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“卫气”的功能不仅仅是抵御外邪，在《内经》的理论中，内伤杂病的发病，也与卫气有关。例如：
“ 肠覃何如 ？ 岐伯曰 ： 寒气客于肠外 ， 与卫气相搏 ， 气不得营 ， 因有所系 ， 癖而内著 ， 恶 气乃起 ， 瘜肉乃生 。 其始生也 ， 大如鸡卵 ， 稍以益大 ， 至其成 ， 如怀子之状 ， 久者离岁 ， 按之 则坚 ， 推之则移 ， 月事以时下 ， 此其候也 。”（《灵枢经·水胀》）
按： 该篇经文在于阐释内伤杂病中水、肤胀、鼓胀、肠覃、石瘕、石水6种以腹部肿大为特征疾病的发病机制与鉴别。文中“肠覃”（cháng tán，或读cháng qín），指腹部肿块。“瘜肉”，同“息肉”。