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以脉来辨别温病中的各证是《温病条辨》脉诊运用的主要特点之一。由于《温病条辨》中将温病分为风温、温热、温疫、温毒、暑温、湿温、秋燥、冬温、温疟九种证，所以，对医者鉴别诊断的要求就更高了；又由于脉诊在鉴别诊断中的独特作用，所以说脉诊技术的高低，是衡量一名中医师的理论修养水平和临床实践能力的试金石。
对于暑温，《温病条辨·上焦篇》第二十二条的描述是：“形似伤寒，但右脉洪大而数，左脉反小于右，口渴甚，面赤，汗大出者，名曰暑温，在手太阴，白虎汤主之。脉芤甚者，白虎加人参汤主之。”从吴氏对其中脉象的辨析中可知：①脉洪大而数，甚则芤，是对伤寒的脉浮紧而言。②独见于右手者，是对伤寒的左脉大而言。右手主上焦气分，且火克金也。暑从上而下，不比伤寒从下而上。③左手主下焦血分，故伤暑之左脉，反小于右。可以看出，脉象在暑温的诊治中起到了鉴别诊断、阐述医理和凭脉处方的作用。
“头痛，微恶寒，面赤烦渴，舌白，脉濡而数者，虽在冬月，犹为太阴伏暑也。”这是《温病条辨·上焦篇》第三十七条对伏暑的定义。从吴氏对此段的辨析里，我们可以体会到：伏暑的头痛恶寒这一点与伤寒是相同的，而面赤烦渴，则可断定其不是伤寒，却与伤寒阳明证非常相似。这样就只有通过脉濡而数，来进行诊断，其理由是：“寒脉紧，风脉缓，暑脉弱，濡则弱之象，弱即濡之体也。”此外，吴氏还用易理对脉进行了剖析：“濡即离中虚，火之象也。紧即坎中满，水之象也。”并强调：“火之性热，水之性寒，象各不同，性则迥异。”吴氏还指出了对伏暑误诊为伤寒的恶果：“何世人悉以伏暑作伤寒治，而用足六经羌葛柴苓，每每杀人哉？象各不同，性则迥异。故曰虽在冬月，定其非伤寒而为伏暑也。”至此，我们已经可以看出，脉象在中医温病的诊断中有着其他诊法无法替代的、关乎人命的重要作用。
《温病条辨·中焦篇》第八十六条曰：“湿温内蕴，夹杂饮食停滞，气不得运，血不得行，遂成滞下，俗名痢疾，古称重证，以其深入脏腑也。”对于湿温这种气不得运、血不得行的重证，吴氏据其脉象反映出的机体正邪相争的状况来判断治疗的难易：①脉小弱者易治，脉实大数者难治。②老年久衰，实大小弱并难治；脉调和者易治。
可见，根据脉象判断预后及治疗的难易，是《温病条辨》脉诊运用的又一个主要特点。