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环境影响经济评价一般遵循以下四个步骤：
第一，识别和筛选环境影响。从识别出来的全部环境影响中，筛选出重要的、可能被量化和货币化的外部环境影响。经过筛选过程后，全部环境影响将被分成三大类：一类环境影响是被剔除、不再做任何评价分析的影响，如那些内部的环境影响、小的环境影响以及能被控抑的影响等；另一类环境影响是需要做定性说明的影响，如那些大的但可能很不确定的影响、显著但难以量化的影响等；最后一类环境影响就是那些需要并且能够量化和货币化的影响。
第二，量化环境影响。对筛选出来的环境影响进一步量化。如项目排放的污染物会在多大范围内引起大气污染物浓度多大幅度的变化，该污染物浓度的升高会影响多大规模的人群的疾病发病率和死亡率的多大变化。在许多情况下，环境影响评价中对环境影响的量化仅限于排放污染物的数量和浓度，没有进一步量化污染对受体（人群健康、工农业生产、自然福利等）的影响程度。在环境影响经济评价中，需要进一步量化项目污染对受体的影响大小。
第三，环境影响的价值评估。即评估出环境影响的货币化价值，这是环境影响经济评价中最关键的一步，也是环境影响经济评价的核心。需要应用特定的环境价值评估方法，评估出环境影响的经济价值。
第四，将环境影响的经济价值纳入项目经济分析。这是环境影响经济评价的最后一步，把环境影响经济价值纳入项目经济分析，以判断项目的这些环境影响将在多大程度上影响项目的可行性。例如，将环境影响的价值纳入项目经济分析后计算项目的净现值和内部收益率，看其是否显著改变了项目财务分析得出的相应评价指标值，在多大程度上改变了原有的可行性评价指标，将环境成本纳入项目的经济分析后，看其是否使得项目变得不可行，以此判断项目的环境影响在多大程度上影响了项目的可行性。
环境影响经济评价中的核心方法是环境影响价值评估方法，也称环境价值评估技术。环境经济学发展出了一系列非市场物品的价值评估方法，用于评估环境影响的经济价值。如旅行费用法，用于评估景观游憩价值；隐含价格法，用于评估房地产周边环境的价值；意愿调查法，用于评估大气污染造成损害的价值等。本书第三章将对环境价值评估方法做进一步介绍。
在评估环境影响的经济价值时，评价人员迫切需要诸如单位景观价值、单位污染损害价值、单位健康损害价值、统计生命价值等参数。有了这些参数，环境影响经济评价就有了统一的评价尺度，评价工作也更容易开展。