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意识是如何从人脑（物质系统）中“产出”和“运行”的呢？
对此，经典马克思主义哲学家们深入的研究阐述较少。
人都有思维，也正思维，思维着的思维能否自觉到思维的本性呢？
思维是人脑的机能，意识是人脑的产物。思维的活动大体可包括三个方面：一是思维对物质存在和运动的认识，一般性格物的认知思维；二是思维对“思维对物质认识活动”的针对性反省，具有“脚手架”的反省思维；三是思维对“思维及其活动”的整体性反省，拆除脚手架的纯粹的“对思维的思维”。人类的知识集中在前两个方面产出，难点在于第三方面，因为思维的思维在“拆除脚手架”后似乎什么也不能说，又似乎说什么都可以——当思维自觉到思维本性，一切思维便都是合理的了。
假定1：拆除一切思维着的“脚手架”，思维的思维能够自觉到本性。
任何思维及其活动都是现实的，而一旦具有了其内容，这种内容就成为思维及反省思维的“脚手架”，便不再纯粹。思维没有任何脚手架，则什么也不能说；如果安上任意脚手架，则说什么都可以。拆除“脚手架”的思维，仅剩自己，此时思维的本性将显现出来：自己说明自己，既用一切来说明自己，又用自己去说明一切，在最高处实现“思维与物质”的同一性。
假定2：思维之外有“物质”，且物质存在理性。
思维之外无他物是不符合现实的。思维之外有物质，它成为思维的主要对象，人类有史以来的知识就是明证。人们对思维之外物质认识的“反省”研究比较多，比如思维对物质存在、运动和发展的认识的反省，思维对“思维对物质认识活动”的反省，等等。物质具有物质理性，其包括本能物质理性和机能物质理性。思维之外的物质是不以人的主观意志为转移的，它自然地存在着，自由地、理性地发展着。
假定3：思维及其思维活动都是合乎物质理性的。
“思维及思维活动”是合乎产生它的物质（人脑物质系统）的物质理性的。一旦把一切思维及其活动的脚手架拆除，思维及思维活动都是合乎物质理性的。思维的合乎物质理性是内在的，思维对象之物的物质理性是自然的。以思维之合乎自身物质理性去感觉、反映和识别身外的自在物质之理性，称为“感性”。因此，一切的“感性”都是人及其思维的自在的理性表达。从这个角度看，思维的“天马行空”和“横看成岭侧成峰”都是合乎思维自身内在的自在的物质理性的。而我们通常所说的“思维的理性”是指非自在的理性。思维的非自在的理性至少包括两个环节：一是感性经历实践验证后的形成新的思维之合乎“对象物质”理性；二是该新的理性作为思维之合乎自身物质理性的内容，去感觉、反映和识别身外的“特定的”对象物质之“自在”理性。很显然，“对象物质之自在理性”是不以“思维之所谓合乎对象物质理性”为转移的，即非自在理性是不以人的感性及其意志为转移的。
人类思维的使命之一就是极大地构建非自在理性即科学理性为自身服务。非自在理性是立足于思维，却不以思维自我为中心（即相对于感性）的理性。它为人类思维活动和实践活动服务。但是，任何的非自在理性都无法替代自在感性，即科学无法取代人文，否则人将不人。
坚持探索思维自觉到思维本性，就要坚持“绝对”整体性，就要克服思维因利害关系的选择性影响，就要克服思维因效用性和实用性价值功能的选择性影响，就要克服思维因物质生活需求的选择性影响，就要克服思维因心灵安慰与精神需求的选择性影响，对整体的一切“不确定性”深入地开展冥想。罗素认为，诸多哲学的不确定性问题既和我们的心灵生活有深切关系，却又始终不能解决，比如宇宙是否有一个统一的计划或目的呢？抑或宇宙仅仅是许多原子的一种偶然的集合呢？意识是不是宇宙中的一个永恒不变的部分，它使得智慧有着无限扩充的希望呢？抑或它只是一颗小行星上一桩昙花一现的偶然事件，在这颗行星上，最后连生命也要归于消灭呢？善和恶对于宇宙是否重要呢？或者它们只有对于人类才是重要的呢？目前存有的答案并不是可以用实验来证明其真确性的，但哲学就是要继续研究这类问题。然而，思维自觉到思维本性，就不能深入哲学的这些具体性，而应当以一切的“不确定性”为基本对象内容，开展人所不疑的探索。金观涛在《系统的哲学》
中提出了世界的“不确定性”观点，但其只是“先置条件”应用，并没有阐述“不确定性”的起源。这里，展开思维自觉到思维本性的探索，将讨论“不确定性”的“辩证”的来源及其存在和运行规律等内容。