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种子批异质性（heterogeneity）测定的目的是衡量种子批的异质性，以表示所测定的项目用混合方法是否达到随机分布的程度。异质性是均匀度的反义词。种子批均匀度是指种子批内各成分的分布均匀一致的程度，即达到随机分布的程度。种子批异质性是指种子批内各种成分的分布极不均匀一致，未达到随机分布的程度，也就是种子未充分混合好。对于存在异质性的种子批，即使按检验规程取得送验样品，也不会有代表性。在实际工作中，如果种子批的异质性明显到扦样时能看出袋间或初次样品的差异时，则应拒绝扦样。
异质性测定比较烦琐，只在扦样时对种子批的均匀度产生怀疑时才进行。《国际种子检验规程》规定了 H 值和 R 值两种测定方法，GB/T 3543.2—1995仅列入了 H 值测定方法。由于国际种子检验协会对 H 值测定方法已经进行了修订，修订后的 H 值测定方法加入了修约系数，更加科学，因此，下面所介绍的内容引自《国际种子检验规程》。
异质性测定是将从种子批中抽出规定数量的若干个样品所得的实际方差与随机分布的理论方差相比较，得出前者超过后者的差数。每一样品取自各个不同的容器，容器内的异质性不包括在内。
扦样的独立容器样品数应不少于表2-11的规定。
扦样的容器应严格随机选择。从容器中取出的样品必须代表种子批的各部分，应从袋的顶部、中部和底部扦取种子。每一容器扦取的重量应不少于表2-2送验样品栏所规定的一半。
表2-11 扦取容器数与临界 H 值（1%概率）
异质性可用下列项目表示。
1.净度分析任一成分的重量百分率 在净度分析时，如能把某种组分分离出来（如净种子、其他植物种子或禾本科的秕粒），则可用该组分的重量百分率表示。试样的重量应估计其中含有1000粒种子，将每个试验样品分成两部分，即分析对象部分和其余部分。
2.种子粒数 能计数的组分可以用种子计数来表示，如某一植物种或所有其他植物种。每份试样的重量估计大约含有10000粒种子，并计算其中所挑出的那种植物种子数。
3.发芽试验任一记载项目的百分率 在标准发芽试验中，任何可测定的种子或幼苗都可采用，如正常幼苗、不正常幼苗或硬实等。从每一袋样中同时取100粒种子按《农作物种子检验规程》（GB/T 3543.4—1995）的条件（表4-1）进行发芽试验。
1.净度与发芽
式中，
N
为扦取袋样的数目；
n
为从每个容器样品中得到的测定种子粒数（如净度分析为1000粒，发芽试验为100粒，其他植物种子数目为10000粒）；
X
为每个容器样品中净度分析任一成分的重量百分率或发芽率；
为从该种子批测定的全部
X
值的平均值；
W
为净度或发芽率的独立容器样品可接受方差；
V
为从独立容器样品中求得的某检验项目的实际方差；
f
为得到可接受方差的多重理论方差因子，见表2-12；
H
为异质性值。
表2-12 用于计算 W 和 H 值的 f 值
如 N 小于10，计算到小数点后2位；如 N 等于或大于10，则计算到小数点后3位。
2.指定的种子数
式中，
为从该种子批测定的每个容器样品中挑出的该类种子数的平均值。
V
和
H
的计算与式（2-3）、式（2-4）相同。
如果 N 小于10，计算到小数点后1位；如 N 等于或大于10，则计算到小数点后2位。
表2-11表明当种子批的成分呈随机分布时，只有1%概率的测定结果超过 H 值。
若求得的 H 值大于表2-11的临界 H 值时，则该种子批存在显著的异质性；若求得的 H 值小于或等于临界 H 值时，则该种子批无异质现象；若求得的 H 值为负值时，则填报为零。
异质性的测定结果应填报如下内容：
、
N
、该种子批袋数、
H
及一项说明“这个
H
值表明有（无）显著的异质性”。
如果超出下列限度，则不必计算或填报 H 值：①净度分析的任一成分高于99.8%或低于0.2%；②发芽率高于99%或低于1%；③指定某一植物种的种子数每个样品小于2粒。