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本书将应用微生物学与工业、农业、发酵、环境和能源等生产实践知识有机地融合在一起；按照“简明精练、好教易学、注重技术、特色突出、新颖实用、质量第一”的总体要求，强调系统性、先进性、通用性和稳定性，反映生物技术（工程）新知识、新成就。全书共6章，包括绪论，应用微生物与发酵食品，应用微生物与酶制剂，微生物引起的食品变质，应用微生物的水处理，应用微生物与环境污染生物修复。
本书可作为高等院校生物技术专业、生物工程专业，包括师范类、工业类及农林类等院校本科生教材，也可作为其他生物相关专业教材，并可作为相关科研人员掌握微生物应用知识的参考用书。