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国家重点实验室是国家计委从1984年开始组织实施的计划。它主要是在相关的大学和科研院所中，由国家投资，依托已有的科研优势和基础，对原有的实验室装备进行升级与重构。到1986年科学基金委员会成立时已在国家教委和中科院陆续建成70多个国家重点实验室。它实行“开放、联合、流动、竞争”的运行机制，它的出现在稳定基础科学研究、培养杰出学科带头人、改善科研环境与条件以及提高研究水平等方面都发挥了巨大的作用。
1988年国家计委决定利用世界银行第六批贷款“重点学科发展项目”再建设一批国家重点实验室和专业实验室，主要从事应用基础研究。根据世界银行程序先在国家教委和中国科学院组织相关大学、研究所申报并筛选出的200多个备选实验室基础上，再聘请更高层次专家组完成实验室的遴选立项、复审评估工作。鉴于基金委已建立了一支具有权威性、公正性、民主性的专家评审系统，世界银行和国家计委建议由科学基金委员会牵头完成进一步的工作。5月，国家计委科技司秦声涛副司长和马德秀处长约我商谈委托基金委承担实验室遴选立项、复审评估事宜，我当即向委务会议报告。委领导极为重视，先后进行了两次专门研究。当时正处于基金委成立初期，人员少、科学基金项目评审任务重，相当多的同志认为自然科学基金项目评审才是我们的本职工作，其他都是份外的事情，不宜接受实验室遴选与评审的委托任务。而师老力排众议坚持认为：基金委作为全国基础研究资助和管理机构，不仅要评审和资助好的研究项目，还要支持优秀的人才和单位。我们暂时没有能力支持科研装备，但对条件好、又最具科研实力的国家重点实验室理应加强了解和支持，应把国家重点实验室当做资助工作的重点对象。师老还从基金委长远战略发展的角度提出：“必须充分发挥和扩大科学基金专家评审系统的作用，不断开拓新的工作领域。从接受委托评估任务入手，是基金委介入国家重点实验室建设最好的切入点。”最终委务会议决定接受国家重点实验室评估的委托任务，由师老直接领导这批实验室立项复审的评估工作，综合计划局重大项目处负责组织实施。从此我便直接在师老领导下工作，能经常与他在一起，直接聆听他的教诲，学习他的做人，领悟他博大、宽容的心胸。
一个好的实验室，不但要有创新的研究工作和成果，更要有杰出的学科带头人，还要有先进的装备和尖端的方法，以及高效的科学管理。评价一个实验室与评价一个科研项目的标准和方法很不一样，基金委刚介入实验室评估工作时缺乏经验。无论是评审指标体系的建立、评审方法的设计，还是评审专家的遴选，师老都要求我们向有经验的中科院和国家教委学习，还鼓励我们大胆地尝试、积极地探索。许多问题都是在师老的具体指点下解决的。
首先，这批实验室将扩展到工业部门的大专院所，除基础研究前沿学科外，还涉及一些工业部门急需的应用研究的前沿学科。为了组建更权威、更科学、更公正的专家评审组，师老建议除高等院校、中科院的研究所以外，一定要从产业部门和管理部门遴选有经验的专家共同组成专家组。于是在以师老为组长的18位国家计委专家评审组中，就会聚了化工研究院的闵恩泽、机械院的雷天觉、农业科学院的徐冠仁、国防科工委的陈芳允、军事医学科学院的秦伯益先生等一批学术造诣极深、享有崇高威望的科学大家。
其次，由于国家教委和中科院前期筛选提出的备选实验室涉及学科领域广泛，当时对某些新兴学科专业及其实验室尚缺乏足够了解，因此师老建议按不同学科领域把专家分为物理、化学、地学、生物与农学、医药学、材料科学及水电建筑与机械等工程科学技术7个小组，除对申请材料按7个领域进行书面评议排序外，增加了申请材料审核、申请者逐项答辩、实验室现场考查与座谈等环节……这样虽延长了实验室评审的时间，但却对实验室申报材料的真实情况增加了解、去伪存真，有利于保障评审结果的科学与准确。
最后，为了促使实验室研究内容和装备水平与国际接轨，师老努力促成邀请外国科学技术和管理专家共同参与实验室的立项复审和评估工作。这在改革开放的初期要承担极大的风险，涉及国家安全和保密工作，师老领导我们作了大胆的尝试，进行了周密的部署。引进外国专家参与我们的评审工作是一个创举，打破了许多思想认识上的禁忌。1989年春，我们先后3次组织外国科学技术与管理专家赴北京、上海、广州、成都、西安等地现场考察相关实验室。师老以近70岁的高龄率队全程陪同，花费了极大的精力，这种亲历亲为的工作态度感人至深，也打动了一批愿与我们真心合作的外国科学家。曾参与我们实验室考察的在美国国家科学基金会（NSF）工作的Tony Woo教授就致信师老，提出由美国国家科学基金会全额资助我们组织25人的代表团到美国考察机械工程领域。1990年1月，师老亲自率队访问美国，拓展了国际合作。
经过一年的艰苦努力，反复与国家教委、中科院等部门协调，1989年6月终于完成了75个国家重点实验室和59个专业实验室的立项复审，以及随后追加的“中关村地区教育与科研示范网络”（NCFC）的选点立项评估工作。
在师老的领导下，基金委首次介入国家重点实验室遴选评审取得了圆满成功，出色地完成了委托任务，充分发挥和开拓了科学基金专家评审系统的作用，极大提高了基金委的威望和影响，实践证明师老当初坚持的意见是极具战略眼光的。