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第十节
纷乱中的秩序

有些原核生物能够借助鞭毛来游动,也有许多原核生物附着在其他物体表面,一动不动。但这只是表面现象,原核生物细胞里面的分子其实是在做非常激烈的运动的,否则就不会有原核生物的生命。

原核生物细胞里面分子的运动可以用喧嚣来形容。例如,在25摄氏度时,水分子的运动速度高达640米/秒,是波音飞机速度的两倍以上。大一些的分子运动速度要慢一些,但是仍然非常快,像葡萄糖分子的运动速度就是202米/秒,比人百米赛跑的世界纪录还快20倍左右。即使是巨大的蛋白质分子,每秒钟也能跑好几米,在直径1微米的原核细胞中,如果没有其他分子的阻挡,它一秒钟能跑上百万个来回。当然这些分子不是真的这样来回跑,细胞的内容物主要是液体,其中绝大多数是水分子,这些分子密密地挤在一起,它们的运动速度又是如此之快,所以每个分子都以极高的频率和其他的分子相互碰撞。

细胞中的分子为什么要做这么激烈的运动呢?这是因为只有这么激烈的运动,才能使分子能够以足够快的速度运动到所需要的位置。氧分子和二氧化碳分子从细胞外进入细胞内,再达到需要它们的位置;转录因子运动到基因的启动子上,启动基因表达;氨基酸运动到核糖体上,开始蛋白质的合成;核苷酸运动到DNA转录为RNA的地方,开始mRNA的合成;质粒被ParM链推着走,都需要分子移动位置。

在宏观世界,我们要移动一个物体,如搬一块砖,推一辆自行车,是需要花费力气的,要细胞里面的分子移动位置,谁来推它们呢?答案是谁也不需要,分子本身就在动,这就是分子的热运动。温度越高,分子动得越快,所以温度是分子运动激烈程度的量度。

我们平时用来衡量温度的尺度是摄氏温标,是把水沸腾的温度定为100摄氏度,水结冰的温度定为零摄氏度而得到的。但是在零摄氏度,分子仍然在运动,所以摄氏温标并不是衡量分子运动激烈程度的好指标,而把分子停止运动时的温度算作零度,才能更好地反映温度与分子运动激烈程度之间的关系。这样的温标叫作绝对温标,或者叫开氏温标,开氏温标的零度叫作绝对零度,相当于-273.15摄氏度,这时分子的运动完全停止。而常温的25摄氏度,就相当于298.15开。在这样的温度下,分子的运动就会达到上面说的那样激烈的程度。

看到这里,你也许要问:细胞那么小,只有1微米左右,移动这点距离不过是瞬间的事情,需要分子跑那么快吗?就像前面说的,细胞里面并不是空的,而是充满了水,氧分子和葡萄糖分子要移动,就像我们要通过一条挤满了人的大街,这些分子必须通过与水分子不断地碰撞,才能曲曲折折地从浓度比较高的地方移动到浓度比较低的地方,而不能直接跑过去,这个过程叫作分子在水中的扩散。由于有大量水分子的阻挡,分子向某个特定方向净移动的速度是非常慢的。放一勺糖到一杯水中,如果不搅动,过了很长时间上层的水仍然不怎么甜,尽管糖已经完全溶化在下层的水中,说明糖分子在水中的扩散是非常慢的。水分子的尺寸大约是0.282纳米,在1微米的距离上可以排列3546个水分子。葡萄糖分子要在水中移动哪怕1微米的距离,也要面对至少3546个水分子的阻挡。只有在常温下,也就是接近300开,分子才能通过迅速的碰撞移位扩散过那1微米左右的距离,满足生命活动的需要。

例如,大肠杆菌在适宜的条件下,每20分钟就可以繁殖一代。在细胞一分为二之前,它的遗传物质必须进行复制。大肠杆菌的DNA有4639221个碱基对,要在20分钟里复制这个DNA,每秒钟就要复制近4000个碱基对。就算DNA的复制是从一点开始,向两个方向同时进行的,每秒钟也要复制近2000个碱基对,也就是每秒钟必须有近2000个核苷酸通过扩散到达复制位置。由于有4种核苷酸,每次与DNA合成地点碰撞的核苷酸中,只有1/4的机会是正确的核苷酸,这就需要至少每秒8000次的碰撞。在每次碰撞中,分子的方向还是随机的,只有少数具有正确的方向,能够真正参与化学反应,所以核苷酸必须以比每秒8000次高得多的频率去碰撞,才能满足大肠杆菌繁殖的需要。

与DNA的复制相比,蛋白质的合成速度受碰撞频率的影响更大。蛋白质是由20种氨基酸按一定顺序相连而成的。在每次氨基酸与合成中心碰撞时,只有1/20的机会到达的氨基酸是正确的,所以蛋白质的合成速度远比DNA的合成要慢。在大肠杆菌中,核糖体每秒钟只能添加18个氨基酸到新合成的肽链上。如果扩散速度和碰撞概率再低,生命活动就难以维持了。

神奇的是,尽管原核生物的细胞里面是一个喧嚣和纷乱的世界,但是每种分子又都能找到需要与自己结合的分子,并且进行特异的相互作用,一切生命活动也能有条不紊地进行。这主要是由蛋白质分子能辨识和特异结合其他分子而实现的(见本章第二节)。 jwzncc5ds4/oUYE8qzGkEhf6h3BUe2bHxmIrb0gY1eHFXs5nl5o2Wlp6JUyTBB39

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