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在临床上有四个极端的免疫系统问题。
常因免疫系统的辨识功能出现异常，导致自己攻击自己而产生自身免疫抗体，进一步造成体内伤害的产生，整体来说和免疫力的调控异常有关。
●复发性口腔炎
●类风湿性关节炎
●系统性红斑狼疮
免疫力不全又可分为先天免疫疾病和后天免疫疾病两类。其中先天性免疫疾病主要分为5类，这些先天免疫细胞的缺损，因在婴幼儿时期发病而被诊断出来。至于后天免疫力不全，最广为人知的即为艾滋病，艾滋病的病毒攻击T淋巴细胞，导致T淋巴细胞的功能受阻碍、体内免疫功能下降；另外，部分癌症病人进行化疗的副作用也会导致免疫系统受到压抑。
引发癌症的确切原因尚未明朗，但西医学认为这与免疫的调控能力出现异常有关，中医学认为癌症的产生可能与机体阴阳失衡有关。
现今有过敏问题的小朋友与大人都不在少数，无预警的突然发作也容易给日常生活造成困扰。饮食喂养不合理导致脾土长期受损、遗传因素、情志受伤等都是过敏性疾病高发的原因。
