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本研究主要运用协同理论、系统耦合理论、点-轴系统理论等作为研究的理论基础。主要运用这些理论，以重庆市为研究对象，通过耦合度模型、耦合协调度模型构建对重庆市交通运输业和旅游业两大产业的发展水平，以及两大产业间融合发展水平进行测度分析，找出交通运输业和旅游业两大产业发展以及两大产业间融合发展的问题，提出交通运输业和旅游业两大产业间融合发展战略。
协同理论，也被称为协同学，是20世纪70年代以来在多学科研究基础上逐渐形成和发展起来的一门新兴学科，是系统科学的重要分支理论。协同理论由德国斯图加特大学著名物理学家哈肯（Hermann Haken）教授创立。1971年哈肯教授提出了协同的概念,1976年他发表了《协同学导论》，系统地论述了协同理论。
协同理论主要研究远离平衡态的开放系统在与外界有物质或能量交换的情况下，如何通过自己内部协同作用，自发地出现时间、空间和功能上的有序结构。协同理论认为，千差万别的系统，尽管其属性不同，但在整个环境中，各个系统间存在着相互影响、相互合作的关系。其中也包括通常的社会现象，如不同单位间的相互配合与协作，部门间关系的协调，企业间相互竞争的作用，以及系统中的相互干扰和制约等。
协同理论指出，在整个环境中，尽管各个系统在属性上非同，但它们之间仍具有相互影响、相互作用等关系，即协同作用。这种协同作用能使系统在临界点发生质变产生协同效应，使系统从无序变为有序，从混浊中产生某种稳定结构。
产业间的协同发展，要求各个产业在发展过程中产生促进、影响、耦合的互动关系，通过这种互动关系促使产业间实现资源优势互补、耦合互动，进一步发挥出“1+1>2”的协同效应。对于旅游业与交通运输业的协同发展而言，旅游业与交通运输业相互促进、相互影响，协调发展，最终会产生“1+1>2”的效果，对国家或区域的社会经济发展有着极其重要的意义。
耦合本是物理学概念，是指多个系统或多种运动方式之间，通过彼此之间的各种相互作用而彼此影响以至协同一致的现象。
耦合本身是一种互动与变化，是指两个或两个以上的系统或运动形式之间，通过相互作用而彼此影响，通过子系统而发挥相应的作用，进而相互促进、相互协调、相互依赖，以至联合起来的一种现象。
系统耦合是指两个具有相近相通，又相差相异的系统，不仅有静态的相似性，也有动态的互动性，两者就具有耦合关系。人们应该采取措施对具有耦合关系的系统进行引导、强化，促进两者良性的、正向的相互作用、相互影响，挖掘两者内在潜能，从而实现两者优势互补和共同提升。
近年来，基于耦合概念的应用和延伸，逐渐形成“产业耦合”的概念，产业耦合是指两个或两个以上的产业在经由产品研发、生产要素、技术创新、市场资源等因素的耦合形成了一个相互融合、相互影响的系统。在经济学领域中，“产业耦合”已经被应用到较多的实证研究中，形成日渐成熟的理论体系。通过打破产业间的界限、融合产业链，实现产业之间的水平或垂直连接，资源配置得到优化，最终达到协调发展，从而促进社会经济的发展。
旅游业与交通运输业同是国民经济中的重要系统，两者之间同样存在耦合互动关系。随着交通运输业的发展，旅游目的地的交通可达性得到改善，促使旅游者和旅游产业相关资源的集聚，从而推动旅游业的发展；旅游业的发展，对交通运输业也提出了量和质的新需求，从而促进交通基础设施的建设和交通运输服务水平的提高，进而推动交通运输业的发展。因此，旅游业与交通运输业作为高相关、高互动、高影响的产业，二者的协调发展对促进旅游业与交通运输业的持续健康发展具有重要意义。
中国地理学家陆大道院士1984年首倡点-轴系统理论。点-轴系统理论中的“点”是指一定区域内各级中心城市，是人口和各种职能集中的地方，是区域内重点发展的对象；“轴”是交通、通信干线和能源、水源通道连接起来的“基础设施束” [1] 。
点-轴系统理论认为在社会经济中各个客体总是处于在区域或者空间范畴的相互作用中。该理论直观地描述了在区域发展过程中，社会经济中的大部分要素在区域或空间结构上的演变过程，要素集聚形成“点”，线状的基础设施连接在一起形成“轴”，“点”与“点”通过“轴”相互串联、相互沟通，同时“轴”本身也会吸引周围的社会资源，当集聚形成一定规模时，最终形成“面”。这种由“点”到“轴”、由“轴”到“面”的发展模式，是当下区域经济活动所呈现的最高形式。区域经济的发展由于受到“点—线—面”机制的作用力，在其区域空间结构上不再只是由单一核心驱动，而是转向多节点聚集共同驱动，区域随之具有巨大的经济潜力。
近年来，在旅游产业发展以及旅游规划开发中，点-轴系统理论被广泛应用。其中“点”表示区域中的旅游节点，“轴”则表示交通线路。在旅游业发展中，由各种经济要素通常在重点旅游资源所在地聚集后形成“点”，经过各种交通线路的连接后形成“轴”。轴线随着交通发展而延伸时，部分次一级的城镇或旅游景区、景点也逐渐发展起来，就这样以点带线、以线带面，使区域旅游产业得以网络化、规模化发展，通过旅游产业带的不断形成最终达到旅游产业集群。