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实施区域卫生规划的主要目的是通过合理筹集和配置全社会的卫生资源，使人们在利用有限的卫生资源时能够最大程度地体现公平与效率。
如何理解卫生领域的公平？大家知道，人们的卫生服务要求是无限的，而卫生资源是有限的。从经济学上看，满足所有人的卫生服务需要和需求都是不可能的。由于人们自身体质和条件存在较大差异（包括健康要求和收入不同），因而要求人们同样地消费卫生服务是不合理的。在卫生领域不同的人和不同的人群之间卫生服务消费存在巨大差异，这种差异是卫生服务覆盖或社会经济状况差异造成的，是否可以被解释为不公平？这要取决于他们是否能够获得最低水平的卫生服务消费或是否具有最低水平的身体完好状态。尽管不同的人群卫生服务消费不等，但只要他们都具有可接受的最低卫生服务保障，那么就可以说具有较好的公平性。因此，不同的人具有不同的卫生服务消费水平不是不公平，仅是不平均，只有个人或人群的卫生服务消费低于社会可接受的水平，才是不公平的。
关于卫生领域的公平可以从下面几个方面来看：一是健康状态的公平，指社会不同人群的健康差异。二是卫生服务可及性的公平，指每个人在遇到同样的健康问题时具有同样的可能来获得同样质量的卫生服务。三是卫生服务提供的公平，指需要卫生服务较多的人群应获得较多的卫生服务。四是卫生筹资的公平，即具有同等支付能力的人应对卫生服务给予同等的支付；对于不同支付能力的人，其支付水平应有与其支付能力呈正相关，也就是具有较高支付能力的人应多支付。五是政府卫生投入分配的公平，指是否最需要卫生服务而又无力支付的人首先能够获得基本卫生服务，即政府卫生投入应使经济收入低的人受益。
如何理解卫生领域的效率？这里首先应了解配置效率和技术效率的概念。配置效率是指资源配置可达到最大利益的程度，它要求一种经济系统尽最大可能为其成员提供最需要的一定数量和种类的产品和服务。根据经济学原理，当资源的配置符合配置效率时，任何对于目前产出结果的数量或种类的改变都会使一些人得益的同时使另一些人受损。技术效率是指选择能够以最低价格提供指定卫生服务的资源配置，即在固定投入的基础上获得最大的产出。要使卫生资源获得最大程度上的效率，就必须使卫生资源在宏观上具有配置效率和在微观上具有技术效率。