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普通器官的构造、特征以及相对差异已经阐述完毕，接下来要论及生殖器官。雌性的生殖器官全部位于体内；雄性的生殖器官千差万别。
在有血动物中，某些雄性的睾丸彻底退化，某些具有该器官，但位于体内；睾丸位于体内的雄性，某些接近腰部，处在肾的范围内，某些则接近腹部。某些雄性的睾丸位于体外。睾丸位于体外的，某些的阴茎与腹部相连，某些则松松垮垮地悬空，与睾丸的情况类似；阴茎与腹部相连的，依据该动物属于前尿向还是后尿向，连接方式各有不同。
鱼类都不具有睾丸，其他动物也不具有鳃，蛇属既不具有睾丸，也没有鳃：简言之，除了本身就是胎生的之外，凡是无足的动物也无睾丸。鸟类具有睾丸，但位于体内，靠近腰部。卵 （蛋） 生四足动物同理，比如蜥蜴、海龟和鳄鱼；胎生动物中唯有刺猬属于此例。睾丸位于体内的其他动物，则睾丸靠近腹部，比如无足动物中的海豚、胎生四足动物中的大象。其他动物的睾丸位于体外，清晰可见。
上面已经提到，这些器官与腹部和相邻区域的连接方式存在差异；换言之，我们所说的是某些动物的睾丸与身体紧密贴合，比如猪及其同类动物，某些动物的睾丸则自由悬空，比如人类。
如上所述，鱼类和蛇属不具有睾丸。不过，鱼类和蛇属有两根输精管与横膈膜相接，沿脊椎骨的两侧分布，然后在残余物出口处上方接合成一条，所谓出口处“上方”是指接近脊柱的区域。在交配季节，这两根输精管会充满精液，一经挤压，白色精液便会流出。关于各种鱼类雄性的差异，读者应参阅拙作《解剖学》，我们之后再描述各种鱼类的具体特征，详细讨论这个主题。
卵 （蛋） 生动物的雄性，无论两足、四足，全都具有睾丸，睾丸靠近横膈膜下方的腰部。某些动物的睾丸偏白色，某些的偏黄色；睾丸由微小的血管完全包覆。两个睾丸各延伸出一根输精管 （比如，鱼类就是如此） ，两根输精管会在残余物出口处上方合二为一，这就构成了阴茎。体形较小的卵 （蛋） 生动物的阴茎不显眼；但体形较大的卵 （蛋） 生动物的阴茎在勃起后清晰可见，比如鹅之类的。
鱼类、两足卵 （蛋） 生动物和四足卵 （蛋） 生动物的输精管在胃部和肠子下方跟腰部相连，处在胃部、肠子和大动脉之间，两根导管或血管从大动脉伸出，各通向一个睾丸。鱼类雄性的精液见于输精管，输精管在交配季节清晰可见，某些鱼类的输精管在交配季节结束后会隐匿不见，鸟类的睾丸同理；交配季节到来之前，某些鸟类的睾丸较小，某些的几不可见，但在交配季节里，所有鸟类的睾丸都会膨大。这种现象最多见于斑鸠和鹧鸪，以至于人们以为这些鸟类在冬天没有睾丸。
睾丸朝前的雄性动物中，某些位于体内，靠近腹部，比如海豚；某些位于体外，一眼可见，靠近下腹部。到目前为止，这些动物在睾丸这个器官上相似；但它们的区别在于，某些动物的睾丸相互分离，而那些位于体外的，则有阴囊包覆。
再次申明，凡有足的胎生动物，其睾丸都具有以下特征。类似血管的导管从大动脉延伸至各睾丸的顶部，另有两根来自肾；来自肾的这两根导管里有血，而从大动脉过来的两根里没有血。另有一根导管始于睾丸顶部，沿睾丸本身分布，比上面提到的那几条更厚实、更有活力，这根导管在睾丸底端弯曲，重新折回顶部；这两根导管从各个睾丸的顶部一直延伸，直至在阴茎前端合二为一。这根导管再次折回，与睾丸接触的部位就包裹在同一层膜内，所以只有拉开这层膜的时候，它们才会显现出单一的无差别导管形态。此外，与睾丸接触的导管内的分泌物由血液改变浓度，但相比上面跟大动脉相连的导管而言，浓度变化较小；向阴茎软管折回的导管里的液体为白色。还有一条导管来自膀胱，其开口处接入导管上部，周围呈鞘状的便称作“阴茎”。
上述所有特征可以配合图示进行理解：图中A表示导管从大动脉向外延伸的起始位置；K表示睾丸顶部以及导管接入的位置；Ω表示从沿着睾丸分布的导管分支出来的导管；B表示折回且含有白色液体的导管；Δ表示阴茎 （男性生殖器） ；E表示膀胱；Ψ表示睾丸；sp.v为精囊静脉；sp.a为精囊动脉；ur．为输尿管。
雄性动物（胎生有脚动物，即兽类）生殖器官
睾丸是雄性动物生殖器官及生殖腺的一部分，是女性卵巢的同源器官，其主要作用是分泌雄性激素（主要是睾酮）和产生精子。
（顺带一提，切除睾丸时，导管会向上收缩。此外，雄性动物幼年时，其所有者有时会通过摩擦来破坏这一器官；有时会在较靠后的时期被阉割
。此处要插一句，据说一头公牛被阉割后立刻与母牛交配，母牛竟然怀孕了。）
以上便是雄性动物睾丸的特征。
凡具有子宫的雌性动物，子宫的构造、特征各不相同，胎生和卵
（蛋）
生存在巨大区别。凡子宫靠近外生殖器的动物，其子宫都有两个犄角
（子宫角）
，左右分列；不过，子宫开端只有一个，子宫口也只有一个，是由大量肌肉和软骨构成的管道，这一点在数量最多、体形最大的动物之间都很相似。在这些部位中，有一个被称作宫体，且由此衍生出“男性”一词，另外一个
（导管或孔口）
叫作子宫口。所有胎生两足或四足动物的子宫都位于横膈膜下方，比如人类、狗、猪、马和牛；有犄角动物同理。在子宫根部称为角
的两处，大多数动物有一个弯曲或盘旋。
雌性动物（兽类）生殖器官——子宫
从鱼类到哺乳动物的单孔目动物都具有卵生或卵胎生性子宫，哺乳类有袋目以上，才有胎生性子宫；胎生性子宫是胎儿生长发育的场所，由左、右输卵管末端膨大或愈合膨大而成。
下蛋的卵生动物的子宫位置并不相同。鸟类的子宫靠近横膈膜，鱼类的子宫较为靠下，类似于两足和四足胎生动物，唯一的区别在于鱼类的子宫构造精细，呈膜状，较长；以至于在体形特别小的鱼类中，一分为二的两个部位各自就像一颗蛋，“蛋”易碎的那些鱼类体内仿佛有一对“蛋”，而实际其体内两侧各不止一颗“蛋”，而是有很多，说明它们会分裂成如此之多的颗粒。
鸟类子宫下部的管状物肌肉较多，十分结实，靠近横膈膜的那部分则为膜状物，薄而精细：以至于卵看起来仿佛处在子宫之外。对于体形较大的鸟类，这层膜较为明显，通过管状物充气后，会抬升肿胀；对于体形较小的鸟类，所有这些部位都比较不明显。
卵生四足动物的子宫特征大致相同，比如海龟、蜥蜴和青蛙等；下方的管状物只有一个，多肌肉，带有卵子的裂口区位于顶部，紧邻横膈膜。无足的胎生和卵生动物，比如狗鲨以及所谓的软骨鱼 （指无足、具有鳃的胎生动物 ），其子宫一分为二，一直延伸至横膈膜，鸟类就属于此例。子宫角还有一狭窄处，直通横膈膜，卵子在此处以及横膈膜起点上方产生，然后进入子宫较为宽阔的区域，从卵子变成幼体。不过，相比同一品种或广义上的鱼类，通过解剖不同形态的样本才能更好地研究这些鱼类的差异。
狗鲨
狗鲨（Chiloscyllium plagiosum）又名点纹斑竹鲨，其形体呈圆柱形或稍平扁，长细而狭。它们主要栖息于沿海有海藻丛生的珊瑚礁区，常栖息于潮间带，活动缓慢，蛰伏于礁区附近海床，在离水后可存活约12小时，以底栖动物为食。
蛇属动物与上述动物存在差异，种群之内也存在差异。一般而言，蛇是卵
（蛋）
生，唯有蝮蛇属于胎生。蝮蛇在体内产卵，在体外分娩；由于这种特殊性，蝮蛇的子宫特征与软骨鱼的相似。蛇属的子宫较长，与躯干相称，起源于底部，一根导管沿脊椎两侧不间断分布
（给人以脊椎两侧各有一根导管的印象）
，直至横膈膜，卵在此处成排产生；卵并不是逐个产出的，而是串联在一起。
（体内胎生、体外胎生的所有动物，其子宫都处在胃部上方
，所有卵生动物的子宫都处在胃部下方，靠近腰部。体内产卵、体外分娩的动物，其子宫位置介于上述二者之间：子宫底端——卵所在位置——处于腰部附近，但子宫口处于肠子上方。）
此外，互相对比来看，子宫之间还存在以下差异：也就是说有角雌性动物的子宫内有胎盘，动物怀孕后，子宫内会形成绒毛叶，而在所有的双齿、胎生、有足动物中，比如野兔、鼠和蝙蝠，其子宫较为平滑，胚胎与子宫本身相连，而不是和子宫内的绒毛叶相连。
本身性质相异、结构相同的器官，包括内部器官和外部器官，都具有以上所述特征。