体系，计算各项指标的数值，基于客观赋权的多目标决策方法，对长三角各地区制造业升级水平进行评价并进行比较分析。第三，产业升级有序度评价的方法选择。借鉴结构熵学理论，选择利用条件结构熵模型作为长三角制造业有序升级水平的评价方法。第四，长三角制造业有序升级水平测度。利用条件熵模型从结构视角测算长三角制造业的有序升级的水平，同时辅之以因果检验法进一步印证长三角制造业升级的有序程度。
第一，长三角制造业地理集中与产能过剩的关系分析。以资源型制造业为典型对象，以低端同构为中介变量，借鉴温忠麟（2014）的中介效应模型，分析地理集中与产能过剩的关系，为清晰认识低端同构可能引发的效应提供依据。第二，长三角制造业协同集聚与低端同构的关系分析。在获得地区间制造业协同集聚水平和低端同构水平的基础上，利用面板数据分析方法，对二者之间的关系进行分析，为明确认识二者的具体关系奠定基础。第三，长三角制造业低端同构与有序升级的关系分析。在合理测度地区间制造业有序升级水平的基础上，分析长三角制造业低端同构与有序升级的关系，以明确同构对升级的影响。第四，长三角地区间制造业协同集聚与有序升级的关系分析。探讨协同集聚与有序升级之间的逻辑关系，论证二者具有的内在一致性，并用计量经济学方法分析它们之间的数量关系。
第一，长三角制造业升级目标的取向研究。基于前述研究，拟从结构升级、能力升级以及绿色升级等方面，设计长三角制造业从低端同构到协同集聚的升级目标取向。第二，提升制造业发展各主体创新能力。这是基础性路径，因为只有提升长三角制造业发展各类主体的创新能力，才能真正实现制造业的升级。第三，提升制造业发展各主体的协同性。在提升各主体创新能力这一基础性路径的基础上，另一条路径就是加强各主体的协同性，这样才能为实现长三角制造业的有序升级奠定基础和开辟道路。
本书在定性与定量研究方法相结合的基础上以定量方法为主开展研究，用到的定量方法主要有：
对长三角制造业升级水平进行测度，实际上就是在构建指标体系的基础上，利用多目标决策方法实现的。
在分析长三角地区间制造业低端同构与协同集聚的关系时，本研究用到的就是面板数据计量经济分析方法。
不论是长三角地区间制造业低端同构水平的剖析，还是协同集聚水平的分析，抑或是有序升级水平的评价，均使用了比较分析方法。
在以资源型制造业为对象，以低端同构为中介变量分析地理集中与产能过剩的关系时，用到了中介变量分析方法。