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2014年以来，中国主要农产品的产量、进口、库存连年增长，但物质成本、人工成本、土地成本持续走高，过高的农业生产成本导致农民增收困难，生产补贴政策的发力引发价格倒挂，进一步诱导了进口增加，导致大量库存堆积
。为了应对以上问题带来的风险，“十三五”期间，我国提出了农业供给侧结构性改革，改革的重点是“去库存、降成本、补短板”。具体来说：一是加快消化过大的农产品库存量，加快粮食加工转化。二是通过发展适度规模经营、减少化肥农药不合理使用、开展社会化服务等，降低生产成本，提高农业效益和竞争力。三是加强农业基础设施等农业供给的薄弱环节，增加市场紧缺农产品的生产。农业供给侧结构性改革实施以来，我国农业生产水平稳定发展，农业生产结构逐步优化，综合产能稳步提升，科技支撑显著增强，农业经营方式也在不断完善。
然而，目前我国农业发展仍然面临多重制约与挑战。一是农业生产布局有待优化，目前我国农产品供求关系总体呈紧平衡
。在总量增加的同时，供给端的调整慢于需求端的变化，主粮生产数量基本能够自给，但部分优质、专用品种需要进口调剂。未来随着人口增加和消费结构升级，农产品品种和品质结构矛盾将日益凸显。二是粮食产后社会化服务不健全，绿色优质粮油供给不足，粮食产品低端“大路货”多、高端精品少等问题突出，从田间到餐桌的粮食质量安全保障体系尚未建立，成为制约粮食产业发展的短板。三是耕地质量退化面积较大，抗风险能力较弱，资源环境刚性约束趋紧，农业面源污染仍然突出。四是部分生产经营者质量安全意识还不强，基层监管能力相对偏弱。五是示范区建设积极性不足，农业产业化带动能力不强，农业产业发展水平仍然不高，金融用地支持力度不够。
针对以上问题，“十四五”规划提出要“深化农业结构调整”，农业结构调整是加速实现乡村振兴的主要引擎，在新的历史时期，进一步调整优化农业结构也是在高起点上的主动作为、主动调优。深化农业结构调整，首要问题是总量与质量之间的平衡，需要优化农业生产布局，建设优势农产品产业带和特色农产品优势区。推进粮经饲统筹、农林牧渔协调，优化种植业结构，大力发展现代畜牧业，促进水产生态健康养殖。积极发展设施农业，因地制宜发展林果业。为了解决农产品品种品质与居民消费结构升级之间不匹配的问题，需要深入推进优质粮食工程。推进农业绿色转型，加强产地环境保护治理，发展节水农业和旱作农业，深入实施农药化肥减量行动，治理农膜污染，提升农膜回收利用率，推进秸秆综合利用和畜禽粪污资源化利用，完善绿色农业标准体系，加强绿色食品、有机农产品和地理标志农产品认证管理。强化全过程农产品质量安全监管，健全追溯体系。为了增加农产品附加价值，延长农业产业链，需要建设现代农业产业园区和农业现代化示范区，实施好农产品仓储保鲜冷链物流设施建设工程，加快推进农产品产地市场体系建设，开展多种形式线上线下相结合的产销对接活动，着力提升特色农产品产地商品化处理和流通能力。