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保护区分布的夜鹰目鸟类包括夜鹰科（Caprimulgidae）和雨燕科（Apodidae）2个科。
其中，夜鹰科鸟类属于中小型鸟类。头大而较平扁。喙短，基部宽阔；口角处有粗长的嘴须，或虽无嘴须而眼先羽毛特化成须状。翅狭长，初级飞羽10枚，飞行时几乎无声响。尾较长，尾羽10枚。跗跖短，被羽或裸出，具4趾，3前1后，向前3趾以微蹊相连或多少有些合并，中趾较长。主要栖息于森林中。夜行性，白天多隐伏于森林中的树上，黄昏以后才开始活动。羽色暗淡，几乎与树枝融为一体。主要以昆虫为食。营巢于森林中的树上或地上。
雨燕科鸟类均为小型鸟类，嘴短阔而平扁，或纤细如针。肱骨短小，翅狭长而尖，次级飞羽短且少，适于快速飞行。尾多为叉形，尾羽10枚。跗跖短弱，大多被羽，具4趾，4趾均向前，或后趾能前后转动。主要在空中生活，常成群在空中飞行和捕食。食物主要为昆虫。