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李中梓对中医理论研究十分重视，重视经典，强调《内经》、仲景之书的指导性作用，又兼取众家之长，在学术上兼取张仲景、刘完素、李东垣、朱丹溪各家之长，全面而系统地学习各家的学术经验而不偏执。宗张仲景之学，而将仲景辨证论治的临证思维方法用以指导处置所有疾病的诊治；学刘完素、朱丹溪的学术经验，而不偏执于寒凉；承东垣内伤、外感之论，而重视先后天之气的固护与培补等。李氏一生著作甚多，先后共撰20余种，但由于其著作屡经兵灾，散佚过半，至今仅存9种。
该书是李中梓的首部著作，刊刻于明万历四十六年戊午（1618）。项煜在本书的序文中解释了书名的含义，他说：“颐者，养也。”“夫微非幽隐之谓也。既观其所养，复观其自养，二义尽其蕴矣。”书前共列有77种“采辑书目”，有《素问》《灵枢》《脉经》《东垣十书》《丹溪四书》《河间三书》《伤寒六书》《仲景全书》《证治准绳》《儒门事亲》《本草纲目》《养生主论》等诸多明以前的著名著作。后经门人沈颋（字朗仲）修订、后学吴进（字石虹）、儿子李允恒（字寿臣）校阅，改名为《删补颐生微论》，于崇祯十五年壬午（1642）以《李士材医书二种》本形式刊行于世。本书共四卷，分述三奇（精、气、神）、医家、先天、后天、审象、运气、脏腑、药性、医方、医案等24论。李氏以《内经》为“医学之祖”，故每篇必引述有关篇论作为理论基础。由于李氏壮年学道，晚年参禅，故本书颇多论述养生、气功、按摩、活动调摄法及道家修炼等内容。现存版本有明万历书林叶仰峰刻本、明崇祯十五年（1642）传万堂刻本等数种。
明万历四十七年（1619）李中梓撰写了《药性解》，其在自序中写到编撰此书的初衷：“余以少孤，不及操药以进慈父，间为母氏尝之，退而考诸方书，多所不合，斯用痛心，乃于读书之暇，发《本经》《仙经》暨十四家本草、四子等书，靡不悉究，然后辨阴阳之所属，五行之所宜，著《药性解》二卷。”本书收药323味，分金石、果、谷、木、菜、人、禽兽、虫、鱼九部，各药简述性味、归经、功治，又附作者之“按”，注解药性及提示用药特点，简洁明了，此书为作者早年之作。由于当时尚未见《本草纲目》，故多取金元本草予以辨正。后由姑苏钱允治订补，以李中梓二卷之《药性解》为本，增入《雷公炮炙论》135条文于相应条之后，增为六卷，名为《（镌补）雷公炮制药性解》，于明天启二年（1622）刊刻问世。所引书目有《黄帝素问》《神农本经》《蜀本草》《四声本草》《吴氏本草》《食疗本草》《食性本草》《唐本草余》《药对》《本草性事类》《日华子本草》《证类本草》《药性论》《本草衍义》《南海药膳》《太上玄变经》《三洞要录》《东垣药性》《丹溪药性》等36种。该书现存版本有明天启二年（1622）翁氏刻本、清乾隆十一年（1746）古讲堂刻本、清光绪二十三年（1897）金陵刻本等30余种。
明崇祯十年（1637），十卷刻印问世。李中梓说道：“尝考古之著医书者，汉有七家，唐九倍之，得六十四，宋益以一百九十有七，兼之近代，无虑充栋。然《金匮玉函》之精，而六气之外不详；《天元玉册》之密，而拘方之词多泥。孝忠乱（钱乙）之撰，完素假异人之传；上谷之书久湮，睢水之法偏峻，况其他乎？俚者不堪入目，肤者无能醒心，约者多所挂漏，繁者不胜浏览。盖余究心三十余年，始知合变，而及门者苦于卓也。曩所著《微论》诸书，未尽玄旨。用是不揣鄙陋，篡述是编。颜曰《必读》，为二三于指南。”此书共10卷，是李氏“究心三十余年”始成。卷一为医论及图说，其中医论14篇，详述医学源流及李氏学术思想，图说论述脏腑经络的生理病理。卷二为脉诊、色诊。卷三、卷四为《本草徵要》，论述常用药物350余种，分草、木、果、谷等10类。卷五论伤寒。卷六至卷十论内科杂病35种，对病因、病机、症状、治法、方药均详细论述，均先取《内经》，次采各家名论，并参以己见和医案举例。现存版本有明崇祯十年（1637）刻本、清顺治六年（1649）盛德堂刻本、清康熙二十五年（1686）瀛经堂刻本等60余种。
李中梓认为《内经》乃三坟之一，其内容“上穷天纪，下极地理，远取诸物，近取诸身，更相问难，阐发玄微，垂不朽之弘慈，开生民之寿域。第其理道渊深，文辞古雅，非谙熟精思，鲜有得其解者”，认为从事医学者应勤求精究，故在《医宗必读》卷首即设“读《内经》论”，只有“精深儒典，洞彻玄宗，通于性命之故，达于文章之微，广征医籍，博访先知，思维与问学交参，精气与《灵》《素》相遇，将默通有熊氏于灵兰之室，伯高、少俞对扬问难，究极义理”，才能承担关乎病者性命的神圣使命。李氏从《素问》《灵枢》中精选出临床切用的经文，参考杨上善、王冰、滑寿、张介宾等人的注释，作了必要的校勘和大量的注释工作，又在每章之末，以“愚按”标志加上按语，编成《内经知要》二卷。明崇祯十五年（1642）以《李士材医书二种》形式出版，成为初学者入门读本。全书分为道生、阴阳、色诊、脉象、经络、治则、病能等8篇，基本上体现了中医理论体系的概况。清代薛雪称赞此书说：“惟《内经知要》比余向日所辑《医经原旨》，尤觉近人。以其仅得上下两卷，至简至要，方便时师之不及。用功于鸡声灯影者，亦可以稍有准则于其胸中也。”本书流布甚广，版本繁多，有明末刻本、清乾隆二十九年（1764）扫叶山房刻本等20余种。
对于张仲景的《伤寒论》，李氏参考历代注家，于清顺治二年（1645）撰成《伤寒授珠》十卷。后此书毁于兵火，自嫌其烦，“遂以授珠删繁去复，简邃选玄，仅得十之二……颜曰‘括要’，谓括义详而征词简也。”于清顺治六年（1649）编成《伤寒括要》二卷。李氏撰写此书的宗旨是“仲景《伤寒论》暨《金匮要略》，诚为千古医宗，但文辞简古，义味深玄，非熟读深思，未易明了，不揣肤俚，将以注疏，畅其言外之旨，开其晦蚀之光”。《伤寒括要》为讨论外感病之书，卷上为伤寒总论、各经证治总论、各症总论，扼要阐析了伤寒六经病诸种证候及伤寒诊法；卷下除介绍伤寒部分杂病、风温、湿温、温疟、妇人伤寒等内容外，重点列述六经诸篇方论及霍乱方、杂方。该书现存版本有清顺治六年（1649）刻本、清嘉庆朱陶性活字本等数种。
脉学专著，共二卷，撰于崇祯十五年（1642），是李氏以《内经》《难经》为主，兼采各家之论，以按语或注释形式阐述脉学基本理论及临床应用的著作。其内容包括脉象机制，切脉部位、时间和方法，切脉注意事项，正常脉象，病理脉象以及妇人、小儿脉法等，并以四言歌诀的形式重点论述了28种脉的体象、主病、兼脉、疑似脉如何鉴别等，且均附按语。李氏提出不能过度依赖脉诊，“不问其症之所由起，先与切脉，未免模糊揣度，必不能切中病情者矣”。应望、闻、问、切四者互为参考，并简述望、闻、问三诊。最后附脉法总论，以表里阴阳、气血虚实为纲进行归纳。该书现存版本有清顺治十七年（1660）二雅堂刻本、清扫叶山房石印本等10余种。
药学著作，全书共二卷，多抄辑前人本草，将药物分草、谷、木、采、果、寓木、苞木、虫、鳞、介、禽、兽、人、金石14部，共收药物341种，说明药物的性味、归经、功用、主治、配伍、炮制、煎服法、注意事项、禁忌、辨别药物真伪等，还重点叙述了每种药物的临床应用。李氏还在文中指出了有些医家用药的错误。附食物性鉴赋四首，分析寒凉、温热、平性的食物功用和禁忌，并介绍部分有毒动植物药，以及解毒药物和方法。末附“用药机要”，指出用药要分辨寒热虚实，要因时、因地、因人、因病制宜；指出用药的君臣佐使、配伍、禁忌、七方、十剂、治则、药物气味厚薄和升降浮沉与脏腑的关系，以及药物的炮制、煎服法、剂型等。现存版本有清康熙十七年（1678）吴三桂云南刻本、清善成堂刻本等数种。
内科著作，全书共二卷，分别论述中风、虚劳、噎膈、头痛、狂症等50种内科杂病，每证摘录历代医书，名家名论。结合临床，参以己见，予以阐释发挥。对每种病症的病因、病机、病状、分类、鉴别、治则、治法、急救、预防等均予详论。李氏重视脾肾的学术思想亦充分体现在辨证论治中。现存版本有清康熙十五年（1676）刻本、清宣统二年（1910）石印本等数种。
以上《诊家正眼》三卷、《本草通玄》二卷、《病机沙篆》二卷，经李氏门人尤乘校订，合刊为《士材三书》，于清康熙六年丁未（1667）刊刻行世，末附尤氏辑录的《寿世青编》。现存版本有清康熙六年（1667）刻本、清雍正六年（1728）刻本、清乾隆三十二年（1767）丞德堂刻本等30余种。
一卷，为记载李氏医案的著作，内容皆“摘其朱紫易淆者，聊录一二，以传后世”，由李氏旧交于盘公据李中梓家藏医案抄录，复经其四世孙于升庵将凋落不堪的抄本续全，现存清抄本。
除了上述《医宗必读》《内经知要》《伤寒括要》《删补颐生微论》以及《本草通玄》《诊家正眼》《病机沙篆》《（镌补）雷公炮制药性解》《李中梓医案》这9种医书外，据文献记载，李氏尚著有《医学传心》《外科微论》《外科点化》《医统》《脉鉴》《铜人穴经》《运气考》《内外景图说》《居士传灯录》《道火录》等，但均已亡佚。李氏的这些著作都平易好懂，有裨于初学，故成为后世一般医师带徒或自学中医的教材，流传很广。其中《内经知要》《医宗必读》较集中地反映了李氏的学术思想，在医学普及方面亦有较大贡献。
（《云南中医中药杂志》，2011年第32卷第7期）