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为了规范建筑工程施工发包与承包计价行为，维护建筑工程发包与承包双方的合法权益，促进建筑市场健康发展，2001 年 10 月 25 日原建设部以 107 号部令发布《建筑工程施工发包与承包计价管理办法》。107 号部令的相关规定源自 1999 年 1 月 5 日建设部发布的《建设工程施工发包与承包价格管理暂行规定》（建标〔1999〕1 号）。107 号部令自实施以来，对规范建筑工程施工发承包阶段，乃至实施、竣工阶段的计价行为起到了积极的促进作用。随着相关法律法规和标准规范的发布实施，部分内容显得比较滞后，为了适应建设市场和工程造价管理改革的需要，2009 年 6 月住房城乡建设部启动了《办法》修订工作。
在广泛调研的基础上，住房城乡建设部标准定额司会同法规司梳理了修订的主要内容，组织召开了《办法》修订工作大纲审查会，明确了修订的基本原则，并提出了具体的内容、时间、人员等要求。2009 年 9 月至 2010 年 3 月针对修订的主要内容，多次组织召开了专题研讨会，通过研讨确立了《办法》要完善工程量清单计价及其配套制度、解决工程款拖欠问题、推进全过程造价管理实施和工程造价纠纷调解制度等，经过反复研究和修改后完成了《办法》修订初稿。2010 年 6 月修订初稿送法规司后，法规司会同标准定额司进行了讨论修改，形成了征求意见稿，于 2010 年 7 月送部门和地方征求意见。根据各方意见，法规司会同标准定额司对征求意见稿逐条讨论修改。鉴于《办法》技术性强，涉及面广，法规司和标准定额司形成第二次征求意见稿，于 2012 年 11 月再次送国家发展改革委、财政部和各省（区、直辖市）建设行政主管部门征求意见。2012 年 12 月、2013 年5 月，法规司和标准定额司先后在南宁、北京召开座谈会，听取地方建设主管部门（包括工程造价管理机构）、建设单位、施工单位、咨询企业、法律专家等的意见，重点讨论了最高投标限价、招标代理机构、合同价款约定方式、国有投资工程的竣工结算审核等问题。2013 年 11 月 28 日，住房城乡建设部第 9 次部常务会审议通过了《办法》草案，2013年 12 月 11 日，住房城乡建设部以第 16 号部令向社会正式公布了修订后的《建筑工程施工发包与承包计价管理办法》，并自 2014 年 2 月 1 日起正式施行。