舒明大王即位后,立宝皇女为王后。宝皇女是敏达大王的曾孙女,曾经是高向王(用明大王之孙)之妻,后再嫁舒明大王。宝皇女与舒明大王共育有二男一女。
舒明二年(630)八月,倭国首次向唐王朝派出了使节。与朝鲜半岛的三国相比,倭国的遣唐使首发时间晚了十年左右。 倭国的第1任遣唐使是犬上御田锹(亦表记为犬上三田耜)、药师惠日等人。犬上御田锹一行于631年抵达唐王朝,向唐太宗献上了方物。对于远道而来的倭国遣唐使,唐太宗“矜其道远,敕所司无令岁贡” ,并派遣新州刺史高表仁出使倭国。然而,出使倭国的高表仁,却因为“无绥远之才,与其王争礼,不宣朝命而还” 。从倭国的视角来看,争礼之事似乎并不仅是唐使与倭王之间个人争执的问题,而是与当时倭王权对唐的对等性外交意识有关。 其后,在20余年时间里,倭国都再也没有向唐王朝派遣使节,与唐王朝的国交处于中断状态。
舒明大王时期,继续推行兴隆佛教的方针。推古三十一年(623),随遣隋使前往中国留学的学问僧惠齐、惠光以及药师惠日、福因等人,在中国经历了隋唐王朝的交替以后,返回倭国,曾上奏并建议推古王权:当时滞留在唐王朝的倭国遣隋留学生、学问僧都已完成学业,应该唤他们归国。但是,直至舒明大王时代(629—641),学问僧灵云、僧旻、惠隐、惠云、清安(南渊请安)以及学生高向玄理等遣隋的留学生和学问僧才陆陆续续地返回倭国。其中,僧旻、惠隐、清安(南渊请安)和高向玄理都是推古十六年(608)前往隋王朝,在中国滞留时间长达20年以上甚至30年以上。 他们为倭王权带来了有关中国佛教的最新信息。
舒明十一年(639)七月,舒明大王宣布在百济河边同时建造百济宫和百济大寺,并依照劳役的来源地分配劳力,即来自西国的劳役建造宫殿,来自东国的劳役建造寺院。1997年,在吉备池废寺遗址(奈良县樱井市),发现了7世纪的巨大寺院遗迹,学者们推断该遗迹就是百济大寺的所在地。百济大寺是佛教公传以来,由大王建造的第一所寺院,这意味着一直与佛教保持距离的大王开始意欲掌握佛教的宗教权。
百济大寺尚在建设中,舒明十三年(641)十月,舒明大王就离开了人世。翌年(642)正月,王后宝皇女继承王位,成为继推古女王之后的第二位女王,是为皇极女王。即位后的皇极女王继续百济大寺的建造事业。
皇极女王即位后,依旧以苏我虾夷为大臣。《日本书纪》记载,皇极女王即位之年(642),倭国各地大旱,村村“或杀牛马祭诸社神,或频移市,或祷河伯”乞雨,但都不见效果,于是苏我虾夷提出“可於寺寺转读大乘经典,悔过如佛所说,敬而祈雨” 。然而,尽管苏我虾夷亲自烧香发愿,但佛教式请雨法见效甚微,仅仅下了微雨。八月,皇极女王亲自祈雨,在南渊河畔,“跪拜四方,仰天而祈,即雷大雨,遂雨五日” 。在此,成书于8世纪的《日本书纪》的编纂者,运用对比佛教祈雨仪式与传统祭祀祈雨的手法,通过叙述大王祈雨仪式的灵验性,在强调大王的权威性的同时,也为皇极女王披上了一层神秘的色彩。十二月,停置在殡宫一年多的舒明大王棺柩,终于下葬。这表明皇极王权已经度过了新旧王权交替的不稳定时期。
在皇极王权中,苏我虾夷、苏我入鹿父子先后就任大臣之位,具有其他群臣不可相比的权势。皇极元年(642),苏我虾夷父子“尽发举国之民并百八十部曲”,建造双墓,分别是苏我虾夷墓(“大陵”)和苏我入鹿墓(“小陵”),并且动用上宫(厩户皇子)的“乳部之民,役使茔兆所” 。皇极二年(643),苏我虾夷因病不能上朝,私自将大臣之冠(紫冠)传给自己的儿子苏我入鹿,由此苏我入鹿接任大臣位。皇极三年(644),苏我虾夷父子在甘梼冈(位于奈良县明日香村的丘)双双建造住宅,苏我虾夷家称为上宫门,苏我入鹿家称为谷宫门,其子女称为王子。住宅周围作城栅,门旁建兵库,每门都有防火设施,始终派人持兵器守护住宅。此外,苏我虾夷还在另一处建造住宅,“穿池为城,起库储箭”。每当苏我虾夷出入时,经常有50名兵士守卫 。对于苏我虾夷父子的权势,王族中的不少人都积有不满。
另一方面,苏我虾夷父子也在王族中物色王位继承人,以求苏我氏的权势能够不断地延续下去。当时,在具有王位继承资格的诸位皇子中,山背大兄、古人大兄和中大兄三人是最有力的候选者。其中,古人大兄和中大兄都是舒明大王的儿子,古人大兄的母亲是苏我马子之女法提郎媛,而中大兄的母亲是皇极女王。皇极二年(643),苏我入鹿想拥立古人大兄为王位继承人。为了排除山背大兄的势力,苏我入鹿派出将兵围攻山背大兄所在的斑鸠宫,兵力只有数十人的山背大兄一方奋力抵抗。在双方的混战中,山背大兄率领妃妾及子弟趁乱逃出,苏我入鹿军放火烧了斑鸠宫,并误以为山背大兄已葬身火海,遂撤兵退去。躲过一劫的山背大兄初时隐身于山中,但后来不听属下的劝告,下山住进了斑鸠寺。苏我入鹿得知消息后,再次派遣军队包围斑鸠寺,身处绝境的山背大兄及其子女、兄弟姐妹、妃妾被迫无奈一同选择了自尽之路。对于苏我入鹿逼迫山背大兄致死的行为,连他父亲苏我虾夷都嗔骂道:“极甚愚痴,专行暴恶,你之身命不亦殆乎” 。结果被苏我虾夷说中,苏我入鹿最终是身首异处。