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净种子是指被检测样品中所指明的种（包括该种的全部植物学变种和栽培品种）符合国家或《国际种子检验规程》净种子定义要求的种子单位或构造。
下列构造凡能明确地鉴别出它们是属于所分析的种（已变成菌核、黑穗病孢子团或线虫瘿除外），即使是未成熟的、瘦小的、皱缩的、带病的或发过芽的种子单位都应作为净种子。
1.完整的种子单位 种子单位（seed unit）即通常所见的传播单位，包括真种子、类似种子的果实、分果和小花等。在禾本科中，种子单位如是小花，必须带有一个明显含有胚乳的颖果或裸粒颖果（缺乏内外稃）。
2.大于原来大小一半的破损种子单位 根据上述原则，在个别的属或种中有一些例外。
（1）豆科、十字花科，其种皮完全脱落的种子单位列为杂质。
（2）对于豆科，不管是否附有具胚芽胚根的胚中轴和（或）超过原来大小一半的种皮，其种子单位的分离子叶列为杂质。
（3）复粒种子单位列为净种子。
（4）对于燕麦属、高粱属，附着在可育小花上的不育小花不需除去而列为净种子。
（5）对于大麦属，所具附着物（芒、小柄等）不需除去，归于净种子。
主要作物的净种子定义详见表3-1。
表3-1 主要作物的净种子定义
续表
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其他植物种子是指除净种子以外的任何植物种类的种子单位，包括异作物种子和杂草种子。其他植物种子的鉴定原则与净种子的鉴定原则基本相同，但有以下例外。
（1）甜菜属的种子单位作为其他种子时不必筛选，可用遗传单胚的净种子定义。
（2）对于有2粒以上种子的裂果类，一个裂果类中包含的单粒种子（分果类）应单独计数。
（3）对于复粒种子单位、荚果或蒴果，应打开取出种子归于其他植物种子，将其他非种子材料归于杂质。
杂质是指除净种子和其他植物种子外的种子单位和所有其他物质及构造，包括以下几类。
（1）明显不含真种子的种子单位。
（2）分果和分果爿。
（3）小于或等于种子原始大小一半的破裂或受损种子单位碎片。
（4）按该种的净种子定义，不将这些附属物作为净种子部分或定义中尚未提及的附属物。
（5）种皮完全脱落的豆科、十字花科的种子。
（6）脆而易碎，呈灰白色、乳白色的菟丝子种子。
（7）脱落的不育小花、空的颖片、内外稃、稃壳、茎、叶、球果鳞片、果翅、树皮碎片、花、线虫瘿、真菌体（如麦角、菌核、黑穗病孢子团）、泥土、砂粒、石砾及所有其他非种子物质。
（8）除燕麦属、高粱属外，附在可育小花上的不育小花。