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“物质在质之后出场。”
其中的“物质”是指机能物质，即具有形式、内容和状态的存在；“质”是指本能物质，即没有内容的纯粹的存在。为了说明它们之间的关系，构建一个由“物质、亚物质、质（本能物质）”组成的本能物质辩证展开系统——表明由“质（本能物质）”到“物质（机能物质）和亚物质”、由“（机能）物质”到“新（机能）物质”的辩证逻辑关系，即本能系统的物质辩证逻辑体系。
本能物质自为展开的辩证逻辑体系包括本能部分和机能部分，即本能辩证逻辑和机能辩证逻辑。前者是物质通过分形整形的自己说明自己的本能辩证逻辑，后者是指本能物质开显的现实的机能物质普遍联系与发展的机能辩证逻辑。贯穿一切物质自为辩证逻辑的纽带是矛盾系统，它是指分形整形的二分对立关系。矛盾是物质辩证逻辑的精髓。它对应地包括本生矛盾和机生矛盾，其中机生矛盾又包括机能自生矛盾（对应物质纵向显现自我存在发展的传统唯物辩证逻辑）和机能共生矛盾（对应物质横向显现的多事物紧密联系共同存在发展的系统辩证逻辑）。物质辩证逻辑体系包括：（1）本能物质“本生”辩证逻辑；（2）机能物质“机生”辩证逻辑，其可区分机能物质“自生”辩证逻辑和机能物质“共生”辩证逻辑。
人及当前人之外的一切世界事物都是机能物质系统形态的物质事物。通常地，人具有社会历史条件的“脚手架”，处于机能物质系统的某一阶层并受其局限，具体表现为感官感知能力、人脑认知能力、实践工具能力的局限性，然而，人是万物之灵，拥有最高级思维，能够不断地打破各种“脚手架”局限发展前进。人在认知世界进程中，具有以自我为中心统摄和主宰形成的相对尺度的效用实践性，为了克服这种相对性局限，辩证法为人类认识世界提供了科学的认识论和方法论，它既承认在条件和范围内对应的各种认知的合理性，也承认各种认知打破藩篱的合理性——世界事物在人的感知中显现，因人而被格物存在，因人而被共物存在。事实上，不管是否被人感知，世界都按自己的方式在那里。世界就在那儿，它“自然地”表现着自我物格物存在，显示着机能物质的普遍联系和发展，等着人类去感知和实践。