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由于有关心理的生理基础的知识，最初是在医学中发展起来，在这里简单地说到古希腊的医学。
在希腊之前的埃及和巴比仑，医学已有相当成绩，已经不是完全受宗教观念的支配。希腊人接受了这些国家的医学遗产，加以推进；在公元前六世纪，医学成为哲学和自然科学的一个部门。不少哲学家也是医学家或知医的人，如恩培多克勒和德谟克利特都是医学家。这里略述公元前六世纪末期至前四世纪初期的两个希腊医学家的医学学说，以见当时医学发展的一般状况。
阿尔克美恩（Alcmaeon，公元前500年前后），据说是西方第一个从事解剖动物的人；他发现视神经和中耳管，并曾用孵过的鸡卵观察胚胎的发展。
古代巴比仑的医学家已经把人体看作小宇宙，以与大宇宙相比；阿尔克美恩也以为人体反映大宇宙的结构。他以为人体含有对立的性质，对立者有适当的混合和平衡，人就健康，不然则人生病。阿尔克美恩这个看法大概是来自毕达哥拉斯学派。
阿尔克美恩认为脑是感觉和思维的器官；感觉和思维都是由于脑中的细微的观察不到的运动。他尝试解释睡眠，以为睡眠是由于脑中血管里的血液退到体内大的血管里去；血液再进到脑里，人就醒来。恩培多克勒在阿尔克美恩之后，他以为感觉是由于外物的流出进入感官的孔道之说是出于阿尔克美恩。
希波克拉底（Hippocrates，约公元前460—前370）吸收前人的医学成就，长于外科手术，并且善于诊断和治疗。他被称为西方医学之父。
希波克拉底认为一切病都是由于自然的原因，与神无关。流传下来的他的全集
中有一书名为《论圣病》，是专论羊痫疯的，因为当时人相信羊痫疯是与神圣有关的病。这部书开头就说，“我要讨论所谓神圣的病。我的意见以为这个病并不比其他的病更神圣、更高洁，而是有个自然的原因的。人们假定它有神的来源是由于人们没有经验，以及对它的特殊性质的惊奇。”最后，他说：“事实是这样：这个病的原因也像那些一般比较严重的病一样，是在于脑。”
希波克拉底以为脑是心理的器官。他说，“是由于脑，我们思维，理解，看见，听见，知道丑和美、恶和善、适意不适意”。他又说，“是由于脑，我们变成疯狂，我们发作谵妄，我们为恐怕和震怖所侵袭”。
在希波克拉底以前，大约已经由恩培多克勒人体含四根之说发展为人体含四液之说。希波克拉底又加以系统化。他以为人体内有四种液体，粘液生于脑（是水根），黄胆汁生于肝（是空气），黑胆汁生于胃（是土根），血液出于心脏（是火根）。他以为羊痫疯是由于脑失去了粘液。
他在《论人的本性》一书中说，正是这四种体液“形成了人体的性质”，而且“当这些元素〔体液〕在复合上、力量上、体积上，彼此没有适当的比例，并当这些元素有一种太多或太少，或在体内孤立而不与一切其它元素结合之时，人就感到痛苦”。他这个以为健康由于几个体液的相对量适合的看法是对阿尔克美恩关于健康的学说的继承和发展。后来人以为希波克拉底将人分为四种气质（情感表现的不同倾向）。按希波克拉底的原意，含义很广泛，是指四液的配合决定了人的整个体质（当然也包括气质），但不是单指现在心理学所谓气质。
希波克拉底全集中有一书名为《论水、空气和地域》，主张地理环境、气候等等决定人的体质及民族的心理特性。这可以说是后来西方的地理决定民族性这个错误学说的先驱。
从当时的科学水平（如没有显微镜、化学、电学，等等）来看，阿尔克美恩和希波克拉底对于心理的物质基础的见解是进步的，而希波克拉底对于疾病和心理现象的唯物主义观点是尤其值得注意的。