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以上所述，已知太阳病为在表的阳热实证，治需以发表剂，使人体达成发汗的机转，把病邪祛除到体外，是最为理想的原因疗法。中医经方家积累了长久的经验，确实掌握了这一治则，其疗效历经考验。纵观仲景治疗太阳病所用方药，多以辛温发汗解热。又太阳病又分中风和伤寒两类证，故治疗时中风证以桂枝汤辛甘温中、健胃生津液调和营卫、解表解热为主；治疗伤寒证以麻黄汤辛温发汗、解表解热为主，并以此两方加减，在《伤寒论》形成了桂枝类、麻黄类两大系列方证，此为《伤寒论》书重要组成部分。
又因痰饮、水湿、瘀血、精气、津液等影响，则临床还常见相应不同的太阳病的合并证。又由疾病的传变，还常见太阳与少阳、阳明等合病、并病。因此，在论述太阳病治疗时，又详述了太阳夹饮、太阳夹血、太阳夹湿、太阳少阳合病、太阳阳明合病、太阳太阴合病等方证。因此，不论何种版本，太阳病篇出现的方证最多。
这里要特别注意的是，张仲景在论述太阳病证治时，特别强调了与温病的鉴别和治疗，惜后世以《内经》释《伤寒论》，不解六经原旨，尤其不解仲景治疗温病方证，因此误认为《伤寒论》专治伤寒，不能治温病。原张仲景把治温病方证散在于六经各篇中，为了便于理解，本书把温病方证集中于阳明病篇讨论。详见“阳明病篇”。
太阳病治疗原则是发汗解表，但论中屡有告诫：不可大发汗，尤其忌用火迫汗；病在表不可下；合并里饮不可单发汗；并强调了发汗的注意事项，须仔细读原文、解读各方证自明。