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对长江三角洲地区交通运输系统的回顾，表明在资源相对不充足的情况下，本地区的运输系统承担了大量的运输任务。下面对三种主要运输方式所存在的主要问题以及五个综合性的关键问题作一小结。
公路
由于公路路况差，且运价要高于铁路和水路运输，因此长江三角洲地区的公路仅承担少量的长途客货运输。由于铁路覆盖面的限制和运输能力的严重不足以及服务特点的不同，长途公路运输最近几年开始逐步上升。长江三角洲地区未来铁路网的项目（包括本研究建议的项目）不多，将来的经济发展可能比现在更为分散，这对长江三角洲地区公路的客货运输，将产生新的需求。
按国际标准，目前公路运输只起到相当小的作用，但通过公路网的升级，车队的更新、货运包装和装卸技术的提高，以及开发舒适便捷的旅客服务，对公路运输将会带来相当大的区域需求。由于现有许多公路网的能力有限和路况较差，加上机动车辆马力偏低和行人、自行车等混合交通，使状况不断恶化。这就要求中国和长江三角洲地区在近十年内必须加速发展公路系统。
中国公路部门从组织机构上来说是良好的，但存在应付未来快速发展变化所需要的能力问题。中国不同于发达国家，它面临着公路系统的大量扩展，而发达国家对新公路的开拓是少量的，主要是对公路的维护和等级的提高。
铁路
对全世界的铁路运营来说，主要问题是如何保持业务发展，防止其它运输方式争夺自己的市场。铁路管理的焦点一般是通过采用新技术、降低劳务成本、改组管理机构和提高管理效率，达到提高生产能力、经济效益和降低成本的目的。
在中国，情况恰恰相反，铁路能力不足的矛盾尤其突出，结果是无法满足由经济增长引起的不断持续增长的货运和客运需求。由于主要干线和支线里程有限，列车数量不足，铁路运输受到严重制约。长江三角洲地区 50 %以上的区段能力利用率在 80 %以上，某些区间已达 100 %。由于堵塞，列车无法顺利通过枢纽。铁路货运增长率很低，说明目前货运需求受到抑制。由于铁路运输能力不足，致使某些工业生产完不成指标。客运需求受到抑制的程度可能比货运更严重。随着个人收入的提高，客运需求可能迅速增长。
按国际标准来评估，现有铁路运营状况良好，这可从各种运营指标中得到反映。某些运营方法尚有改进余地，例如提高线路维护的机械化程度，但这些措施不可能提供足够的运能来满足未来的需求。因此，通过对现有线路的电气化、复线改造和新线建设，提供更多运能，是解决问题的根本措施。
水运
尽管目前长江三角洲地区的内河水运系统能够满足运输需求，但有些地区存在制约因素，主要是由于大部分的航道等级偏低和小船太多的缘故。这需要有一个长期的计划将水运网等级提高到一个统一的标准。此外，改善运营和采用先进技术也能增加运网能力，使之既能维持目前的需求，又能适应将来的需求。
目前水运的一个主要问题是运输统配物资的船舶运力不足。在中短期内，使用合适的船舶会缓和这种能力不足的矛盾，因此要优先更新相应的船只。然而大部分国营的运输企业由于运输统配货物的运费低，不可能获得足够的利润来更新船舶，更新计划受到制约。这样，使得运营者很少在提高航道等级的同时改进他们的船只。在长期缺少更改资金的情况下，如运营者无力对航道等级的提高作出相应的反映，那么，提高航道等级的价值就必须加以斟酌。因此投资时需要对航道建设与船舶改造进行综合考虑。有时因为通过对船舶的改进，有可能推迟运河、船闸的改造，尤其是那些拥挤的航段。
总之，要加强对内河干线运网的整治，使之达到统一标准。运输企业也要加快对船舶的改造以充分利用改善了的航道条件。这些工作大都要大航运企业来做。鉴于目前这些企业缺乏更改资金，因此基础设施的改造与船舶的更新，需要和运价的改革结合起来。
在港口系统中，经营管理是一个主要问题，各个管理层次都存在这一个问题，在基层装卸单位这一问题可能轻一些。有些泊位有时只能取得泊位设计能力的 50 %—70 %，这就是港口经营管理系统存在的问题，这些问题可通过协调的方法及经济手段，消除各种障碍，使泊位达到合理的技术能力。
五个关键问题
长江三角洲地区运输方面目前存在的关键问题是：
·运输能力不足。
尤其是铁路基础设施差，V/C率和基础设施使用强度都比较高，例如上海至北京铁路线每天运行37 对客车，另外最大区段货运密度达 7200 万吨/年，许多公路和港口，交通运输量超过了设计能力。有限的运输能力压抑了客货的流动和经济的增长。此外，本地区没有应急能力来对付突发事变的需求。
·投资不足。
按在国民生产总值中所占的比例来比较，长江三角洲地区交通运输基础设施的投资不到其它发展水平相近国家的一半。以往的投资低，使现有基础设施的利用率逐日上升，随着需求不断增长和目前基础设施利用率的不断提高，现有基础设施在将来的利用余地也就不多了。
·运价不合理。
现行的运价结构和低运价进一步加剧了投资问题。现行运价一般都不能足以回收资本成本，第七章将按经济价格来推导运价，推导出的运价将说明现行运价和运营成本不能始终鼓励人们有效地使用运输系统。
·运输设备落后。
目前车辆和船舶一般比较陈旧，技术老化，部分原因是低运价妨碍了对设备的投资。内河航道标准低，小型驳船占优势（甚至在宽阔的航道上也是如此）。卡车的平均载重能力也较低。
·改善运输经营管理。
目前的运营管理是从过去的计划经济环境和运输需求快速增长中发展过来的，有必要继续改善经营管理以提高经营效率和灵活性。因此，配套发展目前的经营管理信息系统也就显得非常重要。