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该病的临床特点，除极易被情绪波动、饮食种类或气候改变等因素诱发或缓解外，没有明显器质性改变。病程一般较长，有易于复发或季节性发作的倾向，同时伴有身体其他方面的功能紊乱。实际上，它是神经官能症或胃肠神经官能症的一部分，只是结肠功能紊乱的症状特别突出而已。其临床表现可概括如下：
（1）消化不良：主要感觉是腹胀，这是胃肠运动功能紊乱的一种反应。腹胀多在饭后不久发生，亦有午后加重的倾向，平卧后不能缓解。由于患者常过分关注腹胀，或者由于十二指肠-胃反流而有恶心、呕吐和胃纳减退等症状。
（2）腹痛：肠易激综合征的腹痛是肠道痉挛的一种反应，所以常伴随腹胀发生，以胀痛为主，偶尔亦可表现为绞痛。可以出现在腹部任何部分，但以左下腹为最多，可能与粪便壅积有关，所以在便前疼痛明显，经常在左下腹扪到条索状“包块”。由于腹主动脉搏动的传导，患者常自觉“包块”跳动，排便或排气之后疼痛缓解，“包块”也就不明显了。
（3）排便异常。
（4）神经官能症。