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气穴，指脏腑经络之气输注出入的穴位，即人体经络上的穴位，见于《素问·气穴论》等篇。气府，是各经脉之气所发的穴位，也是各经脉之气交会之处，见于《素问·气府论》。
人体有多少个穴位呢？《素问·气穴论》指出，有三百六十五个穴位。其云：“气穴三百六十五以应一岁。”
人体除了有十二经脉，还有孙络，人体的孙络与三百六十五穴相会，所以孙络也与一岁相应。孙络是从经脉别出的，如果经脉的血气盛就能够泻注于络脉，络脉也有三百六十五脉，都贯注于十四络脉，孙络的作用是驱散邪气，使荣卫畅通。如果感受外邪，就尽快用泻法针刺孙络。
人体小的肌肉与肌肉汇聚之处叫溪，人体大的肌肉与肌肉汇聚之处叫谷，所以，溪和谷，也统称溪谷。溪谷能通行荣卫之气，并与宗气会合；如果寒邪留滞溪、谷，荣卫之气运行不畅则筋脉肌肉挛缩，肋肘不能伸展，肌肉麻木不仁，发为骨痹；溪谷与三百六十五穴相会，也与一岁相应。《素问·气穴论》云：“肉之大会为谷，肉之小会为溪……溪谷三百六十五穴会，亦应一岁。”
三百六十五个腧穴，也是临床诊治疾病时的针刺穴位，平日保健按摩时，也可以选择能够到的穴位自行按摩。在临床上，还有一种穴位，叫“阿是穴”，即哪里痛就针刺哪里，当医生按到了病人的痛处，病人立即喊：“啊—是”，“阿是穴”的名称就是这么来的。《灵枢·经筋》篇中的“以痛为腧”的针刺方法，就是针刺“阿是穴”，“阿是穴”至今仍广泛有效地应用于临床。
气府，是各经脉之气所发的穴位，也是各经脉之气交会之处。虽然气府是腧穴，但是，它不同于一般的腧穴，它既是脉气所发之处，又是各经脉之气交会之处；既有本经的腧穴，又有他经的腧穴；可见，经脉与经脉之间还存在着经气交会。由于腧穴是经脉之气汇聚之处，能反映脏腑经络气血的病变，故针刺此穴能调整脏腑经络气血的病变，在《素问·气府论》中有记载，足太阳经脉之气所通达的穴位有七十八个，足少阳经脉之气所通达的穴位有六十二个，足阳明经脉之气所通达的穴位有六十八个，手太阳经脉之气所通达的穴位有三十六个，手阳明经脉之气所通达的穴位有二十二个，手少阳经脉之气所通达的穴位有三十二个，督脉之气所通达的穴位有二十八个，任脉之气所通达的穴位有二十八个，冲脉之气所通达的穴位有二十二个。气府能反映脏腑经络气血的病变，故针刺此穴能调整脏腑经络气血的病变。
人体骨节与骨节交汇之处的缝隙，即骨孔，也称“骨空”，全身的骨孔也分布着许多腧穴，这些穴位是人体气之所在之处，也是人身之气穴，是诊治疾病的要穴。例如，感受风邪，寒战汗出，颈项痛，头痛，身体重，恶寒，应刺第一颈椎上间的风府穴；感受大风而汗出的，应灸脊背上方第六胸椎棘突下，旁开三寸处
穴；受风恶风的，应刺眉头的攒竹穴；落枕的，应刺肩上横骨间的肩井穴；腰痛不可以转摇牵引睾丸的，应刺尻骨孔隙中的八髎穴；瘰疠、鼠疮发寒热的，应刺膝关节上外侧骨缝中的寒府穴。
任脉起于会阴，上行毛际，循腹里上行关元上至咽喉，上颐部循面部入目中。冲脉起于气街，与足少阴肾经并行，夹脐上行，布散于胸中。任脉发生病变，在男子则病结于内而成为七疝，在女子则成为带下病和癥瘕积聚之病。冲脉发生病变，则逆气上冲，腹部拘急。督脉发生病变，则脊柱强硬反张。
督脉发生病变的，取横骨上缘的曲骨穴；病逆气上冲咽喉的，取夹颐的大迎穴；膝关节屈伸不利的，取股部的髀关穴；坐下而膝关节疼痛的，当取环跳穴；站立时膝关疼痛并感到骨缝发热的，应取阳关穴；膝痛牵引足大趾的，应取腘中的委中穴；坐而膝痛如有物隐藏的，应取髀关穴；膝痛不能屈伸的，应取背部足太阴的腧穴；若膝痛牵引髎骨其痛如折，可取阳明经中的俞髎（即足三里穴）。
再如，治疗水肿的五十七个孔穴，均分布在尻骨、颅骨边际、脊骨下孔、两肩、臂骨、腕骨、桡骨、股骨、尻骨、扁骨等骨缝或骨与骨之间的缝隙中，详见《素问·骨空论》。
灸法选取的穴位，很多也是在骨与骨的缝隙中取穴。例如，《素问·骨空论》指出，治外感发热恶寒，先灸项后的大椎穴，再灸尾骶骨端。寻找灸的穴位时，宜先观察背部的腧穴，在有凹陷的穴位灸之；举臂时，在肩上有凹陷处，可灸；两季胁间京门穴，可灸；外踝上绝骨之端阳辅穴，可灸；足小趾和四趾间侠溪穴，可炙；腨下凹陷处承山穴，可灸；外踝后昆仑穴，可灸；缺盆骨上按之痛坚处，可灸；膺上中央陷骨间的天突穴，可灸；掌横骨下阳池穴，可灸；脐下关元穴，可灸；毛际两旁气冲穴，可灸；膝下三寸两筋间三里穴，可灸；足阳明胃经足跗上冲阳穴，可灸；头顶百会穴，可灸；被犬咬的，就在犬咬之处灸三壮，按照治犬咬之法灸之。