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卢之颐，系卢复之子。字子繇（一作子由）、繇生、子萦，初号晋公，又自称芦中人。钱塘（今浙江杭州）人。生于明万历二十七年（1599），而清代学者杭世骏《道古堂集》卷二十九《名医卢之颐传》则认为他“生明熹宗时”（1620—1626），卒于清康熙三年（1664）。《清史稿》卷五百二·列传二百八十九《张志聪传》中有“明末，杭州卢之颐、繇父子著书，讲明医学，志聪继之”句有误，应为同一人，卢之颐之父为卢复。据杭世骏《道古堂文集·名医卢之颐传》载：之颐少时聪慧，博览群书，刻苦钻研，拜师学医，曾向王绍隆学习《内经》、仲景医书，从陈象先学习《薛氏医案》，遂精医术，青年时已善于处方用药。其治病辨证认真入微，每善疗奇疴，有时效如桴鼓，诸前辈亦皆叹服。因当时仕途坎坷，遂潜心研究医理，并专心著述。卢之颐青年时曾著《金匮要略摸象》，其父看后认为不成熟而焚之，并告诫他说：“更十年方许汝著书。”28岁时，卢复殁，卢之颐遵父遗嘱，以《本草纲目博议》为基础，“自丙寅至癸未”，历时18年，撰成《本草乘雅》。后该书不幸为兵火焚毁，卢之颐又凭记忆中的材料重新整理，仅及原稿之半，遂题之为《本草乘雅半偈》，刊行于世。后又用5年时间，注解《伤寒论》，完成《仲景伤寒论疏钞金
》（一名《伤寒金
疏钞》）。后复参《本草》而注《金匮》，以致双目皆朦，而注解《金匮》不及其半，于是从瞑目晏坐中摩索其义，每有所得，便口授其女婿陈曾篁记录，至60岁始成《金匮摩索》九卷（一名《摩索金匮》，今佚）。另撰有《痎疟论疏》，对《内经》之疟论有所发明。卢之颐以所撰著作为讲义，开讲医学，听讲者众，如张志聪、陈胤倩、张天生等，都曾听过他的讲学。《本草乘雅半偈自序》载：“岁在庚午（1630），武林诸君子大集余舍，举仲景两论，及《灵》《素》秘奥，期余一人为之阐发。”开创我国中医教育“讲学”风气，为中医教育以学院讲学形式培养医学人才的先河。卢之颐晚年狂傲偏执，“自矜贵，出入乘轩车从，广座中伸眉抵掌，论议无所忌，识者谓必中奇祸”（《名医卢之颐传》）。其时，明朝南都（即今南京）沦陷，鲁王朱以海监国于绍兴，之颐前往拜谒，得鲁王赏识，授予职方郎。鲁王入闽，他也跟随，后事败归家，重操医务，闭门著书，双目俱盲后瞑目而坐，手摸心想，口授于婿记录其经验体会，后因门庭冷落，最终郁郁寡欢而终。
卢之颐通晓医、儒、佛三家，受“尊经崇古”的思想影响，主要致力于中医经典的研究，对《内经》《伤寒论》和本草做了大量的整理注释工作。卢氏还深研《周易》，并以之与医理互参，著作甚丰，刊行于世有《本草乘雅半偈》《学古诊则》《痎疟论疏》《仲景伤寒论疏钞金
》等，在钱塘医派形成和发展中起到了重要的奠基作用。
卢之颐之父卢复晚年撰《本草纲目博议》，遇有疑义，常由其为之判定，但因卢复病终而该书未成，卢之颐遵嘱续编，前后用了18年时间，在其父《本草纲目博议》的基础上，编成了《本草乘雅半偈》一书。据卢氏自序，该书始作于明天启六年（1626），成书于崇祯十六年（1643），“几历十八春秋，而此书始成”。初成之时，每药分核、参、衍、断四项诠释，古代以四数为“乘”，诠释名物曰“雅”，故名《本草乘雅》。然书未成即逢战乱，即“明年乙酉五月，会有兵变，挈家而逃，流离万状，诸楚备尝。沿至丙戌之十月，始得生还，而家徒四壁，则板帙之零落殆尽可知已”（《本草乘雅半偈》自序）。此后经追忆，“自丙寅至庚午仅得十之二，自庚午至癸酉仅得十之三，而以诵说，故几不能竣事”（同上）。只重写了核、参两项，故易名《本草乘雅半偈》。偈是佛教术语，意译为“颂”，即佛经中的唱词。半偈，意为《本草乘雅》书成后散失，现追忆仅得原书之半，乃名“半偈”。该书约于顺治四年（1647）雕版问世，其中首帙为序及凡例等，释药部分10帙，末附《痎疟论疏》1帙，共计12帙。卢之颐对本草学的研究主要集中体现在《本草乘雅半偈》中，同时也融汇了当时名医探讨本草议论的诸家之见。其内容涉及本草考证、种植、修治、主治阐释诸多方面，可谓十分丰富。编写体例上，主要以每味药作为一个独立的单元进行阐述：先列药名，后附本经条文，再分别按“核”“参”“衍”“断”4项内容进行诠释。《四库全书总目提要》评价它：“考据该洽，辨论亦颇明晰，于诸家药品，甄录颇严。虽辞稍枝蔓，而于本草究为有功。”
《学古诊则》四卷，共40则（又称为段），全书以《内》《难》为中心，兼采仲景之说，又参以己见，阐述脉义、脉法、生理脉象及病理脉象、经络、经穴等。卢氏生前因晚年病瞢，此书并未完稿，第二帙之后即已残缺，后二帙则散乱不整齐，存在重复或引文错误等情况。后经王琦整理，于乾隆三十年（1765）刊印在《医林指月》十二种丛书中。
《痎疟论疏》，一卷，并附《疟疏方》一卷，选方38首，约成书于清顺治十四年（1657）。《四库全书总目提要》云该书：“是书论痎疟证治，于虚、实、寒、热四者最为详尽，足以发明《素问》疟论、刺疟法诸篇微意。”
》
《仲景伤寒论疏钞金
》，又名《伤寒金
疏钞》。十五卷。卷首有郑显题序一篇，原文前冠“论”，注文分“疏”与“钞”。“疏”述原文之大意，“钞”则以问答形式阐发仲景旨意。卢之颐根据《内经》理论阐解《伤寒论》，全书依次为辨六经脉证，辨诸可、诸不可、辨痉湿暍、霍乱、阴阳易、劳复以及辨脉法、平脉法、伤寒序例。杭世骏在《名医卢之颐传》中说此书“医难析疑，遐引曲譬，凡三十余万言。难扁鹊，诮华佗，曲王叔和，驳成无己”。可见卢氏自视甚高，除正面论述外，还力图将《伤寒论》注家中一些违悖《内经》、仲景原文精义的见解，予以订正详辨。
此外，卢之颐精医术而兼博览古文词，还于天启六年（1626）重订《文选纂注》，《文选》为中国现存最早的诗文总集，南朝梁萧统（501—531）编著。《文选纂注》为明代张风翼所撰，是书收录当时在社会上有较大影响力的十二家，如王世贞、刘辰翁、陆树声、张风翼、梅守箕、陈与郊、谭元春、陈继儒等诸家诠释《文选》的评语，对后世的《文选》评点著作产生了较大的影响。
卢之颐通儒信佛，尊经崇古，以佛理、儒理入手阐释药理。在其所著的《本草乘雅半偈》中可见一斑。“偈”为佛经中的唱颂词，通常以四句为一偈。因该书最终只得各药核、参、衍、断四项之半，故易名“半偈”。在对本草注解中大量掺杂了禅宗和儒家的哲学思想，许多药理用佛家的地、水、火、风、空的理论阐释。他对每味药物从其生长状态入手，应用易学象数比类，结合药物五行揭示药物对人体气机的影响。以黄芪为例，“先人云：黄耆一名戴糁、戴椹、百本。戴在首，如卫气出目行头，自上而下，从外而内，百骸百脉，咸卫外而固矣。又云：耆可久可速，能知卫气出入之道路，便能了知黄耆之功用矣。参曰：黄中色。《通志》云：始生为黄，耆，耆宿也。指使不从力役，如人胃居中，营卫气血，筋脉齿发之属，莫不始生于胃，而卫气之呴吸，营血之濡运，筋脉之展摇，齿发之生长，亦莫不从胃指挥宣布。所谓外者，中之使也。营血筋脉悉属有形，统御节制，唯一卫气，所谓卫者，气之帅也。痈疽久败、大风癞疾、五痔鼠瘘，咸无卫气卫外，故肌肉腐烂。黄耆味甘气温，肉似肌腠，皮折如帛，宛如卫气之卫外而固者也。故能温分肉，充皮肤，肥腠理，司开阖。唯卫气虚弱，不能固护肌肉者宜之。尚涉六淫，毒热炽盛，又当谢之，未可谬用。补虚者，补卫气之虚，小儿阴常有余，气常不足，故百病咸宜也。”即辨明了黄芪的性味、生境、植物形态，又阐述了其药理机制，说理较为透彻。
在《学古诊则》中，卢之颐采辑《内经》《难经》《伤寒杂病论》等书有关脉学理论加以归纳整理，并做了系列的研究，重点发挥脉诊与经络原理，对经络学说阐发较详。他在书中序曰：“拙言原疏《杂病论》辨脉首条，未及申之以钞，已满三百余纸，合以后章，繁简不均，恐失仲景先生立论本义，另帙就正有道。其有未尽者，详疏平、辨两脉。而此《诊则》（旅）亦不敢妄骋臆说，惟知进法上古，遵经敷衍，稍备诊家则式，较之中古，各自恃其法者，恐不合时宜。倘不以鄙说为谬，质之《灵》《素》，严加勘驳，则不才（旅）有异时论者，罪戾无遁矣。戊戌中秋后三日，拙稿《金
》灾木苟完，重订讹读句大费安排，故《金匮摩索》先慎之于始，再率子婿曾篁逐字朗诵，按句点较，更简《诊则》，破讹转甚，（旅）不得不扶疾，命曾篁对读，庶得无漏，第此三百纸者，一意就绪，恐难节会，续与曾篁，演说分科，标题格额，俾览者易于寻索，庶不致散漫无稽，而节目有次也。”但卢氏在述古脉法之余，并非完全盲从，亦有自己的观点。如《难经》分三部的具体诊察，其中并无实际的宽度，一般都使用三指诊脉来表示“寸关尺”三部，而卢氏提出以中食两指诊关寸，以中名两指诊关尺新的方法，解决了《难经》以诊阴阳为手段而关则是“阳出阴入”的界限，值得进一步研究。尤其是卢氏认为有关经络学说中涉及“脉动”的内容即是后人失传的古脉法，确有见地。
卢之颐在《学古诊则》中列诊法十则为纲，内容为：度形体以别大小，至数以纪迟数，往来以循滑涩，部位以度长短，举按以验浮沉。以浮、大、数、滑、长为阳，沉、小、迟、涩、短为阴。他说：“至脉状多端，咸凭诊则，名以类从、条分之为目矣。”（第二段言诊则十法）于是将《内经》《难经》《伤寒论》《金匮要略》诸书中有关脉象，以类相从分列于十纲之下，十纲既分，其错综变化就可以了如指掌。所以卢氏谓：“种种诸目，可见单见，可以并呈，可以兼著，可以错显，亦可纲与目交变相见呈著显隐跃于指端者也。虽然巧不在模象之毕肖，而吃紧又在形体、至数、往来、部位、举按之十法，夫如是则不待揣摹，而形真已毕露无遁矣。”（同上）认为掌握了十则的大纲和各脉的目，脉象性质、纲领、分类等都有原则可据，脉象的动态变化就不难弄清，这个见解和方法确实是很精辟的。
评论茶事载录于《本草乘雅半偈》卷七中《茗谱》，不仅按类别摘录了自唐代陆羽《茶经》至明代数十种茶书或其他文献之有关茶事之语句，而且卢氏对每一类茶事现象都有自己的精辟评语与论断。诚如书后附录名士李玄晖的《茗谱题辞》所说：“知子繇之意，正欲先使人涤净烦恼，蠲除心渴，扫却黑暗，远离颠倒，然后如法点瀹，领略瓯牺，两腋生风，岂非羽翰，实以形骸中既空一切，原是轻身换骨之人。茗椀策勋，理实可信。读子繇《茶谱》者，当作如是观”。该书共分为十六编，第一编名“溯源”，是追溯茶之生长和生产之原本；第二编名“得地”，记录茶之生长的适宜土壤与气候；第三编名“乘时”，是有关茶叶采摘的时间；第四编名“揆制”，是记茶叶采制的方法和注意事项；第五编名“藏茗”，是记关于收藏茶叶的方法；第六编名“品泉”，是告诉人们如何选用优质泉水烹茶；第七编名“候火”，第八编“定汤”，第九“点瀹”，第十“辨器”，都是茶著中常见之内容；第十一“申忌”，第十二“防滥”，第十三“戒洧”，第十四“相宜”都是关于种植、采制、烹泡、品赏茶茗时应避免的不良事项；第十五“衡鉴”，第十六“玄赏”均记述品赏茗茶的方法。其中他提出的“茶性如人性”的论断，用人性来与茶性相比，成为品茶界的名言。