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婴幼儿患轮状病毒胃肠炎的潜伏期为2～3天，起病较急，呕吐、腹泻，每天10余次，大便呈水样或黄绿色稀便，有酸臭味。患儿有低热或中度发热，高热者较少。常有轻度腹痛、肌肉痛和头痛。还有部分患儿有流鼻涕、轻咳等上呼吸道感染症状。一般发热及呕吐2天后可消失，但腹泻常可持续3～5天或1周，少数可达2周。如呕吐、腹泻严重可出现脱水、酸中毒和电解质紊乱。
成人患轮状病毒胃肠炎潜伏期为3天左右，常突然出现严重腹泻，大量水样便，伴有呕吐、腹痛、恶心、腹胀、肠鸣、乏力等，发热较少，多数5～6天后缓解，少数持续到2周左右。