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公司有效的内部控制可以保障会计信息系统运行，遏制管理层机会主义行为。如果审计师能够证实会计记录工作是按照有效内部控制系统进行的，那么他就可以将系统执行的结果视为正确（Brown，1962）。虽然早有相关审计理论的动员，但遗憾的是在实务中审计师虽然不断地改善抽样技术，但始终未能有效地将它与内部控制评价联系起来（文硕，2018）。
21世纪初的美国安然财务造假事件促使SOX法案诞生，并采用对上市公司实施内部控制审计的方式来保证公司内部控制以及财务报告系统的有效性，并应对舞弊行为的发生。2010年，中国五部委发布了三项指引，规定上市公司应聘请会计师事务所对公司内部控制的有效性进行评价并出具审计意见。至此，在中国上市公司中开始分批实施内部控制审计；同时，学术界也逐渐开始重视对内部控制审计的研究与探讨。其研究主要集中在内部控制审计与财务报表审计（财报审计）的关系、内控审计的影响因素和经济后果等几个方面。