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任何新技术的导入都要面临在观念、组织、制度、业务流程、技术应用、教育培训等各方面进行调整改变的挑战，更何况BIM技术的准入门槛比早期CAD技术的门槛又高很多。然而，挑战与机遇通常是一体两面的，克服挑战的同时也创造了新的可能性与机会，以下简要地列举一些BIM应用带来的挑战与机遇。
建筑工程方案的驱动主要是业主的需求与资金的投入，因此业主对BIM应用具有关键的影响力。但业主通常对BIM应用的了解有限，容易遵循传统思维来看待它，或硬将其套入传统工程作业流程中，甚至由于受到一些误导，在资源投入与准备不足的情况下保持着不切实际的期待，导致BIM应用的效能不仅无法完全发挥，反而产生不必要的额外成本与浪费。因此，如何让业主对BIM应用有一个正确的理解，能制定合理的应用需求与政策，重新分配生命周期各阶段的资源投入，并能重视设施运营维护的效益，仍是现今BIM应用的一大挑战。而与此挑战相对应的机遇则是建筑产业商业模式创新改变的契机，产业中专业间的透明度得以提高，专业间的分工合作及整合模式自然会有所变革，自动化的机会增加，能更有效地处理日益复杂的设施永续发展议题。
建筑产业是民生产业，其中有很大部分是公共工程建设。为了防止弊端，其发包采购制度在生命周期与供应链两个维度常被切割成数个尽可能独立且不甚透明的单元，造成专业责任与分工壁垒分明，增加了合作与整合的难度。而BIM技术强化了建筑工程虚实整合技术应用的能力，可在规划设计阶段，通过在数字化空间的仿真模拟能力，预先解决在施工及运维阶段可能遇到的问题。而在施工及运维阶段则希望通过虚实整合技术（如扩增实境技术）来设计施工，并能掌握充分正确的信息来执行设施的运维工作。因此，要能有效发挥BIM应用的功效，传统的发包采购制度必须有所调整，建筑工程参与者间的分工合作流程也必须有所变革。因牵涉层面广，所需的改变即使得到支持，也难以在短时间内完成。但是若这些改变挑战能逐一克服完成，应不难想象建筑产业会有脱胎换骨的新景象，在兼顾公众利益、产业创新与环境永续下，为年轻后代提供更优质且有发展前景的就业机会。
BIM应用所需的相关技术与工具仍在持续快速发展，且已相当成熟，足以应用在建筑工程中，并逐渐被应用在桥梁、隧道等公共工程中。然而，软件工具的功能开发与专业应用需求间的落差难免存在，且通常需要一段时间通过不断地应用与回馈改进才能持平，且持续会有一些新的需求产生。因此,BIM应用会在克服技术发展不足的挑战中持续精进，工程师必须发挥创造力解决技术问题，甚至自己动手开发工具。这个挑战会为建筑产业与信息产业带来创新动力与机会。
人才是产业发展的关键之一,BIM应用自然面临人才培育的挑战。目前的学校教育虽已逐渐纳入一些BIM相关课程，但还称不上普及与充分，建筑相关专业的毕业生中还有多数没有掌握足够的BIM知识与技能。而在行业中，虽有一些短期的教育培训课程，但培训课时和深度是有限的。此外,BIM教育需要与实践结合才能成功，例如，只会操作建模软件工具，但不具备足够的工程专业与实践知识与经验，所建立出来的BIM模型常不符合应用需求。因此,BIM教育的产学界合作特别重要。另外,BIM教育所需涵盖的对象也很广，包括业主方的主管与工程项目参与者、建筑企业的高层主管、建筑项目经理、工地主管、设计单位的主管与工程师、尚无工作经验的在校学生等，都需要设计不同的教材与课程，也需要足够的时间培养。因此，如何在BIM应用进入快速发展阶段前将所需的人才准备好，才不会限制BIM应用发展，是一个需要及早并严肃面对的挑战，也是BIM应用发展能否成功的重要关键。此挑战也有机会带动学校建筑工程相关教育的变革，满足建筑产业进入BIM时代的需求。