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慢性结肠炎发病年龄以20～40岁居多，据国外报道，在50～60岁有第二发病高峰期。病程长短很不一致，有的发病急骤，然后转为慢性，有的起病缓慢，但可突然加重。整个病程可呈持续性，但也可间歇出现。在急性期阶段，便次较多，常有黏液脓血，有时可呈下消化道大出血表现。腹痛不太剧烈，多在下腹部，部分患者于左下腹部可摸到较为固定的“腊肠样”条索状肿物，为痉挛收缩的远段结肠。严重或病程较长者，常伴乏力、腹胀、贫血及水肿等表现。晚期或急性复发重症患者可出现肠穿孔、肠梗阻及肠瘘等并发症。肠道外并发症可有关节痛、关节炎、强直性脊柱炎、结节性红斑、坏疽性脓皮病、慢性活动性肝炎、眼色素层炎、口腔复发性溃疡、肛周炎、电解质紊乱及低蛋白血症。据报道，其癌变率比正常人高5～20倍，年龄越轻，病程越长，病变范围越广，癌变率越高。病程在5年之内癌变较罕见，10年以上癌变达20%，25年以上癌变高达40%。